এসএন এলানস্কি, এল.ইউ. কোকাইভা, এন.ভি. স্ট্যাটসাইক, ইউটিটি ডায়াকভ
ভূমিকা
আলু এবং টমেটোর সবচেয়ে অর্থনৈতিকভাবে গুরুত্বপূর্ণ রোগ, দেরী ব্লাইটের কার্যকারক এজেন্ট ওমিসেট ফাইটোফোথোরা ইনফানস্ট্যানস (মন্ট।) দে বারি দেড় শতাব্দীরও বেশি সময় ধরে বিভিন্ন দেশের গবেষকদের ঘনিষ্ঠ দৃষ্টি আকর্ষণ করেছেন। হঠাৎ করে XNUMX শতকের মাঝামাঝি ইউরোপে হাজির হওয়ার ফলে এটি আলু মহামারী সৃষ্টি করেছিল যা বহু প্রজন্মের স্মৃতিতে রয়ে গেছে।
এখন অবধি এটিকে প্রায়শই "আইরিশ ক্ষুধার মাশরুম" বলা হয়। প্রথম মহামারীর প্রায় একশো বছর পরে, দেরিতে ব্লাইড প্রতিরোধী বন্য মেক্সিকান আলুর প্রজাতিগুলি আবিষ্কৃত হয়েছিল, চাষ করা আলু দিয়ে তাদের পারাপারের পদ্ধতিগুলি বিকশিত হয়েছিল (মুলার, 1935) এবং প্রথম দেরিতে ব্লাইট-প্রতিরোধী জাতগুলি প্রাপ্ত হয়েছিল (পুশকেরেভ, 1937)। যাইহোক, তাদের বাণিজ্যিক চাষ শুরু হওয়ার সাথে সাথেই, দেরী ব্লাইট প্যাথোজেনগুলির প্রতিযোগিতা যা প্রতিরোধী জাতগুলিতে সংক্রামক ছিল। এবং বন্য মেক্সিকান আলু থেকে জাতগুলিতে নতুন প্রতিরোধের জিনের প্রবর্তন দ্রুত কার্যকারিতা হারাতে শুরু করে।
মনোজেনিক (উল্লম্ব) প্রতিরোধের ব্যবহারে ব্যর্থতা প্রজননকারীদের ননস্পেসিফিক পলিজেনিক (অনুভূমিক) প্রতিরোধের শোষণের আরও জটিল উপায়গুলি সন্ধান করতে বাধ্য করে। সাম্প্রতিক বছরগুলিতে, অত্যন্ত আক্রমণাত্মক দৌড় পরজীবীর স্বতন্ত্র জনগোষ্ঠীতে জমে উঠতে শুরু করেছে, এমনকি অনর্থক প্রতিরোধের ক্ষয় ঘটায়। ছত্রাকনাশক-প্রতিরোধী স্ট্রেনের উদ্ভাবন আলু সুরক্ষা রাসায়নিকগুলির ব্যবহারে সমস্যা সৃষ্টি করেছে।
রাসায়নিক সংমিশ্রণে আলট্রস্ট্রাকচার এবং বিপাকের মধ্যে ওমিসাইট এবং ছত্রাকের মধ্যে উল্লেখযোগ্য পার্থক্যের কারণে, ছত্রাকনাশক বিশেষত পদ্ধতিগতগুলি, গাছগুলিকে অনেকগুলি ছত্রাকজনিত রোগ থেকে রক্ষা করতে ব্যবহৃত হয়, ওমিসাইটের বিরুদ্ধে অকার্যকর হয়।
অতএব, দেরিতে ব্লাইটের বিরুদ্ধে রাসায়নিক সুরক্ষায় একাধিক (মরসুমে 12 বার বা তারও বেশি সময় পর্যন্ত) স্প্রে করার জন্য বিস্তৃত কর্মের যোগাযোগের প্রস্তুতি ব্যবহার করা হয়েছিল। একটি বৈপ্লবিক পদক্ষেপ ছিল ফেনিলামাইডগুলির ব্যবহার, যা ওমাইসেটের পক্ষে বিষাক্ত এবং উদ্ভিদে পদ্ধতিগতভাবে ছড়িয়ে পড়ে। যাইহোক, তাদের ব্যাপক ব্যবহারের ফলে দ্রুত ছত্রাক জনসংখ্যার (ডেভিডস এট আল।, 1981) প্রতিরোধী স্ট্রেনগুলি জমে যায়, যা উদ্ভিদ সুরক্ষা উল্লেখযোগ্যভাবে জটিল করে তোলে। পি। ইনফ্যান্ট্যানস কার্যত তাত্পর্যপূর্ণ অঞ্চলের একমাত্র পরজীবী, জৈব চাষে যে ক্ষয় থেকে রাসায়নিক সংরক্ষণের উপায় না ব্যবহার করে নিরপেক্ষ করা যায় না (ভ্যান ব্রুগেন, 1995)।
উপরেরগুলি বিভিন্ন দেশ থেকে গবেষকরা পি। ইনফেস্টানস জনসংখ্যা, তাদের প্রাচুর্য এবং জেনেটিক গঠনের গতিবিদ্যা, পাশাপাশি পরিবর্তনশীলতার জেনেটিক প্রক্রিয়াগুলির অধ্যয়নের জন্য যে মনোযোগ দিয়েছে তা ব্যাখ্যা করে।
আর। ইনফেসটান্সের জীবনচক্র
ওমিসেট ফাইটোফোথোরা ইনফেষ্টানস আলুর পাতার অভ্যন্তরে হাউসটোরিয়া সহ একটি আন্তঃকোষীয় মাইসেলিয়াম বিকাশ করে। পাতার টিস্যুগুলিকে খাওয়ানো, এটি গা dark় দাগ সৃষ্টি করে, যা কালো এবং ভেজা আবহাওয়ায় পচে যায়। একটি শক্তিশালী পরাজয়ের সাথে, পুরো পাতা মারা যায়। খাওয়ানোর একটি সময় পরে, মাইসেলিয়াম - স্পোরঞ্জিওফোরস - যা স্টোমাটার মাধ্যমে বাহ্যিকভাবে বৃদ্ধি পায় উপর আউটগ্রোথ গঠিত হয়। ভেজা আবহাওয়ায় এগুলি পাতার নীচে দাগের চারপাশে একটি সাদা ফুল ফোটে। স্পোরঞ্জিওফোরগুলির শেষে, লেবু-আকৃতির চিড়িয়াখানা তৈরি হয়, যা ভেঙে যায় এবং বৃষ্টির স্প্রে দ্বারা বহন করা হয় (চিত্র 1)। আলু পাতার পৃষ্ঠের ফোটা জলের মধ্যে পড়ে, স্পোরানগিয়া 6-8 চিড়িয়াখানার সাথে অঙ্কুরিত হয়, যা কিছু সময় চলার পরে গোলাকার হয়ে যায়, একটি শেল দিয়ে coveredাকা থাকে এবং জীবাণু নলের সাথে অঙ্কুরিত হয়। অঙ্কুর স্টোমাটা দিয়ে পাতার টিস্যুতে প্রবেশ করে। কিছু কিছু শর্তে স্প্রারাঙ্গিয়া গ্রোথ টিউবে সরাসরি পাতার টিস্যুতে বৃদ্ধি পেতে পারে। অনুকূল পরিস্থিতিতে, সংক্রমণ থেকে নতুন স্পরুলেশন গঠনের সময় মাত্র 3-4 দিন।
একবার মাটিতে এবং মাটি দিয়ে ফিল্টার করা হলে স্পোরাঙ্গিয়া কন্দগুলি সংক্রামিত করতে সক্ষম। মারাত্মকভাবে প্রভাবিত কন্দগুলি সংগ্রহের সময় পচে যায়; দুর্বলভাবে প্রভাবিত, সংক্রমণ পরবর্তী মরসুম পর্যন্ত অবিরত থাকতে পারে। এছাড়াও, দেরী ব্লাইটির কার্যকারক এজেন্ট শীতকালে গাছের ধ্বংসাবশেষে এবং টমেটো বীজের জমিতে oospores (ঘন প্রাচীরযুক্ত বিশ্রামযুক্ত যৌন বীজ) আকারে শীততে থাকতে পারে। জীবন্ত উদ্ভিদের অঙ্গগুলির উপর ওসপোরগুলি গঠিত হয় যখন বিভিন্ন মিলনের ধরণের প্রকারগুলি অতিরিক্ত আর্দ্রতার সাথে মিলিত হয়। বসন্তে, উদ্ভিদ সংক্রামিত কন্দ এবং গাছের অবশিষ্টাংশগুলিতে অজস্র স্পোরুলেশন গঠিত হয়; চিড়িয়াখানায় মাটিতে প্রবেশ করে গাছের নীচের পাতাগুলির সংক্রমণ ঘটে। কিছু ক্ষেত্রে, মাইসেলিয়াম গাছের সবুজ অংশ বরাবর সংক্রামিত কন্দ থেকে বৃদ্ধি পেতে পারে এবং সাধারণত কান্ডের উপরের অংশে প্রদর্শিত হতে পারে।
ওমিসাইট এবং বেশিরভাগ ছত্রাকের মধ্যে একটি উল্লেখযোগ্য পার্থক্য গেম্যাটিক মায়োসিস এবং জাইগোটেসের অঙ্কুরোদগম (oospores) হ্রাসকারী পারমাণবিক বিচ্ছেদ ব্যতীত তাদের জীবনচক্রের ডিপ্লোফেসের প্রাধান্যের মধ্যে রয়েছে। দ্বৈতত্বের প্রতিস্থাপনের পাশাপাশি এই বৈশিষ্ট্যটি আরও দ্বিপাক্ষিক হিটারোটালিজম, উচ্চ ইউক্যারিওটসের জনসংখ্যার (প্যানমিক্সিয়া বিশ্লেষণ এবং জনসংখ্যার উপ-বিভাগ, অন্তঃ- এবং আন্তঃ জনসংযোগ প্রবাহ ইত্যাদি) অধ্যয়ন করার জন্য তৈরি পদ্ধতির ক্ষেত্রে প্রয়োগ করা সম্ভব বলে মনে হয়। যাইহোক, পি। ইনফেষ্টানস জনসংখ্যা অধ্যয়ন করার সময় তিনটি কারণ এই পন্থাগুলি পুরোপুরি স্থানান্তর করতে দেয় না।
১. হাইব্রিড ওসপোরের সাথে সাথে স্ব-উর্বর এবং পার্থেনোজেনেটিক ওসপোরগুলি জনসংখ্যায় গঠিত হয় (ফিফ এবং শ, 1; আনিকিনা এট আল। পরীক্ষার ফলাফলের উপর।
২. পি। ইনফেষ্টানসে যৌন প্রক্রিয়া জনসংখ্যার আকারের গতিবেগের ক্ষেত্রে একটি তাত্পর্যপূর্ণ অবদান রাখে, কারণ ছত্রাকটি মূলত উদ্ভিজ্জ বীজ দ্বারা পুনরুত্পাদন করে, পুষ্টির মধ্য দিয়ে traditionalতিহ্যবাহী পদ্ধতির দ্বারা সঙ্গমের ধরণের বিশ্লেষণের 2% এরও বেশি ফলাফল তৈরি করে ... ক্রমবর্ধমান seasonতু হ'ল বিভিন্ন প্রজন্মের অলিঙ্গাত্মক স্পোরুলেশনের (পলিসাইক্লিক রোগ বিকাশ)। যখন সবুজ গাছপালা নেই (শীতকালে) এবং চারাগুলির প্রাথমিক সংক্রমণের সময় জীবজন্তু সংরক্ষণের জন্য ওসপোরসগুলি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। তারপরে, গ্রীষ্মের সময়, ক্লোনাল প্রজনন ঘটে এবং বিপরীতক্রমে যৌন পুনঃসংযোগের ফলে উদ্ভূত পৃথক ক্লোনগুলির সংখ্যা হ্রাস পায় যা মূলত আরও অভিযোজিত নির্বাচনের দ্বারা নির্ধারিত হয়। সুতরাং, এপিফাইটিকসের শুরু এবং শেষে জনসংখ্যার পৃথক ক্লোনগুলির অনুপাত সম্পূর্ণ আলাদা হতে পারে।
৩. বর্ণিত চক্রটি তাদের জন্মভূমি মধ্য আমেরিকার পি। ইনফেষ্টানসের স্থানীয় জনগোষ্ঠীর বৈশিষ্ট্য। বিশ্বের অন্যান্য অঞ্চলে, যৌন প্রক্রিয়াটি 3 বছরেরও বেশি সময় ধরে জানা ছিল না; সংক্রামিত আলুর কন্দগুলিতে উদ্ভিদ মাইসেলিয়াম ছিল শীতের পর্যায়। জীবনচক্রটি সম্পূর্ণরূপে গতিময় ছিল, এবং এর বিস্তারটি প্রকৃতিতে কেন্দ্রবিন্দু ছিল: একক সংক্রামিত রোপিত কন্দ থেকে সংক্রমণটি পাতাগুলিতে চলে যায়, রোগের প্রাথমিক কেন্দ্রবিন্দু তৈরি করে, যা রোগের ব্যাপক বিকাশের সময় সংশ্লেষ করতে পারে।
সুতরাং, কিছু অঞ্চলে যৌন এবং যৌন-চক্রের বিকল্প হতে পারে, আবার অন্যদের মধ্যে - কেবল নমনীয় চক্র।
পি। ইনফস্টানসের উত্স
পি। ইনফেষ্টানরা 1991 শতকের প্রথমার্ধের শেষে ইউরোপে হাজির হয়েছিল। আলু যেহেতু দক্ষিণ আমেরিকার উত্তর-পূর্বাঞ্চলের স্থানীয়, তাই ধারণা করা হয়েছিল যে চিলির সল্টপেটারের উত্থানের সময় এই পরজীবীটি সেখান থেকে ইউরোপে আনা হয়েছিল। তবে মেক্সিকো টোলুকা উপত্যকার রকফেলার সেন্টার আলু স্টেশনে করা গবেষণা এই দৃষ্টিভঙ্গিটি সংশোধন করতে বাধ্য করেছিল (নিডারহাউজার ১৯৯১, ১৯৯৩)।
১. টলুকা উপত্যকায়, স্থানীয় যক্ষ্ম আলু প্রজাতির (সোলানাম ডেমিসাম, এস। বাল্বোকাস্ট্যানাম ইত্যাদি) উচ্চতর স্তরের সংবেদনশীল প্রতিরোধের সাথে মিলিত উল্লম্ব প্রতিরোধের জন্য জিনের বিভিন্ন সেট রয়েছে, যা পরজীবীর সাথে দীর্ঘ সহ-বিবর্তনকে নির্দেশ করে। ফসল আলু সহ দক্ষিণ আমেরিকার প্রজাতিগুলিতে প্রতিরোধের জিনের ঘাটতি রয়েছে।
২. টলুকা উপত্যকায়, A2 এবং A1 এর সঙ্গমের ধরণের বিচ্ছিন্ন বিচ্ছিন্নতা রয়েছে যার ফলস্বরূপ পি। ইনফেষ্টানসের আন্তঃ জনসংখ্যা বিস্তৃত; দক্ষিণ আমেরিকার চাষ করা আলুর স্বদেশে, পরজীবী ক্লোনালিভাবে ছড়িয়ে পড়ে।
৩. টলুকা উপত্যকায় বার্ষিক দুর্যোগের মারাত্মক মহামারী দেখা দেয়। সুতরাং, উত্তর আমেরিকার গবেষকদের মধ্যে (কর্নেল বিশ্ববিদ্যালয়) আলু ফাইটোফোথোরার জন্মস্থান হিসাবে মেসোয়ামেরিকা (মধ্য আমেরিকা) সম্পর্কে মতামত প্রতিষ্ঠিত হয়েছে (গুডউইন এট আল।, 3)।
দক্ষিণ আমেরিকার গবেষকরা এই মতামতটি ভাগ করেন না। তারা বিশ্বাস করে যে চাষ করা আলু এবং এর পরজীবী পি। ইনফেষ্টানদের একটি সাধারণ জন্মভূমি রয়েছে - দক্ষিণ আমেরিকান অ্যান্ডেস। তারা মাইটোকন্ড্রিয়াল জিনোম (এমটিডিএনএ) এবং পারমাণবিক জিন আরএএস এবং β-টিউবুলিন (গোমেজ-আলপিজার এট আল।, ২০০)) এর ডিএনএ পলিমর্ফিজমের বিশ্লেষণে আণবিক অধ্যয়নের মাধ্যমে তাদের দৃষ্টিভঙ্গি সমর্থন করেছিলেন। তারা দেখিয়েছিল যে বিশ্বের বিভিন্ন স্থান থেকে সংগৃহীত স্ট্রেনগুলি তিনটি বিচ্ছিন্ন পৈত্রিক লাইন থেকে নেমে এসেছে যা (তিনটি) দক্ষিণ আমেরিকার অ্যান্ডিসে পাওয়া যায়। অ্যান্ডিয়ান হ্যাপ্লোটাইপস দুটি লাইনের বংশধর: প্রাচীনতম এমটিডিএনএ বংশের বিচ্ছিন্নতা ইকুয়েডরের অ্যানারাহিকোমেনাম বিভাগ থেকে বন্য-বর্ধমান সোলানাসেই পাওয়া যায়, তবে দ্বিতীয় লাইনের বিচ্ছিন্নতা আলু, টমেটো এবং বুনো নাইটশেডগুলিতে সাধারণ। টলুকাতে, এমনকি বিরল হ্যাপ্লোটাইপগুলি কেবলমাত্র একটি বংশ থেকে অবতীর্ণ হয়, সাথে টলুকা স্ট্রেনের জেনেটিক পরিবর্তনশীলতা (কিছু ভেরিয়েবল সাইটের কম অ্যালালিক ফ্রিকোয়েন্সি) সাম্প্রতিক প্রবাহের কারণে শক্তিশালী প্রতিষ্ঠাতা প্রভাব নির্দেশ করে।
এছাড়াও, পি। ইনফেসট্যান্সের মতো মরফোলজিকাল এবং জিনগতভাবে অনুরূপ অ্যান্ডিসে একটি নতুন প্রজাতি পি অ্যান্ডিনা পাওয়া গিয়েছিল, যা লেখকদের মতে, ফাইটোফোথোরা জেনাসে স্প্যানিশ স্পেস হিসাবে আন্ডিজকে নির্দেশ করেছেন। অবশেষে, ইউরোপ এবং মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে, পি। ইনফেষ্টানস জনসংখ্যার মধ্যে উভয়ই আন্দিয়ানের বংশকে অন্তর্ভুক্ত করেছে, যদিও টলুকার মধ্যে একটি মাত্র।
এই প্রকাশনাটি বিভিন্ন দেশ থেকে গবেষকদের একদল প্রতিক্রিয়া জানায় যারা পূর্ববর্তী গবেষণাকে সংশোধন করতে প্রচুর পরীক্ষামূলক কাজ করেছিল (গস এট আল।, ২০১৪)। এই কাজে প্রথমত, ডিএনএ পলিমॉर्ফিজমগুলি অধ্যয়নের জন্য আরও তথ্যবহুল মাইক্রোসেটেল ডিএনএ সিকোয়েন্স ব্যবহার করা হয়েছিল; দ্বিতীয়ত, ক্লাস্টারিং, মাইগ্রেশন পাথ, জনসংখ্যার বিচরণের সময় ইত্যাদি বিশ্লেষণের জন্য আরও উন্নত মডেল ব্যবহার করা হত (এফ-পরিসংখ্যান, বয়েসিয়ান আনুমানিকতা ইত্যাদি) এবং তৃতীয়ত, কেবলমাত্র একটি আন্দিয়ান প্রজাতি পি। অ্যান্ডিনার সাথেই তুলনা ব্যবহৃত হত না, যেখানে একটি হাইব্রিড প্রকৃতি প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল (পি। ইনফেষ্টানস এক্স ফাইটোফোথোরা এসপি।) তবে মেক্সিকান স্থানীয় প্রজাতি পি। মীরাবিলিস, পি। ইপোমোয়াই এবং ফাইটোফোথোরা ফেজোলিও, যা জেনেটিকভাবে নিকটতম পি। ইনফেষ্টানস একই ক্লাডে অন্তর্ভুক্ত রয়েছে (ক্রুন এট আল।, ২০১২)। এই বিশ্লেষণগুলির ফলস্বরূপ, এটি নির্বিঘ্নভাবে দেখানো হয়েছিল যে হাইব্রিড পি। অ্যান্ডিনা ব্যতীত ফাইটোফোথোরা জেনাসের সমস্ত প্রজাতির ফাইলোজেনেটিক গাছের মূল অংশটি মেক্সিকান স্ট্রেনের অন্তর্গত, এবং অভিবাসন প্রবাহটি দিকটি মেক্সিকো - অ্যান্ডিসের সাথে দেখা যায় না, এবং এর শুরুটি ইউরোপীয়দের সাথে মিলে যায় নতুন বিশ্বের উপনিবেশকরণ (2014-2012 বছর আগে)। সুতরাং, আলুর পরাজয়ের জন্য বিশেষী পি। ইনফেষ্টান প্রজাতির উত্থানটি টিউবারাস সোলানাসেই গঠনের গৌণ জেনেটিক সেন্টারে ঘটেছিল, অর্থাৎ। মধ্য আমেরিকা।
জেনোম অফ পি। ইনফেসটান্স
২০০৯ সালে, বিজ্ঞানীদের একটি আন্তর্জাতিক দল সম্পূর্ণ পি ইনফেসট্যান্স জিনোম (হাশ এট আল, ২০০৯) সিকোয়েন্সড করেছিল, যার আকার ছিল 2009 এমবি। এটি ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত প্রজাতিগুলির তুলনায় কয়েকগুণ বেশি, পি। সোজা (2009 এমবি), যা সয়াবিনের মূলের পচা সৃষ্টি করে এবং পি। রামোরাম (240 এমবি), ওক, বিচ এবং কিছু অন্যান্য জাতীয় মূল্যবান গাছের প্রজাতিগুলিকে প্রভাবিত করে। প্রাপ্ত তথ্য থেকে দেখা গেছে যে জিনোমে প্রচুর সংখ্যক পুনরাবৃত্তি ক্রমের কপি রয়েছে - 95৪%। জিনোমে 65 প্রোটিন-কোডিং জিন রয়েছে, যার বেশিরভাগ অংশ জিনগুলি সেলুলার প্রসেসগুলিতে জড়িত, যার মধ্যে ডিএনএ প্রতিলিপি, প্রতিলিপি এবং প্রোটিনের অনুবাদ রয়েছে।
ফাইটোফোথোরা জেনোমের জিনোমের তুলনা করে জিনোমের একটি অস্বাভাবিক সংগঠন প্রকাশিত হয়েছিল, এতে জিনের ঘনত্ব তুলনামূলকভাবে বেশি এবং বারবার সিকোয়েন্সগুলির উপাদান তুলনামূলকভাবে কম, এবং স্বল্প জিনের ঘনত্ব এবং পুনরাবৃত্ত অঞ্চলগুলির একটি উচ্চ সামগ্রীর সাথে পৃথক অঞ্চলগুলি সংরক্ষিত জিনগুলির ক্রমগুলির অন্তর্ভুক্ত। সমস্ত পি। ইনফেষ্টান প্রোটিন-কোডিং জিনের 70% (12440) রক্ষণশীল ব্লকগুলির অ্যাকাউন্ট। রক্ষণশীল ব্লকের মধ্যে, জিনগুলি সাধারণত closely০৪ বিপি-র গড় আন্তঃজৌনিক দূরত্বের সাথে খুব কাছাকাছি অবস্থান করে। রক্ষণশীল ব্লকের মধ্যবর্তী অঞ্চলে, পুনরাবৃত্তিকারী উপাদানগুলির ঘনত্ব বৃদ্ধির কারণে আন্তঃজাগতিক দূরত্ব বেশি (604 বিপি) হয়। দ্রুত বিকশিত ইফেক্টর গোপনীয় জিনগুলি জিন-দরিদ্র অঞ্চলে অবস্থিত।
পি। ইনফেষ্টান জিনোমের সিকোয়েন্স বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে জিনোমের প্রায় এক তৃতীয়াংশ স্থানান্তরযোগ্য উপাদানগুলির অন্তর্ভুক্ত। পি। ইনফেষ্টানসের জিনোমে অন্যান্য পরিচিত জিনোমের চেয়ে ট্রান্সপোসনের বিভিন্ন পরিবার রয়েছে। পি। ইনফ্যান্ট্যান্সের বেশিরভাগ ট্রান্সপনার জিপসি পরিবারের অন্তর্ভুক্ত।
রোগজীবাণুতে জড়িত বিপুল সংখ্যক নির্দিষ্ট জিন পরিবারকে পি। ইনফেসট্যান্স জিনোমে সনাক্ত করা হয়েছে। তাদের একটি উল্লেখযোগ্য অংশ এফেক্টর প্রোটিনগুলি এনকোড করে যা হোস্ট প্ল্যান্টের ফিজিওলজি পরিবর্তন করে এবং এর সংক্রমণে অবদান রাখে। এগুলি দুটি বিস্তৃত বিভাগে পড়ে: অ্যাপোপ্লাস্টিক এফেক্টর, যা আন্তঃকোষীয় স্থানগুলিতে কাজ করে (অ্যাপোপ্লাস্ট), এবং সাইটোপ্লাজমিক এফেক্টর, যা হাউস্টোরিয়ার মাধ্যমে কোষগুলিতে প্রবেশ করে। এপোপ্লাস্টিক এফেক্টরগুলির মধ্যে লুকানো হাইড্রোলাইটিক এনজাইম যেমন প্রোটেস, লিপ্যাস এবং গ্লাইকোসিলাস অন্তর্ভুক্ত যা উদ্ভিদের কোষ ধ্বংস করে; হোস্ট প্ল্যান্ট প্রতিরক্ষা এনজাইমগুলির বাধা এবং নেপ্রোটাইজিং টক্সিন যেমন নেপ 1-এর মতো প্রোটিন (এনপিএলস) এবং পিসিএফ-জাতীয় ছোট সিস্টেস্টিন সমৃদ্ধ প্রোটিন (এসসিআর)।
পি। ইনফেষ্টানস ইফেক্টর জিনগুলি ননপ্যাথোজেনিক জিনগুলির চেয়ে অনেকগুলি এবং সাধারণত বড়। সর্বাধিক পরিচিত হলেন সাইটোপ্লাজমিক প্রভাবকগুলি আরএক্সএলআর এবং ক্রিংকলার (সিএনআর)। ওমোসাইটের সাধারণ সাইটোপ্লাজমিক প্রভাবক হলেন আরএক্সএলআর প্রোটিন। এখনও অবধি আবিষ্কৃত সমস্ত আরএক্সএলআর ইফেক্টর জিনগুলিতে অ্যামিনো-টার্মিনাল গ্রুপ আরগ-এক্সএলিউ-আরগ রয়েছে, যেখানে এক্স একটি এমিনো অ্যাসিড। সমীক্ষার ফলস্বরূপ, এটি পরামর্শ দেওয়া হয়েছিল যে পি ইনফেষ্টান জিনোমে 563 আরএক্সএলআর জিন রয়েছে, যা পি। সোজা এবং পি। রমরমের তুলনায় 60% বেশি। পি। ইনফেষ্টান জিনোমের প্রায় অর্ধেক আরএক্সএলআর জিন প্রজাতি-নির্দিষ্ট। আরএক্সএলআর ইফেক্টরগুলির বিভিন্ন সিকোয়েন্স রয়েছে। এর মধ্যে একটি বড় এবং দেড়শটি ছোট পরিবার চিহ্নিত করা হয়েছিল। মূল প্রোটোমের বিপরীতে, আরএক্সএলআর ইফেক্টর জিনগুলি সাধারণত জিনমের দরিদ্র এবং পুনরাবৃত্তি সমৃদ্ধ অঞ্চলে থাকে। এই অঞ্চলের গতিশীলতা নির্ধারণকারী মোবাইল উপাদানগুলি এই জিনগুলিতে পুনরায় সমন্বয়কে উত্সাহ দেয়।
সাইটোপ্লাজমিক সিআরএন প্রভাবকগুলি মূলত পি। ইনফেষ্টানস ট্রান্সক্রিপ্টগুলিতে এনকোডিং পেপটাইডগুলিতে উদ্ভিদের টিস্যু নেক্রোসিসকে প্ররোচিত করে সনাক্ত করা হয়েছিল। তাদের আবিষ্কারের পর থেকে এই প্রভাবশালী পরিবারগুলির সম্পর্কে খুব কমই জানা যায়। পি। ইনফেষ্টানস জিনোমের বিশ্লেষণে 196 সিআরএন জিনের একটি বিশাল পরিবার প্রকাশ পেয়েছে, যা পি। সোজা (100 সিআরএন) এবং পি। রমরম (19 সিআরএন) এর তুলনায় উল্লেখযোগ্য পরিমাণে বড়। আরএক্সএলআর মতো, সিআরএনগুলি মডিউলার প্রোটিন এবং এটি একটি উচ্চ সংরক্ষিত এন-টার্মিনাল এলএফএলএক ডোমেন (50 অ্যামিনো অ্যাসিড) এবং বিভিন্ন জিনযুক্ত একটি সংলগ্ন ডিডাব্লুএল ডোমেন নিয়ে গঠিত। বেশিরভাগ সিআরএন (%০%) সিগন্যাল পেপটাইড ধারণ করে।
হোস্ট প্লান্টের সেলুলার প্রক্রিয়াগুলিকে ব্যাহত করার জন্য বিভিন্ন সিআরএন সম্ভাব্যতা অধ্যয়ন করা হয়েছে। উদ্ভিদ নেক্রোসিস বিশ্লেষণ করার সময়, সিআরএন 2 প্রোটিনগুলি অপসারণের ফলে 234 অ্যামিনো অ্যাসিড (অবস্থান 173-407, ডিএক্সজি ডোমেন) নিয়ে গঠিত সি-টার্মিনাল অঞ্চল চিহ্নিত করা সম্ভব হয়েছিল এবং কোষের মৃত্যুর কারণ হয়েছিল। পি। ইনফেষ্টানস সিআরএন জিনগুলির বিশ্লেষণে চারটি পৃথক সি-টার্মিনাল অঞ্চল প্রকাশিত হয়েছিল, যা গাছের অভ্যন্তরে কোষের মৃত্যুর কারণও হয়। এর মধ্যে নতুন চিহ্নিত ডিসি ডোমেন (পি। ইনফেসট্যান্সের 18 টি জিন এবং 49 টি সিউডোজেন রয়েছে), পাশাপাশি ডি 2 (14 এবং 43) এবং ডিবিএফ (2 এবং 1) ডোমেনগুলি প্রোটিন কাইনাসগুলির মতো। একটি উদ্ভিদে প্রকাশিত সিআরএন ডোমেনগুলির প্রোটিনগুলি একটি উদ্ভিদ কোষে (সিগন্যাল পেপটাইডগুলির অভাবে) সংরক্ষণ করা হয় এবং অন্তঃকোষীয় প্রক্রিয়া দ্বারা কোষের মৃত্যুকে উদ্দীপিত করে। সিআরএন ডোমেন যুক্ত আরও 255 টি সিকোয়েন্স সম্ভবত জিন হিসাবে কাজ করে না।
আরএক্সএলআর এবং সিআরএন ইফেক্টর জিন পরিবারের সংখ্যা ও আকার বৃদ্ধি সম্ভবত অ-অ্যালালিক হোমোলজাস পুনঃসংযোগ এবং জিনের সদৃশতার কারণে হয়েছিল। জিনোমে প্রচুর পরিমাণে সক্রিয় মোবাইল উপাদান রয়েছে তা সত্ত্বেও এখনও ইফেক্টর জিন স্থানান্তরিত হওয়ার সরাসরি কোনও প্রমাণ পাওয়া যায়নি।
জনসংখ্যা কাঠামো অধ্যয়নের জন্য ব্যবহৃত পদ্ধতিগুলি
জনসংখ্যার জেনেটিক কাঠামোর অধ্যয়ন বর্তমানে এর উপাদানগুলির খাঁটি সংস্কৃতির বিশ্লেষণের ভিত্তিতে। খাঁটি ফসলকে বিচ্ছিন্ন না করে জনসংখ্যা বিশ্লেষণও নির্দিষ্ট উদ্দেশ্যে করা হয় যেমন উদাহরণস্বরূপ, জনসংখ্যার আগ্রাসন অধ্যয়ন বা এর মধ্যে ছত্রাকজনিত প্রতিরোধী স্ট্রেনের উপস্থিতি অধ্যয়ন করা (ফিলিপোভ এট আল।, 2004; ডেরেভিগিনা এট আল। 1999)। এই ধরণের গবেষণায় বিশেষ পদ্ধতিগুলির ব্যবহার জড়িত, যার বিবরণ এই পর্যালোচনার সুযোগের বাইরে। স্ট্রেনের তুলনামূলক বিশ্লেষণের জন্য, ডিএনএ কাঠামোর বিশ্লেষণ এবং ফেনোটাইপিক প্রকাশগুলির অধ্যয়নের উপর ভিত্তি করে প্রচুর পদ্ধতি ব্যবহার করা হয়। জনসংখ্যার তুলনামূলক বিশ্লেষণকে বিপুল সংখ্যক বিচ্ছিন্নতার সাথে মোকাবিলা করতে হয়, যা ব্যবহৃত পদ্ধতিগুলিতে নির্দিষ্ট প্রয়োজনীয়তা আরোপ করে। আদর্শভাবে, তাদের নিম্নলিখিত প্রয়োজনীয়তাগুলি পূরণ করা উচিত (কুক, লিস, 2004, মেলার, ওল্ফেনবার্গার, 1999):
- সস্তা, বাস্তবায়নে সহজ, উল্লেখযোগ্য সময় ব্যয় প্রয়োজন হবে না, সাধারণত উপলভ্য প্রযুক্তির উপর নির্ভর করে (উদাহরণস্বরূপ, পিসিআর);
- পর্যাপ্ত পরিমাণে স্বতন্ত্র কোডমোনেন্ট মার্কার বৈশিষ্ট্য উত্পন্ন করতে হবে;
- উচ্চ প্রজননযোগ্যতা আছে;
- পরীক্ষা করার জন্য ন্যূনতম পরিমাণে টিস্যু ব্যবহার করুন;
- স্তরটির সাথে সুনির্দিষ্ট হতে হবে (সংস্কৃতিতে উপস্থিত দূষণের ফলে ফলাফলগুলিকে প্রভাবিত করা উচিত নয়);
- বিপজ্জনক পদ্ধতি এবং উচ্চতর বিষাক্ত রাসায়নিক ব্যবহারের প্রয়োজন হবে না।
দুর্ভাগ্যক্রমে, উপরের সমস্ত পরামিতিগুলির সাথে সম্পর্কিত কোনও পদ্ধতি নেই। আমাদের সময়ে স্ট্রেনের তুলনামূলক অধ্যয়নের জন্য, ফিনোটাইপিক বৈশিষ্ট্যগুলির বিশ্লেষণের ভিত্তিতে পদ্ধতিগুলি ব্যবহার করা হয়: আলু এবং টমেটো জাতের (আলু এবং টমেটো রেসের) সংমিশ্রণ, মিলনের ধরণ, পেপটিডেস আইসোএনজাইমসের বর্ণালী এবং গ্লুকোজ -6-ফসফেট আইসোমেজ এবং ডিএনএ কাঠামোর বিশ্লেষণের ভিত্তিতে: দৈর্ঘ্য পলিমারফিজম সীমাবদ্ধতা খণ্ড (আরএফএলপি), যা সাধারণত হাইব্রিডাইজেশন তদন্ত আরজি 57, মাইক্রোসেটেলাইট রিপিটস (এসএসআর এবং ইন্টারএসএসআর) বিশ্লেষণ, এলোমেলো প্রাইমার (আরএপিডি) এর পরিবর্ধন, সীমাবদ্ধতা টুকরা (এএফএলপি) এর পরিবর্ধন, মোবাইল উপাদানগুলির অনুক্রমের প্রাইমারের সাথে প্রসারিতকরণ (উদাহরণস্বরূপ, আন্তঃসংযোগ) সাইন পিসিআর), মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ হ্যাপ্লোটাইপসের সংকল্প।
পি। ইনফেষ্টানসের সাথে কাজের ক্ষেত্রে ব্যবহৃত স্ট্রেনগুলির তুলনামূলক অধ্যয়নের জন্য পদ্ধতির সংক্ষিপ্ত বিবরণ
ফেনোটাইপিক চিহ্নিতকারী বৈশিষ্ট্য
"আলু" দৌড়
"আলু" রেস একটি সাধারণ গবেষণা এবং ব্যবহৃত চিহ্নিতকারী। "সাধারণ আলু" রেসের আলুর ভাইরুলেন্সের জন্য একটি জিন থাকে, "জটিল" জাতীয় - কমপক্ষে দুটি। ব্ল্যাক এট আল। (1953), তাদের কাছে উপলব্ধ সমস্ত ডেটার সংক্ষিপ্ত বিবরণে দেখা গেছে যে ফাইটোফথোরা জাতি পি। ইনফ্যান্ট্যান্স জীবাণু / জিনের সাথে প্রতিরোধী জিন / জিনের সাথে উদ্ভিদগুলিকে সংক্রামিত করতে সক্ষম এবং উদ্ভিদগুলিকে সংক্রামিত রেস 1, 2, 3 এবং 4 পাওয়া গেছে। জিন R1, R2, R3 এবং R4 সহ যথাক্রমে, অর্থাৎ পরজীবী এবং হোস্টের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া জিনের নীতির জন্য জিন অনুসারে ঘটে। আরও, ব্ল্যাক, গ্যালি এবং ম্যালকমসনের অংশগ্রহণে, প্রতিরোধ জিনগুলি আর 5, আর 6, আর 7, আর 8, আর 9, আর 10 এবং আর 11 এর সাথে সম্পর্কিত রেস (ব্ল্যাক, 1954; ব্ল্যাক অ্যান্ড গ্যালগেলি, 1957; ম্যালকমসন অ্যান্ড ব্ল্যাক, 1966; ম্যালকামসন, 1970) আবিষ্কার করেছিলেন।
বিভিন্ন অঞ্চল থেকে প্যাথোজেনের বর্ণগত রচনা সম্পর্কিত একটি বিস্তৃত তথ্য রয়েছে। এই তথ্যগুলির বিশদ বিশ্লেষণ না করে আমরা কেবল একটি সাধারণ প্রবণতা নির্দেশ করব: যেখানে নতুন প্রতিরোধের জিন বা তাদের সংমিশ্রনের জাতগুলি প্রথমে ব্যবহৃত হয়েছিল, সেখানে প্রথমে দেরিতে দুরত্বের কিছুটা দুর্বল হয়ে পড়েছিল, তবে তারপরে সম্পর্কিত ভাইরুলেন্স জিনগুলির সাথে দৌড়গুলি উপস্থিত হয়েছিল এবং নির্বাচিত হয়েছিল এবং দেরীতে দুর্যোগের প্রাদুর্ভাব আবার শুরু হয়েছিল। এই জিনগুলির সাথে বিভিন্ন জাতের চাষের প্রবর্তনের আগে সংগৃহীত সংগ্রহগুলিতে প্রথম 4 প্রতিরোধ জিনের (R1-R4) বিরুদ্ধে নির্দিষ্ট ভাইরুলেন্স খুব কমই লক্ষ্য করা যায়, তবে জিনগুলি বহনকারী জাতগুলিতে প্যাথোজেন পরজীবী হয়েছিল তখন ভাইরাসজনিত স্ট্রাইনের সংখ্যা তীব্রভাবে বৃদ্ধি পায়। অন্যদিকে জিনস 5-11, সংগ্রহে বেশ সাধারণ ছিল (শ, 1991)।
১৯ 1980০ এর দশকের শেষভাগে, ক্রমবর্ধমান seasonতুতে বিভিন্ন বর্ণের অনুপাতের সমীক্ষা দেখিয়েছিল যে রোগের বিকাশের শুরুতে, কম আগ্রাসনযুক্ত ক্লোন এবং 1-2 ভেরুলেন্স জিনগুলি জনসংখ্যায় প্রাধান্য পায়।
আরও, দেরীতে দুর্যোগের বিকাশের সাথে, মূল ক্লোনগুলির ঘনত্ব হ্রাস পায় এবং উচ্চ আগ্রাসনের সাথে "জটিল" দৌড়ের সংখ্যা বৃদ্ধি পায়। মৌসুমের শেষের দিকের ঘটনাটি 100% এ পৌঁছে যায়। কন্দগুলি সংরক্ষণ করার সময়, আক্রমণাত্মকতা হ্রাস এবং পৃথক ভাইরুলেন্স জিনের ক্ষতি হয়। ক্লোন প্রতিস্থাপনের গতিবিদ্যা বিভিন্ন ধরণের বিভিন্ন উপায়ে দেখা যায় (রাইবাকোভা এবং ডায়াকভ, 1990)। তবে, ২০০০-২০১০ এ আমাদের অধ্যয়নগুলি প্রমাণ করেছে যে আলু এবং টমেটো উভয় থেকে বিচ্ছিন্ন স্ট্রেনগুলির মধ্যে এপিফাইটিকসের শুরু থেকেই জটিল রেস পাওয়া যায়। এটি সম্ভবত রাশিয়ার পি ইনফেষ্টানদের জনসংখ্যার পরিবর্তনের কারণে ঘটেছে।
1988-1995 এর মধ্যে, বিভিন্ন অঞ্চলে সমস্ত বা প্রায় সমস্ত ভাইরুলেন্স জিনের সাথে "সুপাররেসেস" এর উপস্থিতি 70-100% পৌঁছেছিল। এই পরিস্থিতির উদাহরণস্বরূপ, বেলারুশ, লেনিনগ্রাদ এবং মস্কো অঞ্চলগুলিতে, উত্তর ওসেটিয়া এবং জার্মানিতে (ইভানিয়ুক এট আল।, 2002a, 2002 বি; পলিটিকো, 1994; শোবার-বাটিন এট আল।, 1995) উল্লেখ করা হয়েছিল।
"টমেটো" দৌড়
টমেটো চাষে, দেরিতে ব্লাইটের প্রতিরোধের মাত্র দুটি জিন পাওয়া গেছে - পিএইচ 2 (গ্যালিলি এবং মারভেল, 1) এবং পিএইচ 1955 (আল-খেরব, 2)। আলুর দৌড়ের ক্ষেত্রে টমেটো এবং পি। ইনফেষ্টানসের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া জিন-বাই-জিন ভিত্তিতে ঘটে occurs টি1988 জাতিটি এমন জাতগুলিকে সংক্রামিত করে যার প্রতিরোধের জিন নেই (বেশিরভাগ শিল্পজাত ব্যবহৃত জাতগুলি), টি 0 জাতিটি পিএইচ 1 জিন (অটোয়া) দিয়ে বিভিন্ন ধরণের সংক্রামিত হয় এবং টি 1 জাতিটি পি 2 2 জিনের সাথে বিভিন্ন ধরণের সংক্রামিত হয়।
রাশিয়ায়, আলুতে প্রায় একচেটিয়াভাবে টি 0 পাওয়া গেছে; মরসুমের শুরুতে টি 0 টমেটোতে বিরাজ করেছিল, তবে পরে এটি টি 1 রেস দ্বারা প্রতিস্থাপিত হয়েছিল (ডায়াকভ এট আল।, 1975, 1994)। 2000 এর পরে, বহু জনগোষ্ঠীর আলুতে টি 1 এপিফাইটোটিক সময়ের শুরুতে শুরু হয়েছিল। মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে, আলুর স্ট্রেনগুলি টমেটোতে অ প্যাথোজেনিক ছিল, তেমনি রেস টি 0, টি 1 এবং টি 2 ছিল, যখন টি 1 এবং টি 2 টমেটোতে প্রাধান্য পেয়েছিল (ভার্টানিয়ান এবং এন্ডো, 1985; গুডউইন এট আল।, 1995)।
সঙ্গমের ধরণ
অধ্যয়ন পরিচালনা করতে, পরিচিত সঙ্গমের ধরণের - এ 1 এবং এ 2 - সহ পরীক্ষক (রেফারেন্স) স্ট্রেনগুলি প্রয়োজনীয়। ওট আগর মাধ্যমের সাথে পেট্রি থালাগুলিতে জোড়ায় জোড় দিয়ে টেস্ট বিচ্ছিন্ন করা হয়। 10 দিনের জন্য জ্বালানীর পরে, প্লেটগুলি স্ট্রেনের যোগাযোগের জোনে মাঝারি স্তরে oospores উপস্থিতি বা অনুপস্থিতির জন্য পরীক্ষা করা হয়। ৪ টি অপশন রয়েছে: স্ট্রেনটি এ 4 টেস্টারের সাথে অস্টোরগুলি তৈরি করে, এ 1 এর সাথে এ 2 টেস্টারের সাথে অস্টোরগুলি গঠন করে, যদি এ 2 টি পরীক্ষার্থীর সাথে অস্পোর গঠন করে, বা জীবাণুমুক্ত (1) হয় তবে এটি স্ট্রপটি এ 1 মিলনের ধরণের হয় belongs কোনও পরীক্ষক ছাড়াই (শেষ দুটি গ্রুপ বিরল)।
সঙ্গমের প্রকারগুলি আরও দ্রুত নির্ধারণ করতে, পিসিআর দ্বারা সঙ্গমের ধরণ নির্ধারণের জন্য আরও ব্যবহারের লক্ষ্য নিয়ে সঙ্গমের ধরণের সাথে জিনোমের অঞ্চলগুলি চিহ্নিত করার চেষ্টা করা হয়েছিল। এই জাতীয় সাইট সনাক্তকরণের জন্য প্রথম সফল পরীক্ষার একটি আমেরিকান গবেষকরা করেছিলেন (জুডেলসন এট আল।, 1995)। আরএপিডি পদ্ধতিটি ব্যবহার করে, তারা দুটি অতিক্রম করা বিচ্ছিন্নতার বংশের মধ্যে সঙ্গমের ধরণের সাথে যুক্ত ডব্লু 16 অঞ্চল চিহ্নিত করতে সক্ষম হয়েছিল এবং এটিকে প্রশস্ত করতে 24-বিপি প্রাইমারের একটি জুড়ি ডিজাইন করতে পেরেছিল (W16-1 (5'-AACACGCACAAGGCATATAAATGTA-3 ') এবং W16-2 (5' -GCGTAATGTAGCGTAACAGCTCTC-3 ') পিসিআর পণ্যটি সীমাবদ্ধতা এনজাইম হেইআইআইআই দিয়ে সীমাবদ্ধ করার পরে, জোড় টাইপ এ 1 এবং এ 2 দিয়ে পৃথক পৃথক করা সম্ভব হয়েছিল।
সঙ্গমের ধরণ নির্ধারণের জন্য পিসিআর চিহ্নিতকারীদের পাওয়ার আরেকটি প্রচেষ্টা কোরিয়ান গবেষকরা করেছিলেন (কিম, লি, ২০০২)। তারা এএফএলপি পদ্ধতিটি ব্যবহার করে নির্দিষ্ট পণ্য সনাক্ত করেছিল। ফলস্বরূপ, পিএইচওয়াইবি -2002 (ফরোয়ার্ড) (1'-GATCGGATTAGTCAGACGAG-5 ') এবং PHYB-3 (2'-GCGTCTGCAAGGCGCATTTT-5') প্রিমারগুলির একটি জোড়া বিকাশ করা হয়েছিল, যা এ 3 সঙ্গমের ধরণের সাথে জিনোম অঞ্চলের নির্বাচনী প্রশস্তকরণের অনুমতি দেয়। পরবর্তীকালে, তারা এই কাজটি অব্যাহত রেখেছিল এবং প্রজননকারীদের 2 'AAGCTATACTGGGACAGGGT-5' (INF-3, এগিয়ে) এবং 1'-GCGTTCTTTCGTATTACCAC-5 '(আইএনএফ -3) নকশাকৃতভাবে ম্যাট-এ 2 অঞ্চলের বৈদ্যুতিক পরিবর্ধনের অনুমতি দেয় এ 1। চেক প্রজাতন্ত্রের পি। ইনফেসট্যান্সের জনসংখ্যা (মজাকোভা এট আল।, 1), তিউনিসিয়া (জমুর, হামদা, ২০০)) এবং অন্যান্য অঞ্চলে অধ্যয়ন করার সময় সঙ্গমের ধরণের পিসিআর ডায়াগনস্টিকগুলির ব্যবহার ভাল ফলাফল দেখিয়েছিল। আমাদের পরীক্ষাগারে (মায়তা, এলানস্কি, অপ্রকাশিত) 2006 টি পি ইনফ্যান্টানস স্ট্রেনগুলি রাশিয়ার বিভিন্ন অঞ্চলে (কোস্ট্রোমা, রিয়াজান, আস্ট্রাকান এবং মস্কো অঞ্চল) রোগাক্রান্ত আলু এবং টমেটো অঙ্গ থেকে বিচ্ছিন্ন বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। নির্দিষ্ট প্রাইমারগুলি 2006% এরও বেশি নির্দিষ্ট পিসিআর ব্যবহার করে পিসিআর বিশ্লেষণের ফলাফলগুলি একটি পুষ্টিকর মাধ্যমের traditionalতিহ্যবাহী পদ্ধতির দ্বারা সঙ্গমের ধরণের বিশ্লেষণের ফলাফলের সাথে মিলিত হয়।
সারণী 1. সিব 1 ক্লোনটির মধ্যে প্রতিরোধের পরিবর্তনশীলতা (এলানস্কি এট আল।, 2001)
নমুনা সংগ্রহের অবস্থান | বিশ্লেষণ করা বিচ্ছিন্নতার সংখ্যা | সংবেদনশীল (এস), দুর্বল প্রতিরোধী (এসআর) এবং প্রতিরোধী (আর) স্ট্রেন, পিসি (%) সংখ্যা | ||
S | SR | R | ||
জি ভ্লাদিভোস্টক | 10 | 1 (10) | 4 (40) | 5 (50) |
জি চিতা | 5 | 0 | 0 | 5 (100) |
ইরকুটস্ক | 9 | 9 (100) | 0 | 0 |
জি। ক্রাশনোইয়ারস্ক | 13 | 12 (92) | 1 (8) | 0 |
ইয়েকাটারিনবুর্গ শহর | 15 | 8 (53) | 1 (7) | 6 (40) |
ও। সাখালিন | 66 | 0 | 0 | 66 (100) |
ওমস্ক অঞ্চল | 18 | 0 | 0 | 18 (100) |
জনসংখ্যা চিহ্নিতকারী হিসাবে মেটালাক্সিল প্রতিরোধের
১৯৮০ এর দশকের গোড়ার দিকে, মেটালাক্সেল-রেজিস্ট্যান্ট পি। ইনফেষ্টান স্ট্রেনগুলির কারণে দেরিতে দুর্যোগের শক্তিশালী প্রাদুর্ভাব বিভিন্ন অঞ্চলে লক্ষণীয় ছিল। অনেক দেশে আলু খামারগুলি উল্লেখযোগ্য লোকসানের মুখোমুখি হয়েছে (ডউলি এবং ও'সুলিভান, 1980; ডেভিডস এট আল।, 1981; ডেরেভিগিনা, 1983)। সেই থেকে, বিশ্বের অনেক দেশেই, পি। ইনফেসট্যান্স জনসংখ্যার মধ্যে ফেনাইলামাইড-প্রতিরোধী স্ট্রেনগুলির সংঘটিত হওয়ার ক্রমাগত পর্যবেক্ষণ পরিচালিত হয়েছিল। ফেনিলাইমাইডযুক্ত ওষুধের ব্যবহারের সম্ভাবনাগুলির ব্যবহারিক মূল্যায়ন ছাড়াও, প্রতিরক্ষামূলক ব্যবস্থা গ্রহণ এবং এপিফিটোটিসের পূর্বাভাস দেওয়া, এই রোগগুলির জনসংখ্যার তুলনামূলক বিশ্লেষণের জন্য এই ওষুধগুলির প্রতিরোধের ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত একটি চিহ্নিত বৈশিষ্ট্য হয়ে দাঁড়িয়েছে। যাইহোক, তুলনামূলক জনসংখ্যার অধ্যয়নগুলিতে মেটালাক্সিলের প্রতিরোধের ব্যবহারটি এই বিষয়টি বিবেচনা করেই করা উচিত: 1991 - প্রতিরোধের জিনগত ভিত্তি এখনও সঠিকভাবে নির্ধারণ করা যায়নি, 1 - মেটালাক্সেলের প্রতিরোধ একটি নির্বাচনমূলকভাবে নির্ভরশীল বৈশিষ্ট্য যা ফেনিলাইমাইডের ব্যবহারের উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত হতে পারে, 2 - ভিন্ন এক ক্লোনাল লাইনের মধ্যে মেটালাক্সেল স্ট্রেনের সংবেদনশীলতার ডিগ্রি (টেবিল। 3)।
আইসোজাইমের স্পেকট্রা
আইসোজাইম চিহ্নিতকারীরা সাধারণত বাহ্যিক অবস্থার চেয়ে স্বতন্ত্র থাকে, মেন্ডেলিয়ার উত্তরাধিকার দেখায় এবং আধিপত্যবাদী হয়, যা হোমো এবং হেরোজিগোটেসের মধ্যে পার্থক্য করতে দেয়। জিন চিহ্নিতকারী হিসাবে প্রোটিনের ব্যবহার ক্রোমোসোমাল এবং জিনোমিক মিউটেশন এবং একক অ্যামিনো অ্যাসিডের বিকল্প সহ জেনেটিক পদার্থের উভয় বৃহত পুনর্গঠন সনাক্তকরণ সম্ভব করে।
প্রোটিনগুলির ইলেক্ট্রোফোরেটিক গবেষণায় দেখা গেছে যে বেশিরভাগ এনজাইমগুলি জীবের মধ্যে ইলেক্ট্রোফোরেটিক গতিশীলতায় বিভিন্ন ভগ্নাংশের আকারে উপস্থিত রয়েছে। এই ভগ্নাংশগুলি বিভিন্ন লোকাই (আইসোজাইমস বা আইসোজাইমস) দ্বারা বা একই লোকসের বিভিন্ন অ্যালিল (অ্যালোজাইমস বা অ্যালোজনাইমস) দ্বারা একাধিক রূপের এনজাইম এনকোডিংয়ের ফলাফল। অর্থাৎ আইসোজাইমগুলি একটি এনজাইমের বিভিন্ন রূপ। বিভিন্ন রূপের একই অনুঘটক কার্যকলাপ রয়েছে, তবে পেপটাইডে এবং দায়িত্বে থাকা একক অ্যামিনো অ্যাসিড বিকল্পগুলিতে কিছুটা পৃথক হয়। এই ধরনের পার্থক্য ইলেক্ট্রোফোরসিসের সময় প্রকাশিত হয়।
পি। ইনফেষ্ট্যান্স স্ট্রেনগুলি অধ্যয়ন করার সময়, দুটি প্রোটিন, পেপটাইডেস এবং গ্লুকোজ-6-ফসফেট আইসোমেজ আইসোএনজাইমগুলির বর্ণালী ব্যবহার করা হয় (এই এনজাইমটি রাশিয়ান জনগোষ্ঠীতে মনোমরফিক হয়, সুতরাং, এর গবেষণার পদ্ধতিগুলি এই কাজে উপস্থাপিত হয় না)। এগুলিকে বৈদ্যুতিক ক্ষেত্রে আইসোজিমগুলিতে পৃথক করার জন্য, অধ্যয়ন করা জীব থেকে বিচ্ছিন্ন প্রোটিনের প্রস্তুতিগুলি বৈদ্যুতিক ক্ষেত্রে স্থাপন করা জেল প্লেটে প্রয়োগ করা হয়। জেলটিতে পৃথক প্রোটিনের বিস্তারের হার চার্জ এবং আণবিক ওজনের উপর নির্ভর করে; অতএব, বৈদ্যুতিক ক্ষেত্রে প্রোটিনের মিশ্রণটি পৃথক ভগ্নাংশে পৃথক করা হয়, যা বিশেষ রঞ্জক ব্যবহার করে ভিজ্যুয়ালাইজ করা যায়।
পেপটিডেস আইসোইনজাইমসের অধ্যয়ন সেলুলোজ অ্যাসিটেট, স্টার্চ বা পলিয়াক্রাইম্লাইড জেলগুলিতে করা হয়। সর্বাধিক সুবিধাজনক হেলেনা ল্যাবরেটরিজ ইনক দ্বারা উত্পাদিত সেলুলোজ অ্যাসিটেট জেল ব্যবহারের উপর ভিত্তি করে পদ্ধতি is এটি প্রচুর পরিমাণে পরীক্ষামূলক উপাদানের প্রয়োজন হয় না, এটি উভয় এনজাইম লোকির জন্য ইলেক্ট্রোফোরসিসের পরে জেলটিতে বিপরীত ব্যান্ডগুলি পাওয়ার অনুমতি দেয়, এর প্রয়োগের জন্য বড় সময় এবং উপাদান ব্যয় প্রয়োজন হয় না (চিত্র 2)।
মাইসেলিয়ামের একটি ছোট টুকরা 1,5 মিলি মাইক্রোটিউবে স্থানান্তরিত হয়, এটিতে 1-2 ফোটা পাত্রে জল যোগ করা হয়। এর পরে, নমুনাটি একজাত করা হয় (উদাহরণস্বরূপ, একটি মাইক্রোটিউবের জন্য উপযুক্ত প্লাস্টিকের সংযুক্তি সহ একটি বৈদ্যুতিক ড্রিল সহ) এবং 25 আরপিএম-এ সেন্ট্রিফিউজে 13000 সেকেন্ডের জন্য পলিত করা হয়। প্রতিটি মাইক্রোটিউব থেকে 8 l। সুপারনেট্যান্ট আবেদনকারী প্লেটে স্থানান্তরিত হয়।
সেলুলোজ অ্যাসিটেট জেলটি বাফার ধারক থেকে অপসারণ করা হয়, ফিল্টার পেপারের দুটি শীটের মধ্যে দাগ পড়ে এবং আবেদনকারীটির প্লাস্টিকের ভিত্তিতে ওয়ার্কিং স্তর সহ স্থাপন করা হয়। প্লেট থেকে সমাধানটি আবেদনকারীর মাধ্যমে জেলটিতে 2-4 বার স্থানান্তরিত হয়। জেলটি একটি ইলেক্ট্রোফোরসিস চেম্বারে স্থানান্তরিত হয়,
সারণী ২। পেপটিডেজ আইসোএনজাইমসের বিশ্লেষণে সেলুলোজ অ্যাসিটেট জেলকে দাগ দেওয়ার জন্য ব্যবহৃত সমাধানটির সংমিশ্রণ, জেলের প্রান্তে একটি ফোঁটা পেইন্ট (ব্রোমোফেনল নীল) দেওয়া হয়।
টিআরআইএস এইচসিএল, 0,05 এম, পিএইচ 8,0 2 মিলি
পেরোক্সিডেস, 1000 ইউ / মিলি 5 টি ড্রপ
ও-ডায়ানিসিডিন, 4 মিলিগ্রাম / মিলি 8 ফোটা
এমজিসিএল 2, 20 মিলিগ্রাম / মিলি 2 ফোঁটা
গ্লাই-লিউ, 15 মিলিগ্রাম / মিলি 10 ফোটা
এল-অ্যামিনো-অ্যাসিড অক্সিডেস, 20 ইউ / মিলি 2 ফোঁটা
ইলেক্ট্রোফোরসিস 20 মিনিটের জন্য বাহিত হয়। ইলেক্ট্রোফোরসিসের পরে 200 ভি। জেলটি একটি পেইন্টিং টেবিলে স্থানান্তরিত হয় এবং একটি বিশেষ পেইন্টিং সলিউশন (টেবিল 2) দিয়ে আঁকা হয়। ডিআইএফসিও আগর 10 মিলি প্রাথমিকভাবে একটি মাইক্রোওয়েভ ওভেনে গলানো হয়, এটি 1,6০ ডিগ্রি সেলসিয়াস তাপমাত্রায় ঠান্ডা করা হয়, যার পরে 60 মিলি আগর একটি পেইন্টের মিশ্রণে মিশ্রিত করা হয় এবং জেলটির উপরে pouredেলে দেওয়া হয়। স্ট্রিপস 2-15 মিনিটের মধ্যে উপস্থিত হয়। গলিত আগরের সাথে দ্রবণ মিশ্রণের ঠিক আগে এল-অ্যামিনো-অ্যাসিড অক্সিডেস রিএজেন্ট যুক্ত করা হয়।
রাশিয়ান জনগোষ্ঠীতে, পেপ 1 লোকাস 100/100 এবং 92/100 জিনোটাইপ দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়। হোমোজাইগোট 92/92 অত্যন্ত বিরল (প্রায় 0,1%)। লোকাস পেহর 2 তিনটি জিনোটাইপ 100/100, 100/112, এবং 112/112 দ্বারা উপস্থাপিত হয় এবং সমস্ত 3 রূপগুলি বেশ সাধারণ (এলানকি এবং স্মারনভ, 2003, চিত্র 2)।
জিনোম গবেষণা
পরবর্তী সংকরকরণ (আরএফএলপি-আরজি 57) সহ সীমাবদ্ধতা খণ্ড দৈর্ঘ্যের বহুবচন
মোট ডিএনএ ইকো আর 1 সীমাবদ্ধতা এনজাইম দিয়ে চিকিত্সা করা হয়, ডিএনএ খণ্ডগুলি আগারোজ জেলটিতে ইলেক্ট্রোফোরসিস দ্বারা পৃথক করা হয়। পারমাণবিক ডিএনএ অনেক বড় এবং এর পুনরাবৃত্তিক ক্রম রয়েছে, যা বিধিনিষেধের এনজাইমগুলির ক্রিয়া দ্বারা প্রাপ্ত অসংখ্য টুকরোগুলি সরাসরি বিশ্লেষণ করা কঠিন করে তোলে। অতএব, জেলটিতে বিচ্ছিন্ন ডিএনএ খণ্ডগুলি একটি বিশেষ ঝিল্লিতে স্থানান্তরিত হয় এবং আরজি 57 প্রোবের সাহায্যে হাইব্রিডাইজেশনের জন্য ব্যবহৃত হয়, যার মধ্যে তেজস্ক্রিয় বা ফ্লুরোসেন্ট লেবেলযুক্ত লেকযুক্ত নিউক্লিওটাইড রয়েছে। এই তদন্তটি পুনরাবৃত্ত জিনোমিক সিকোয়েন্সগুলি সংকরন করে (গুডউইন এট আল।, 1992, ফোর্বস এট আল।, 1998)। হালকা- বা তেজস্ক্রিয় পদার্থে সংকরনের ফলাফলের দৃশ্যধারণের পরে, একটি বহু-লোকাস সংকরকরণ প্রোফাইল (ফিঙ্গারপ্রিন্টিং) প্রাপ্ত হয়, 25-29 টুকরা দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয় (ফোর্বস এট আল।, 1998)। এসেক্সুয়াল (ক্লোনাল) বংশধরদের একই প্রোফাইল থাকবে। ইলেক্ট্রোফোরেটোগ্রামে ব্যান্ডগুলির বিন্যাস দ্বারা, কেউ তুলনামূলক প্রাণীর মিল এবং পার্থক্য বিচার করতে পারেন।
মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ হ্যাপ্লোটাইপস
বেশিরভাগ ইউক্যারিওটিক কোষে, এমটিডিএনএ একটি ডাবল-স্ট্র্যান্ডযুক্ত বিজ্ঞপ্তি ডিএনএ অণুর আকারে উপস্থাপিত হয়, যা ইউক্যারিওটিক কোষগুলির পারমাণবিক ক্রোমোসোমগুলির বিপরীতে, অর্ধ-রক্ষণশীলভাবে প্রতিলিপি তৈরি করে এবং প্রোটিনের অণুর সাথে সম্পর্কিত নয়।
পি। ইনফেসট্যান্সের মাইটোকন্ড্রিয়াল জিনোমকে ধারাবাহিকভাবে তৈরি করা হয়েছিল এবং অনেকগুলি কাজ নিষেধাজ্ঞার খণ্ড দৈর্ঘ্যের বিশ্লেষণে উত্সর্গীকৃত হয়েছিল (কার্টার এট আল, 1990, গুডউইন, 1991, গাভিনো, ফ্রাই, 2002)। গ্রিফিথ এবং শ (1998) এমটিডিএনএ হ্যাপ্লোটাইপগুলি নির্ধারণের জন্য একটি সহজ এবং দ্রুত পদ্ধতি বিকাশের পরে, এই চিহ্নিতকারী পি। ইনফেসট্যান্স স্টাডিতে অন্যতম জনপ্রিয় হয়ে ওঠে the পদ্ধতির সংমিশ্রণ দুটি মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ খণ্ডের ক্রমবৃদ্ধি ঘটায় (সাধারণ জিনোম থেকে) প্রাইমারগুলির সাথে। এফ 2-আর 2 (টেবিল 4) এবং সীমাবদ্ধ এনজাইমগুলি এমএসপিআই (4 ম খণ্ড) এবং ইকোআর 3 (1 য় খণ্ড) এর সাথে পরবর্তী সীমাবদ্ধতা। পদ্ধতিটি আপনাকে 1 টি হ্যাপ্লোটাইপগুলি সনাক্ত করতে দেয়: আইএ, আইআইএ, আইবি, আইআইবি। মাপের 2 বিপি সন্নিবেশ এবং P4 এবং P1881 অঞ্চলগুলিতে বিধিনিষেধের সাইটগুলির পৃথক অবস্থানের মাধ্যমে II ধরণের ধরণ পৃথক হয় Fig
১৯৯ Russia সাল থেকে রাশিয়ার ভূখণ্ডে সংগৃহীত স্ট্রেনগুলির মধ্যে কেবল হ্যাপলোটাইপস আইএ এবং আইআইএই উল্লেখ করা হয়েছিল (এলানস্কি এট আল।, 1996, 2001)। বৈদ্যুতিক ক্ষেত্রে প্রাইমার F2015-R2 দিয়ে সীমাবদ্ধতা পণ্যগুলি পৃথক করার পরে এগুলি সনাক্ত করা যেতে পারে (চিত্র 2, 4)। এমটিডিএনএর প্রকারগুলি স্ট্রেন এবং জনসংখ্যার তুলনামূলক বিশ্লেষণে ব্যবহৃত হয়। বেশ কয়েকটি রচনাগুলিতে ক্লোনাল লাইনগুলি বিচ্ছিন্ন করতে এবং পি। ইনফেসট্যান্স আইসোলেটগুলি পাসপোর্টাইজ করার জন্য মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ জাতীয় ধরণের ব্যবহার করা হয়েছিল (বোটেজ এট আল।, 5; শাইন এট আল।, ২০০৯)। পিসিআর-আরএফএলপি পদ্ধতিটি ব্যবহার করে, এই সিদ্ধান্তে উপনীত হয়েছিল যে এমটিডিএনএ একই পি ইনফ্যান্ট্যান্স স্ট্রেনে (ইলানস্কি এবং মাইলিউটিনা, 2007) ভিন্ন ভিন্ন। পরিবর্ধনের শর্তসমূহ: 2009x (2007 সেকেন্ড। 1 ° সে), 500x (94 সেকেন্ড 40 ° সে, 30 সেকেন্ড। 90 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড, 30 সেকেন্ড 52 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড); 90x (72 মিনিট 1 ° সে।) বিক্রিয়া মিশ্রণ: (5 μl): 72 ইউ টাক ডিএনএ পলিমেরেজ, 20x 0,2 এমএম এমজিসিএল 1-টাক বাফার, 2,5 ডিএম প্রতিটি প্রতি ডিএনটিপি, 2 পিএম প্রাইমার এবং 0,2 এনজি বিশ্লেষিত ডিএনএ, ডিওনাইজড জল - 30 tol অবধি।
পিসিআর পণ্যের সীমাবদ্ধতা 4 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড তাপমাত্রায় 6-37 ঘন্টা ধরে বাহিত হয় is বাধা মিশ্রণ (20 10l): 2x এমএসপিআই (10 2l), 6x সীমাবদ্ধতা বাফার (10 )l), ডিওনাইজড ওয়াটার (XNUMX )l), পিসিআর পণ্য (XNUMX μl)।
সারণী ৩. এমটিডিএনএ বহুমুখী অঞ্চলগুলির প্রশস্তকরণের জন্য ব্যবহৃত প্রাইমারগুলি
লোকস | কার্তুজ | প্রাথমিক দৈর্ঘ্য এবং স্থাপনা | পিসিআর পণ্যের দৈর্ঘ্য | সীমাবদ্ধতা |
---|---|---|---|---|
P2 | F2: 5'- TTCCCTTTGTCCTCTACCGAT | 21; 13619-13639 | 1070 | এমএসপিআই |
আর 2: 5'- TTACGGCGGTTTAGCACATACA | 22; 14688-14667 | |||
P4 | এফ 4: 5'- টিজিজিটিসিটিসিসিএজিএজিজিজিটিটিটিজিটিটি | 22; 9329-9350 | 964 | ইকোআরআই |
আর 4: 5 - সিসিগাটাসিসিএজিটিএএসিএসিএসিএসিএসিএএ | 22; 10292-10271 |
র্যান্ডম প্রাইমর পরিবর্ধন (আরএপিডি)
আরএপিডি চালানোর সময়, একটি প্রাইমার ব্যবহার করা হয় (একসাথে বেশ কয়েকটি প্রাইমার একসাথে) একটি স্বেচ্ছাসেবী নিউক্লিওটাইড ক্রম সহ, সাধারণত দৈর্ঘ্যে 10 নিউক্লিওটাইড থাকে, জিসি নিউক্লিওটাইডগুলির একটি উচ্চ সামগ্রী (50% থেকে) এবং কম অ্যানিলিং তাপমাত্রা (প্রায় 35 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড) থাকে। জিনোমের অসংখ্য পরিপূরক সাইটে এই জাতীয় প্রাইমারগুলি "ল্যান্ড" করে। পরিবর্ধনের পরে, প্রচুর পরিমাণে এমপ্লিকন প্রাপ্ত হয়। তাদের সংখ্যা ব্যবহৃত প্রাইমার (গুলি) এবং প্রতিক্রিয়ার অবস্থার উপর নির্ভর করে (এমজিসিএল 2 ঘনত্ব এবং অ্যানেলিং তাপমাত্রা)।
এমপ্লিকনগুলির ভিজ্যুয়ালাইজেশন পলিয়েক্রাইমাইড বা অ্যাগ্রোজ জেল মধ্যে পাতন দ্বারা চালিত হয়। আরএপিডি বিশ্লেষণ পরিচালনা করার সময় বিশ্লেষণকৃত উপাদানের বিশুদ্ধতার যত্ন সহকারে নিরীক্ষণ করা প্রয়োজন, কারণ অন্যান্য জীবন্ত বস্তুর সাথে দূষিত হওয়ার ফলে নিদর্শনগুলির সংখ্যায় উল্লেখযোগ্য বৃদ্ধি হতে পারে, যা বিশুদ্ধ উপাদানের বিশ্লেষণে বেশ অসংখ্য (পেরেজ এট আল, 1998)। পি। ইনফেসট্যান্স জিনোমের অধ্যয়নের ক্ষেত্রে এই পদ্ধতির ব্যবহার অনেকগুলি কাজের মধ্যে প্রতিফলিত হয় (জুডেলসন, রবার্টস, 1999, গিমির এট আল।, 2002, কার্লিসেল এট আল।, 2001)। প্রতিক্রিয়া শর্ত এবং প্রাইমারের নির্বাচন (51 10-নিউক্লিওটাইড প্রাইমার অধ্যয়ন করা হয়েছিল) আবু-এল সামেন এট আল।, (2003) দ্বারা নিবন্ধে দেওয়া হয়েছে।
মাইক্রোসেটেলাইট পুনরাবৃত্তি বিশ্লেষণ (এসএসআর)
মাইক্রোসেটেলাইট পুনরাবৃত্তিগুলি (সাধারণ ক্রম পুনরাবৃত্তি, এসএসআর) সমস্ত ইউক্যারিওটসের পারমাণবিক জিনোমে উপস্থিত নিউক্লিয়োটাইডগুলিকে সাম্প্রতিকভাবে 1-3-এর সংক্ষিপ্ত অনুক্রম পুনরাবৃত্তি করছে। ধারাবাহিক পুনরাবৃত্তির সংখ্যা 6 থেকে 10 পর্যন্ত পরিবর্তিত হতে পারে Mic মাইক্রোসেটলাইট লোকি মোটামুটি উচ্চ ফ্রিকোয়েন্সি সহ ঘটে এবং জিনোমে কম-বেশি সমানভাবে বিতরণ করা হয় (লেগারক্র্যান্টজ এট আল।, 100)। মাইক্রোসেটেল সিকোয়েন্সগুলির পলিমॉर्फিজম মূল মোটিফটির পুনরাবৃত্তি সংখ্যার পার্থক্যের সাথে সম্পর্কিত। মাইক্রোসেটেলাইট চিহ্নিতকারী কোডডমিন্যান্ট, যা জনসংখ্যার কাঠামো বিশ্লেষণ, আত্মীয়তা নির্ধারণ, জিনোটাইপগুলির স্থানান্তরের পথ ইত্যাদির জন্য তাদের ব্যবহার সম্ভব করে তোলে এই চিহ্নিতকারীগুলির অন্যান্য সুবিধাগুলির মধ্যে, তাদের উচ্চ পলিমারফিজম, ভাল প্রজননযোগ্যতা, নিরপেক্ষতা এবং স্বয়ংক্রিয় বিশ্লেষণ এবং মূল্যায়ন করার দক্ষতা লক্ষ করা উচিত mic মাইক্রোসেটেলাইট পুনরাবৃত্তিগুলির পলিমারফিজমের অ্যানালাইসিসটি মাইক্রোস্যাটেলাইট লোকিকে flanking অনন্য অনুক্রমের পরিপূরক ব্যবহার করে পিসিআর পরিবর্ধন দ্বারা পরিচালিত হয়। প্রাথমিকভাবে, বিশ্লেষণটি পলিয়াক্রাইলাইড জেলটিতে প্রতিক্রিয়া পণ্যগুলির পৃথককরণের সাথে পরিচালিত হয়েছিল। পরে, অ্যাপ্লাইড বায়োসিস্টেম সংস্থার কর্মচারীরা একটি স্বয়ংক্রিয় লেজার ডিটেক্টর (ডিহেল এট আল।, 1993) এবং তারপরে স্ট্যান্ডার্ড স্বয়ংক্রিয় ডিএনএ সিকোয়েন্সার (জিগেল এট আল।, 1990) ব্যবহার করে প্রতিক্রিয়া পণ্য সনাক্তকরণের সাথে ফ্লুরোসেন্টালি লেবেলযুক্ত প্রাইমারগুলি ব্যবহার করার প্রস্তাব করেছিলেন। বিভিন্ন ফ্লুরোসেন্ট রঙের সাথে প্রাইমারের লেবেলিং আপনাকে এক লেনে একবারে কয়েকটি মার্কার বিশ্লেষণ করতে দেয় এবং তদনুসারে পদ্ধতির উত্পাদনশীলতা উল্লেখযোগ্যভাবে বৃদ্ধি করতে পারে এবং বিশ্লেষণের নির্ভুলতা বাড়ে।
পি। ইনফেষ্টানদের অধ্যয়নের জন্য এসএসআর বিশ্লেষণের কাজে নিবেদিত প্রথম প্রকাশনাগুলি 2000 এর দশকের গোড়ার দিকে প্রকাশিত হয়েছিল। (ন্যাপোয়া, গিসি, ২০০২) লেখক দ্বারা প্রস্তাবিত সমস্ত চিহ্নিতকারী পর্যাপ্ত পরিমাণে পলিমারফিজম দেখায়নি, তবে তাদের মধ্যে দুটি (2002 বি এবং জি 4) লিস এট আল দ্বারা প্রস্তাবিত 11 এসএসআর চিহ্নিতকারীদের অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল (12) এবং পরবর্তীতে ইউক্যাবলাইট গবেষণা নেটওয়ার্কে গৃহীত হয়েছিল (www.eucablight .org) পি। ইনফেষ্টানসের মান হিসাবে। কয়েক বছর পরে, আট এসএসআর চিহ্নিতকারী (লি এট আল।, ২০১০) এর উপর ভিত্তি করে পি। ইনফেষ্টানস ডিএনএর মাল্টিপ্লেক্স বিশ্লেষণের জন্য একটি সিস্টেম তৈরির উপর একটি গবেষণা প্রকাশিত হয়েছিল। অবশেষে, পূর্ববর্তী সমস্ত প্রস্তাবিত চিহ্নিতকারীদের মূল্যায়ন করার পরে এবং সেগুলির মধ্যে সর্বাধিক তথ্যবহুল নির্বাচন করার পাশাপাশি প্রাইমর, ফ্লুরোসেন্ট লেবেলগুলি এবং পরিবর্ধনের শর্তগুলি অনুকূল করে তোলা, একই গ্রুপের লেখকরা 2006-মার্কার (টেবিল 2010; লি এট আল সহ) এক-পদক্ষেপের মাল্টিপ্লেক্স বিশ্লেষণের জন্য একটি সিস্টেম উপস্থাপন করেছিলেন। , 12 এ)। এই ব্যবস্থায় ব্যবহৃত প্রাইমারগুলি চারটি ফ্লুরোসেন্ট মার্কার (এফএএম, ভিআইসিসি, এনইডি, পিইটি) এর একটিতে লেবেলযুক্ত বা লেবেলযুক্ত ছিল যাতে একই লেবেলের সাথে অ্যালিল আকারের প্রাইমারের রেঞ্জটি ওভারল্যাপ না হয়।
লেখকরা পিটিসি 200 এমপ্লিফায়ার (এমজে রিসার্চ, ইউএসএ) কিউইজেএন মাল্টিপ্লেক্স পিসিআর কিট বা কিউইএইজেএন টাইপিট মাইক্রোসেটেল পিসিআর কিট ব্যবহার করে বিশ্লেষণটি সম্পাদন করেছিলেন। বিক্রিয়া মিশ্রণের পরিমাণ ছিল 12.5 .L। পরিবর্ধনের শর্তগুলি নিম্নরূপ ছিল: কিয়াগেন মাল্টিপ্লেক্স পিসিআর: 95 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড (15 মিনিট), 30x (95 ° সে (20 সে), 58 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড (90 মিনিট), 72 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড (60 সে), 72 ডিগ্রি (20 মিনিট); কিয়্যাগেন টাইপ-এটি মাইক্রোসেটলাইট পিসিআর: 95 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড (5 মিনিট), 28x (95 ° সে (30 সেকেন্ড), 58 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড (90 সেকেন্ড), 72 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড (20 সেকেন্ড), 60 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড (30 মিনিট) min
ABI3730 স্বয়ংক্রিয় কৈশিক ডিএনএ বিশ্লেষক (ফলিত বায়োসিস্টেমস) ব্যবহার করে পিসিআর পণ্যগুলির পৃথককরণ এবং দৃশ্যায়ন করা হয়েছিল।
টেবিল ৪. পি। ইনফেসট্যান্সের জিনোটাইপিংয়ের জন্য ব্যবহৃত ১২ টি স্ট্যান্ডার্ড এসএসআর চিহ্নিতকারীগুলির বৈশিষ্ট্য (লি এবং অন্যান্য।, 4 এ)
নাম | অ্যালিলের সংখ্যা | আকার পরিসীমা অ্যালিলস (বিপি) | প্রিমার্স |
পাইজি 11 | 13 | 130-180 | F: NED-TGCTATTTATCAAGCGTGGG R: GTTTTCAATCTGCAGCCGTAAGA |
পাই02 | 4 | 255-275 | F: NED-ACTTGCAGAACTACCGCCC R: GTTTGACCACTTTCCTCGGTTC |
PinfSSR11 | 4 | 325-360 | এফ: নেড-টিটিএএজিসিসিএইসিসিএজিসিএটিসিগিটিজি আর: জিটিটি TAGACAATTGTTTTTTGTGGTCGC |
D13 | 16 | 100-185 | এফ: ফ্যাম-টিজিসিসিসিটিসিটিসিটিসিটিসি আর: জিসিটিসিএজিএটিটিসিটিটিটিএসিএসিএটিসিটিটিজি |
PinfSSR8 | 4 | 250-275 | এফ: ফ্যাম-অ্যাটাকট্যাগ্যাটসিজিএএসিটিজিএজিজিজি আর: জিটিটিটিএএসিএএএটিসিএসিসিটিসিটিসিটিসিটিসি |
PinfSSR4 | 7 | 280-305 | এফ: ফ্যাম-টিসিটিটিজিটিটিসিগ্যাটটিজিসিসিএসিজিসি আর: জিটিটিটিটিসিএটিটিসি জিজিএজিএজিসিটিসি |
পাই04 | 4 | 160-175 | F: VIC-AGCGGCTTACCGATGG আর: জিটিটিটিসিএজিসিজিজিসিটিজিটিটিটিসিসিএসি |
পাই70 | 3 | 185-205 | এফ: ভিক-এটিজিএএএটিএসিসিটিসিটিএটিজিসিটিসিআর: সিজিটিটিজিজিএটিএটিটিটিসিটিটিটিটিটিসিটিজি |
PinfSSR6 | 3 | 230-250 | এফ: জিটিটিটিটিজিজিটিজিজিজিজিসিটিজিএজিটিটিটিটি আর: ভিসি-টিসিজিসিসিএএসিএএএএটিএটিএটিটিটিসিসিজি |
পাই63 | 3 | 265-280 | এফ: ভিক-অ্যাটগ্যাসএইজিজিটিজিএএজিটিজিএজিজি আর: সিজিটিএটিটিটিটিসিটিসিটিটিটিএটিএসিএসিএসিসি |
PinfSSR2 | 3 | 165-180 | এফ: পিইটি-সিজিএটিসিটিটিএটিসিএসিসিজিজিসি আর: জিটিটিটিজিসিটিটিজিজিএসিটিজিসিটিসিটিটিটিসিসি |
পাই 4 বি | 5 | 200-295 | ফ: পিইটি-এএএএটিএএসিসিটিটিটিজিজিটিটিসিএ আর: জিসিএএজিসিজিএজিজিটিটিটিজি TAGATT |
বিশ্লেষণের ফলাফলগুলি ভিজ্যুয়ালাইজ করার একটি উদাহরণ চিত্রটিতে দেখানো হয়েছে। Known. জেনেম্যাপার ৩.6 সফ্টওয়্যার ব্যবহার করে ফলাফলগুলি বিশিষ্ট বিচ্ছিন্নদের সাথে প্রাপ্ত তথ্যের তুলনা করে বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। বিশ্লেষণের ফলাফলগুলির ব্যাখ্যার সুবিধার্থে প্রতিটি গবেষণায় জানা জিনোটাইপের সাথে 3.7-1 রেফারেন্স বিচ্ছিন্নভাবে অন্তর্ভুক্ত করা প্রয়োজন।
প্রস্তাবিত গবেষণা পদ্ধতিটি উল্লেখযোগ্য সংখ্যক ক্ষেত্রের নমুনাগুলিতে পরীক্ষা করা হয়েছিল, তারপরে লেখকরা দুটি সংস্থার ল্যাবরেটরিজ, জেমস হাটন ইনস্টিটিউট (যুক্তরাজ্য) এবং ওয়াগেনিনজেন বিশ্ববিদ্যালয় এবং গবেষণা (নেদারল্যান্ডস) এর মধ্যে প্রোটোকলকে মানক করেছেন, পাশাপাশি সরলকরণের জন্য স্ট্যান্ডার্ড এফটিএ কার্ড ব্যবহারের সম্ভাবনার পাশাপাশি রয়েছে পি। ইনফেষ্টানস ডিএনএ নমুনাগুলির সংগ্রহ এবং চালানের ফলে এই বিকাশের বাণিজ্যিক ব্যবহারের সম্ভাবনা সম্পর্কে কথা বলা সম্ভব হয়েছিল। এছাড়াও, জিনোটাইপিংয়ের একটি দ্রুত এবং সঠিক পদ্ধতি মাল্টিপ্লেক্স এসএসআর বিশ্লেষণ ব্যবহার করে বিস্ফোরক বিচ্ছিন্ন আইসোলেটসকে বিশ্বব্যাপী এই প্যাথোজেনের জনসংখ্যার মানসম্মত অধ্যয়ন পরিচালনা করা এবং ইউকাবলাইট প্রকল্পের কাঠামোর (দ্য www.eucablight.org) কাঠামোর মধ্যে দেরী দুর্যোগে একটি বিশ্ব ডাটাবেস তৈরি করা সম্ভব করেছে। মাইক্রোসেটেলাইট বিশ্লেষণের ফলাফল সহ, বিশ্বজুড়ে নতুন জিনোটাইপগুলির উত্থান এবং বিস্তার ট্র্যাক করা সম্ভব করেছে।
পরিবর্ধিত সীমাবদ্ধতা খণ্ড দৈর্ঘ্য পলিমারফিজম (এএফএলপি)। এএফএলপি (পরিবর্ধিত খণ্ড দৈর্ঘ্যের পলিমারফিজম) নির্দিষ্ট প্রাইমারগুলি ব্যবহার করে এলোমেলো মলিকুলার মার্কার তৈরি করার একটি প্রযুক্তি। এএফএলপিতে, ডিএনএ দুটি সীমাবদ্ধ এনজাইমগুলির সংমিশ্রণে চিকিত্সা করা হয়। নির্দিষ্ট অ্যাডাপ্টারগুলি সীমাবদ্ধতার খণ্ডগুলির স্টিকি প্রান্তে আবদ্ধ থাকে।
এই টুকরোগুলি তখন অ্যাডাপ্টারের ক্রম এবং সীমাবদ্ধতার পরিপূরক হিসাবে প্রাইমারের সাহায্যে প্রশস্ত করা হয় এবং অতিরিক্তভাবে তাদের 3 'প্রান্তে এক বা একাধিক এলোমেলো ঘাঁটি বহন করে। প্রাপ্ত টুকরাগুলির সেট প্রাইমারের 3'-প্রান্তে সীমাবদ্ধ এনজাইম এবং এলোমেলোভাবে নির্বাচিত নিউক্লিওটাইডগুলির উপর নির্ভর করে (ভস এট আল, 1995)। এএফএলপি - জিনোটাইপিং বিভিন্ন জীবের জিনগত প্রকরণটি দ্রুত অধ্যয়ন করতে ব্যবহৃত হয়।
পদ্ধতিটির বিশদ বিবরণ মুয়েলার, ওল্ফেনবার্গার, ১৯৯৯, সাভেলকৌল এট আল।, ১৯৯৯-এর রচনায় দেওয়া হয়েছে। এএফএলপি এবং এসএসআর পদ্ধতির রেজোলিউশনের তুলনায় অনেক কাজ চীনা গবেষকরা করেছেন। উত্তর চীনের পাঁচটি অঞ্চলে সংগ্রহ করা 1999 পি। ইনফেষ্টান বিচ্ছিন্নতার ফেনোটাইপিক এবং জিনোটাইপিক বৈশিষ্ট্যগুলি অধ্যয়ন করা হয়েছিল। এসএসআর জিনোটাইপগুলির বিপরীতে এএফএলপি স্পেকট্রা দ্বারা আটটি পৃথক ডিএনএ জিনোটাইপগুলি চিহ্নিত করা হয়েছিল, যার জন্য কোনও বৈচিত্র প্রকাশিত হয়নি (গুও এট আল।, ২০০৮)।
মোবাইল উপাদানগুলির ক্রম অনুসারে প্রাইমারদের সাথে একত্রীকরণ
জিনগত ম্যাপিং, জেনেটিক বৈচিত্র্য এবং বিবর্তনমূলক প্রক্রিয়াগুলির গবেষণা (শুলম্যান, 2006) এর জন্য রেট্রোট্রান্সপসনগুলির ক্রমগুলি থেকে প্রাপ্ত মার্কারগুলি খুব সুবিধাজনক। যদি প্রাইমারগুলি নির্দিষ্ট মোবাইল উপাদানগুলির স্থিতিশীল ক্রমগুলির পরিপূরক তৈরি করা হয় তবে তাদের মধ্যে অবস্থিত জিনোম অঞ্চলগুলি প্রশস্ত করা সম্ভব। দেরিতে ব্লাইটির কার্যকারক এজেন্টের অধ্যয়নের ক্ষেত্রে জিনোমের অংশগুলিকে প্রশস্ত করার পদ্ধতিটি সাইন (সংক্ষিপ্ত আন্তঃ উপাদান নিউট্রিয়াল এলিমেন্টস) এর মূল অনুক্রমের প্রাথমিক পরিপূরক ব্যবহার করে সফলভাবে প্রয়োগ করা হয়েছিল (লাভ্রোভা এবং এলানস্কি, 2003)। এই পদ্ধতিটি ব্যবহার করে, পার্থক্য এমনকি এক বিচ্ছিন্নতার লিঙ্গীয় বংশের মধ্যেও প্রকাশিত হয়েছিল। এক্ষেত্রে, সিদ্ধান্ত নেওয়া হয়েছিল যে আন্তঃসাইন - পিসিআর পদ্ধতিটি অত্যন্ত নির্দিষ্ট এবং ফাইটোফোথোরা জিনোমে SINE উপাদানগুলির চলনের হার বেশি।
পি। ইনফেষ্টানসের জিনোমে, শর্ট রেট্রোট্রান্সপসসনের (এসআইএনই) 12 পরিবার চিহ্নিত করা হয়েছে; সংক্ষিপ্ত retrotransposons প্রজাতি বিতরণ তদন্ত করা হয়েছিল, উপাদান (SINEs) সনাক্ত করা হয়েছিল যেগুলি কেবলমাত্র পি ইনফেষ্টানসের জিনোমে পাওয়া যায় (লাভ্রোভা, 2004))
জনসংখ্যার অধ্যয়নের ক্ষেত্রে স্ট্রেনগুলির তুলনামূলক অধ্যয়নের পদ্ধতির প্রয়োগের বৈশিষ্ট্য
অধ্যয়নের পরিকল্পনা করার সময়, অবশ্যই এটি অবশ্যই লক্ষ্যগুলি অনুসরণ করবে এবং উপযুক্ত পদ্ধতিগুলি ব্যবহার করবে clearly সুতরাং, কিছু পদ্ধতি বিপুল সংখ্যক স্বতন্ত্র চিহ্নিতকারী চিহ্নগুলি তৈরি করতে দেয় তবে একই সাথে তাদের কম প্রজননযোগ্যতা রয়েছে এবং অধ্যয়নের অধীনে থাকা উপাদানগুলির ব্যবহৃত পুনঃসংশ্লিষ্ট, প্রতিক্রিয়া শর্ত এবং দূষণের উপর দৃ strongly়ভাবে নির্ভর করে। অতএব, স্ট্রেনের একটি গ্রুপের প্রতিটি গবেষণায়, বিভিন্ন স্ট্যান্ডার্ড (রেফারেন্স) বিচ্ছিন্নতা ব্যবহার করা প্রয়োজন, তবে এই ক্ষেত্রেও বেশ কয়েকটি পরীক্ষার ফলাফলগুলি একত্রিত করা খুব কঠিন।
এই গ্রুপের পদ্ধতির মধ্যে রয়েছে RAPD, AFLP, InterSSR, InterSINE PCR। পরিবর্ধনের পরে, বিভিন্ন আকারের ডিএনএ টুকরো বিপুল পরিমাণে প্রাপ্ত হয়। ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত স্ট্রেনগুলির মধ্যে পার্থক্য স্থাপন করার জন্য (পিতামাতার-বংশধর, বন্য-ধরণের মিউট্যান্টস, ইত্যাদি) যখন প্রয়োজন হয় বা কোনও ছোট নমুনার বিশদ বিশ্লেষণের প্রয়োজন হয় তখন এই জাতীয় কৌশলগুলি ব্যবহার করার পরামর্শ দেওয়া হয়। সুতরাং, এএফএলপি পদ্ধতিটি পি ইনফেসট্যান্সের জিনগত ম্যাপিংয়ে (ভ্যান ডের লি এট আল।, ১৯৯ in) এবং আন্তঃসংযোগ অধ্যয়নের (ন্যাপোভা, গিসি, ২০০২, কুক এট আল, ২০০৩, ফ্লেয়ার এট আল, ২০০৩) ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। স্ট্রেনের ডাটাবেস তৈরি করার সময় এই জাতীয় পদ্ধতিগুলি ব্যবহার করা অবৈধ বিভিন্ন পরীক্ষাগারে বিশ্লেষণ পরিচালনা করার সময় ফলাফলগুলির অ্যাকাউন্টিং একীভূত করা কার্যত অসম্ভব।
বাস্তবায়নের আপাতদৃষ্টিতে সরলতা এবং গতি (ভাল পরিশোধন ছাড়াই ডিএনএ বিচ্ছিন্নতা, পরিবর্ধন, ফলাফলের দৃশ্যায়ন) সত্ত্বেও, এই গ্রুপের পদ্ধতির ফলাফলগুলি দলিলের জন্য একটি বিশেষ পদ্ধতির ব্যবহার প্রয়োজন: লেবেলযুক্ত (তেজস্ক্রিয় বা লিউমেনসেন্ট) প্রাইমারের সাথে পলিয়াক্রাইমাইড জেলে পাতন এবং পরবর্তীকালে আলো বা তেজস্ক্রিয় পদার্থের এক্সপোজার। প্রচলিত এথিডিয়াম ব্রোমাইড আগারোজ জেল ইমেজিং সাধারণত এই পদ্ধতির জন্য উপযুক্ত নয় কারণ এটি বিভিন্ন আকারের বিশাল সংখ্যক ডিএনএ টুকরো ফিউজ করতে পারে।
অন্য পদ্ধতিগুলি বিপরীতে, আপনাকে খুব উচ্চ প্রজননযোগ্যতা সহ অল্প সংখ্যক বৈশিষ্ট্য তৈরি করতে দেয়। এই গোষ্ঠীর মধ্যে মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ হ্যাপ্লোটাইপস (কেবল দুটি হ্যাপ্লোকটাইপস আইএ এবং আইআইএ রাশিয়ায় উল্লেখ করা হয়েছে), সমষ্টি সংক্রান্ত প্রকার (বেশিরভাগ বিচ্ছিন্নতা 2 ধরণের বিভক্ত: এ 1 এবং এ 2, স্ব-উর্বর এসএফ খুব কমই পাওয়া যায়) এবং পেপটিডেস আইসোজাইম বর্ণালী (দুটি লোকী পিপ 1 এবং পেপ 2) অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। , প্রতিটি দুটি আইসোজাইম সমন্বিত) এবং গ্লুকোজ-6-ফসফেট আইসোমেরাজ (রাশিয়ায় এই বৈশিষ্ট্যের কোনও পরিবর্তনশীলতা নেই, যদিও বিশ্বের অন্যান্য দেশগুলিতে উল্লেখযোগ্য পলিমারফিজম লক্ষ করা যায়)। সংগ্রহ বিশ্লেষণ, আঞ্চলিক এবং বৈশ্বিক ডাটাবেস সংকলন করার সময় এই বৈশিষ্ট্যগুলি ব্যবহার করার পরামর্শ দেওয়া হচ্ছে। মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএর আইসোজাইমস এবং হ্যাপলোটাইপসের বিশ্লেষণের ক্ষেত্রে, স্ট্যান্ডার্ড স্ট্রেন ছাড়াই আদৌ করা সম্ভব, যখন সঙ্গমের প্রকারের বিশ্লেষণে, পরিচিত সঙ্গমের ধরণের দুটি পরীক্ষার বিচ্ছিন্নতা প্রয়োজন required
প্রতিক্রিয়া শর্ত এবং রিএজেন্টস কেবল ইলেক্ট্রোফোরেটোগ্রামে পণ্যটির বৈসাদৃশ্যকে প্রভাবিত করতে পারে; এই ধরণের গবেষণায় নিদর্শনগুলির প্রকাশ অসম্ভব।
বর্তমানে, রাশিয়ার ইউরোপীয় অঞ্চলে বেশিরভাগ জনসংখ্যা উভয় প্রকারের সঙ্গমের স্ট্রেন দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়েছে (ছক 6), তাদের মধ্যে মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএর IA এবং IIa প্রকারের বিচ্ছিন্নতা রয়েছে (বিশ্বের অন্যান্য ধরণের এমটিডিএনএ 1993 সালের পরে রাশিয়ায় পাওয়া যায় নি)। পেপটাইডেজ আইসোজাইমগুলির বর্ণালীটি পেপ 1 লোকাসের দুটি জিনোটাইপ দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করে (100/100, 92/92 এবং হিটারোজাইগোট 92/100, এবং 92/92 জিনোটাইপ অত্যন্ত বিরল (<0,3%)) এবং পেপ 2 লোকাসে দুটি জিনোটাইপ দ্বারা (100/100 112/112 এবং হিটারোজাইগোট 100/112, জিনোটাইপ 112/112 100/100 এর চেয়ে কম ঘন ঘন ঘটে থাকে তবে বেশিরভাগ ক্ষেত্রেও হয়)।
6-এর পরে গ্লুকোজ -1993-ফসফেট আইসোমেজ আইসোজিমের বর্ণালীতে কোনও পরিবর্তনশীলতা ছিল না (ক্লোনাল লাইন মার্কিন -1 নিখোঁজ হওয়া); সমস্ত অধ্যয়ন করা বিচ্ছিন্নতার 100/100 জিনোটাইপ ছিল (এলানস্কি এবং স্মিমনভ, 2002)।
তৃতীয় গ্রুপের পদ্ধতিগুলি উচ্চ প্রজননযোগ্যতার সাথে স্বতন্ত্র চিহ্নিতকারী অক্ষরগুলির একটি পর্যাপ্ত পরিমাণ অর্জন সম্ভব করে। আজ, এই গোষ্ঠীতে আরএফএলপি-আরজি57 প্রোব অন্তর্ভুক্ত রয়েছে যা বিভিন্ন আকারের 25-29 ডিএনএ টুকরো তৈরি করে। নমুনা বিশ্লেষণ এবং ডাটাবেসগুলি সংকলন করার সময় আরএফএলপি-আরজি57 উভয়ই ব্যবহৃত হতে পারে। তবে, এই পদ্ধতিটি পূর্বেরগুলির তুলনায় অনেক বেশি ব্যয়বহুল, এটি সময় সাপেক্ষ এবং এটির জন্য যথেষ্ট পরিমাণে অত্যন্ত বিশুদ্ধ ডিএনএ প্রয়োজন requires অতএব, গবেষক পরীক্ষিত উপাদানগুলির পরিমাণকে সীমাবদ্ধ করতে বাধ্য হন is
গত শতাব্দীর 57 এর দশকের গোড়ার দিকে আরএফএলপি-আরজি 90 এর বিকাশ দেরীতে দুর্যোগের কার্যকারক এজেন্টের জনসংখ্যা অধ্যয়নকে উল্লেখযোগ্যভাবে তীব্র করে তুলেছিল। এটি "ক্লোনাল লাইন" (নীচে দেখুন) নির্বাচন এবং বিশ্লেষণের ভিত্তিতে পদ্ধতির ভিত্তিতে পরিণত হয়েছিল। আরএফএলপি-আরজি57 এর সাথে সঙ্গমের ধরণ, ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিং (আরএফএলপি-আরজি 57 পদ্ধতি), পেপটিডেসের বর্ণালী এবং গ্লুকোজ -6-ফসফেট আইসোমেজ আইসোইনজাইমস এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ টাইপ ক্লোনাল লাইন সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। তাকে ধন্যবাদ, এটি আল।, 1994 দেখানো হয়েছিল), নতুন দ্বারা পুরানো জনগোষ্ঠীর প্রতিস্থাপন (ড্রেন্ট এট আল, 1993, সুজকোভস্কি এট আল, 1994, গুডউইন এট আল, 1995a) এবং বিশ্বের বহু দেশে বিরাজমান ক্লোনাল বংশগুলি চিহ্নিত করা হয়েছিল। এই পদ্ধতিটি ব্যবহার করে রাশিয়ান স্ট্রেনের অধ্যয়নগুলি ইউরোপীয় অংশের স্ট্রেনগুলির একটি উচ্চ জিনোটাইপিক পলিমারফিজম এবং রাশিয়ার এশীয় এবং সুদূর পূর্বাঞ্চলের জনসংখ্যার মনোমর্ফিজম দেখায় (এলানস্কি এট আল, 2001)। এবং এখন পি। ইনফেষ্টানসের জনসংখ্যা অধ্যয়নের ক্ষেত্রে এই পদ্ধতিটি প্রধান হিসাবে রয়ে গেছে। যাইহোক, এর প্রশস্ত বিতরণটি তার পরিবর্তে উচ্চ ব্যয় এবং কার্যকরকরণে শ্রমের তীব্রতায় বাধাগ্রস্ত হয়।
পি। ইনফেষ্টানস স্টাডিতে খুব কমই ব্যবহৃত হয় এমন একটি প্রতিশ্রুতিবদ্ধ কৌশল হ'ল মাইক্রোসেটেলাইট রিপিট (এসএসআর) বিশ্লেষণ। বর্তমানে, এই পদ্ধতিটি ক্লোনাল লাইনগুলি বিচ্ছিন্ন করতে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। স্ট্রেনগুলির বিশ্লেষণের জন্য, আলুর জাতগুলিতে ভাইরুলেন্স জিনের উপস্থিতি হিসাবে এ জাতীয় ফিনোটাইপিক চিহ্নগুলি (অ্যাভডি, 1995, ইভানুক এট আল।, 2002, উলানোয়া এট আল।, 2003) এবং টমেটো ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হত (এবং ব্যবহার অব্যাহত থাকে)। এখন অবধি, আলুর জাতগুলিতে ভাইরুলেন্সের জিনগুলি জনসংখ্যার অধ্যয়নের জন্য চিহ্নিতকারী বৈশিষ্ট্য হিসাবে তাদের সংখ্যা হ্রাস পেয়েছে, বিস্তৃত সংখ্যাগরিষ্ঠ অঞ্চলে সর্বাধিক (বা এটির কাছাকাছি) সংখ্যক ভাইরুলেন্স জিনের উপস্থিতির কারণে। একই সময়ে, টমেটো চাষের জন্য টি 1 ভাইরালেন্স জিনটি সম্পর্কিত পিএইচ 1 জিন বহন করে এখনও সফলভাবে চিহ্নিতকারী বৈশিষ্ট্য হিসাবে ব্যবহৃত হয় (লাভ্রোভা এট আল।, 2003; উলানোয়া এট আল।, 2003))
অনেক কাজে, ছত্রাকনাশকের প্রতিরোধকে চিহ্নিতকারী বৈশিষ্ট্য হিসাবে ব্যবহৃত হয়। এই বৈশিষ্ট্যটি ক্ষেত্রের ছত্রাকনাশকযুক্ত মেটাল্যাক্সেল- (বা মেফেনোক্সাম-) প্রয়োগের পরে ক্লোনাল লাইনে প্রতিরোধের মিউটেশনের পরিবর্তে সহজ উপস্থিতির কারণে জনসংখ্যার অধ্যয়নের ক্ষেত্রে অবাঞ্ছিত is উদাহরণস্বরূপ, প্রতিরোধের স্তরের উল্লেখযোগ্য পার্থক্যগুলি সিব 1 ক্লোনাল লাইনের (এলানস্কি এট আল।, 2001) এর মধ্যে দেখানো হয়েছিল।
সুতরাং, সংগ্রহের ধরণ, পেপটিডেস আইসোইনজাইম বর্ণালী, মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ টাইপ, আরএফএলপি-আরজি57, এসএসআর সংগ্রহের ক্ষেত্রে ডেটা ব্যাংক তৈরি এবং লেবেল স্ট্রেনের জন্য পছন্দের চিহ্নিতকারী বৈশিষ্ট্য। সীমিত নমুনাগুলির তুলনা করতে, যদি সর্বাধিক সংখ্যক চিহ্নিতকারী বৈশিষ্ট্য ব্যবহার করা প্রয়োজন হয়, আপনি এএফএলপি, আরএপিডি, ইন্টারএসএসআর, আন্তঃসাইন পিসিআর (সারণী 5) ব্যবহার করতে পারেন। যাইহোক, এটি মনে রাখা উচিত যে এই পদ্ধতিগুলি দুর্বল প্রজননযোগ্য, এবং প্রতিটি পৃথক পরীক্ষায় (পরিবর্ধন বৈদ্যুতিন চক্র), বেশ কয়েকটি রেফারেন্স বিচ্ছিন্নতা অবশ্যই ব্যবহার করা উচিত।
সারণী 5. স্ট্রেনের গবেষণার বিভিন্ন পদ্ধতির তুলনা পি। ইনফেষ্টানস
নির্ণায়ক | হিজড়া | আইসোফার পুলিশ | এমটিডিএনএ | আরএফএলপি-আরজি57 | আরএপিডি | আইএসএসআর | SSR | এএফএলপি | এনজিনের পার |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
তথ্যের পরিমাণ | Н | Н | Н | С | В | В | С | В | В |
পুনরুত্পাদনযোগ্যতা | В | В | В | В | Н | Н | С | С | С |
শৈল্পিক সম্ভাবনা | Н | Н | Н | Н | В | С | Н | С | В |
খরচ | Н | С | Н | В | Н | Н | Н | С | Н |
শ্রমের তীব্রতা | Н | Н | Н | В | এনএস * | এনএস * | Н | С | এনএস * |
বিশ্লেষণের গতি ** | В | Н | Н | С | Н | Н | Н | Н | Н |
দ্রষ্টব্য: এইচ - নিম্ন, সি - মাঝারি, বি - উচ্চ; НС * - আগারোজ জেল বা স্বয়ংক্রিয় ব্যবহার করার সময় শ্রমের তীব্রতা কম
জিনোটাইপার, মাঝারি - লেবেলযুক্ত প্রাইমারের সাথে পলিয়াক্রাইমাইড জেল মধ্যে পাতন দ্বারা,
** - ডিএনএ বিচ্ছিন্নতার জন্য মাইসেলিয়াম বৃদ্ধিতে ব্যয় করা সময় গণনা করা হচ্ছে না।
জনসংখ্যা কাঠামো
ক্লোনাল লাইন
পুনর্গঠন বা জনসংখ্যার কাঠামোর ক্ষেত্রে তাত্পর্যপূর্ণ অবদানের অভাবে, জনসংখ্যার একটি নির্দিষ্ট সংখ্যক ক্লোন, জেনেটিক এক্সচেঞ্জ থাকে যার মধ্যে অত্যন্ত বিরল।
এই জনসংখ্যায়, পৃথক জিনের ফ্রিকোয়েন্সি নয়, জিনোটাইপের ফ্রিকোয়েন্সিগুলির একটি সাধারণ উত্স (ক্লোনাল বংশ বা ক্লোনাল বংশ) অধ্যয়ন করার জন্য এটি আরও তথ্যপূর্ণ। শেষ শতাব্দীর 57 এর দশকের গোড়ার দিকে আরএফএলপি-আরজি 90 পদ্ধতির আবির্ভাবের পরে দেরী ব্লাইট প্যাথোজেনের জনসংখ্যা অধ্যয়ন এবং ক্লোনাল লাইনের বিশ্লেষণ উল্লেখযোগ্যভাবে ত্বরান্বিত হয়েছে। আরএফএলপি-আরজি57 এর সাথে মিলনের ধরণ, পেপটিডেসের বর্ণালী এবং গ্লুকোজ -6-ফসফেট আইসোমেজ আইসোএনজাইমস এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ টাইপ ক্লোনাল লাইনগুলি সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। সর্বাধিক সাধারণ ক্লোনাল লাইনের বৈশিষ্ট্যগুলি সারণি 6 এ দেখানো হয়েছে।
ক্লোন ইউএস -1 আশির দশকের শেষ অবধি সর্বত্র জনগণের উপর আধিপত্য বিস্তার করেছিল, এরপরে এটি অন্যান্য ক্লোনগুলির দ্বারা প্রতিস্থাপন করা শুরু করে এবং ইউরোপ এবং উত্তর আমেরিকা থেকে অদৃশ্য হয়ে যায়। এটি এখন আফ্রিকার সুদূর পূর্ব (ফিলিপাইন, তাইওয়ান, চীন, জাপান, কোরিয়া, কোহ এট আল।, 80, মোসা এট আল, 1994) তে পাওয়া যায় (উগান্ডা, কেনিয়া, রুয়ান্ডা, গুডউইন এট আল, 1993, ভেগা-সানচেজ এবং আল।, 1994; ওচও এট এল।, 2000) এবং দক্ষিণ আমেরিকাতে (ইকুয়েডর, ব্রাজিল, পেরু, ফোর্বস এট আল।, 2002, গুডউইন এট আল।, 1997)। ইউএস -১ লাইনের অন্তর্ভুক্ত কোনও স্ট্রেন কেবল অস্ট্রেলিয়ায় সনাক্ত করা যায়নি। স্পষ্টতই, পি। ইনফেষ্টানস বিচ্ছিন্নভাবে অস্ট্রেলিয়ায় চলে এসেছিল অন্য এক waveেউয়ের স্থান (গুডউইন, 1994)।
ক্লোন ইউএস -6 ১৯ 70০-এর দশকের শেষদিকে উত্তর মেক্সিকো থেকে ক্যালিফোর্নিয়ায় চলে এসেছিল এবং সেখানে বিনা রোগে 32 বছর পরে আলু এবং টমেটোতে মহামারী দেখা দিয়েছে। উচ্চ আগ্রাসনের কারণে, এটি ইউএস -১ এর ক্লোনটি প্রতিস্থাপন করে এবং মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের পশ্চিম উপকূলে আধিপত্য বিস্তার শুরু করে (গুডউইন এট আল।, 1a)।
মার্কিন -7 এবং ইউএস -8 জিনোটাইপগুলি 1992 সালে মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে আবিষ্কার হয়েছিল এবং ইতিমধ্যে 1994 সালে মার্কিন যুক্তরাষ্ট্র এবং কানাডায় বিস্তৃত হয়েছিল। এক ক্ষেত্রের মরসুমে, ক্লোন ইউএস -8 সম্পূর্ণভাবে সমান ঘনত্বের ক্ষেত্রে উভয় ক্লোন সংক্রামিত আলু প্লোটগুলিতে ক্লোন ইউএস -1 প্রায় সম্পূর্ণরূপে স্থানান্তরিত করতে সক্ষম হয় (মিলার এবং জনসন, 2000)।
বিসি -1 থেকে বিসি -4 ক্লোনগুলি গুডউইন এট আল। 1995 বি থেকে অল্প সংখ্যক বিচ্ছিন্নভাবে ব্রিটিশ কলম্বিয়াতে চিহ্নিত করা হয়েছিল)। মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে ক্লোন ইউএস -11 ব্যাপকভাবে ছড়িয়ে পড়ে এবং তাইওয়ানে ইউএস -1 সরবরাহ করে। ক্লোন জেপি -1 এবং ইসি -1, ক্লোন ইউএস -1 সহ যথাক্রমে জাপান এবং ইকুয়েডরে প্রচলিত (কোহ এট আল।, 1994; ফোর্বস এট আল।, 1997)।
এসআইবি -১ হ'ল একটি ক্লোন যা মস্কো অঞ্চল থেকে সাখালিন পর্যন্ত বিস্তীর্ণ অঞ্চল জুড়ে রাশিয়ায় ছিল। মস্কো অঞ্চলে এটি ১৯৯৩ সালে আবিষ্কৃত হয়েছিল এবং কিছু ক্ষেত্রের জনসংখ্যার মধ্যে মূলত এই ক্লোনাল লাইনের স্ট্রেন ছিল, যা ধাতবক্ষের প্রতিরোধী অত্যন্ত প্রতিরোধী ছিল। 1 এর পরে, এই ক্লোনটির প্রকোপটি উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস পেয়েছে। 1993-1993-এ ইউরালদের বাইরে, এসআইবি -1997 খবরোভস্ক টেরিটরি বাদ দিয়ে সর্বত্র পাওয়া গেল (এসআইবি -1998 ক্লোনটি সেখানে বিস্তৃত)। বিভিন্ন ধরণের সঙ্গমের সাথে ক্লোনগুলির স্থানিক পৃথকীকরণ সাইবেরিয়া এবং সুদূর পূর্বের যৌন প্রক্রিয়া বাদ দেয়। সাইবেরিয়ার বিপরীতে মস্কো অঞ্চলে, জনসংখ্যা অনেকগুলি ক্লোন দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়; প্রায় প্রতিটি বিচ্ছিন্নতার একটি অনন্য মাল্টিলোকাস জিনোটাইপ রয়েছে (এলানস্কি এট আল।, 1, 2)। আমদানিকৃত বীজ উপাদান দিয়ে বিশ্বের বিভিন্ন অঞ্চল থেকে ছত্রাকের স্ট্রেন আমদানি করে এই বৈচিত্রটি ব্যাখ্যা করা যায় না। যেহেতু উভয় প্রকারের সঙ্গমে জনগোষ্ঠীতে সংঘটিত হয়, এটি সম্ভব হয় যে এর বৈচিত্রটিও পুনঃসংযোগের কারণে। সুতরাং, ব্রিটিশ কলম্বিয়াতে, বিসি -2001, বিসি -2015, এবং বিসি -2 জিনোটাইপগুলির উত্থান বিসি -3 এবং মার্কিন -4 (গুডউইন এট আল।, 1 বি) ক্লোনগুলির সংকরকরণের কারণে অনুমান করা হয়। সম্ভবত মস্কোর জনসংখ্যায় হাইব্রিড স্ট্রেনগুলি পাওয়া যায়। উদাহরণস্বরূপ, পিইপি লোকসের জন্য স্ট্রেন এমও -6, এমও -1995 এবং এমও -4 হিটারোজাইগস স্ট্রেন এমও -8, এমও -11, এমও -12-এর মধ্যে সংশ্লেষ হতে পারে, পি-পি লোকসের এক এলিল এবং স্ট্রেনের জন্য এ 21 জোড়া টাইপ এবং সমজাতীয় থাকতে পারে having MO-22, এ 2 জনের মিলনের ধরণের এবং পঙ্গুর অন্যান্য অ্যালিলের জন্য সমজাতীয় having এবং যদি এটি হয়, এবং পি। ইনফেষ্টানদের আধুনিক জনগোষ্ঠীতে যৌন প্রক্রিয়ার ভূমিকা বৃদ্ধির প্রবণতা দেখা দেয়, তবে মাল্টিলোকাস ক্লোনসের বিশ্লেষণের তথ্যের মান হ্রাস পাবে (এলানস্কি এট আল।, 8, 1)।
ক্লোনাল লাইনে বিভিন্নতা
বিশ শতকের 90 এর দশক অবধি ক্লোনাল লাইন ইউএস -20 বিশ্বজুড়ে বিস্তৃত ছিল। বেশিরভাগ ক্ষেত্র এবং আঞ্চলিক জনসংখ্যা ইউএস -1 জিনোটাইপের সাথে একচেটিয়াভাবে স্ট্রেনের সমন্বিত। তবে, বিচ্ছিন্নতার মধ্যে পার্থক্যগুলিও পরিলক্ষিত হয়েছিল, সম্ভবত সম্ভবত কোনও মিউটেশন প্রক্রিয়া থেকেই ঘটে। পারমাণবিক এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ উভয় ক্ষেত্রেই মিউটেশন ঘটেছিল এবং অন্যান্য জিনিসগুলির মধ্যে ফেনিলামাইড ড্রাগগুলির প্রতিরোধের মাত্রা এবং ভাইরুলেন্স জিনের সংখ্যাও প্রভাবিত হয়েছিল। রূপসমূহ দ্বারা মূল জিনোটাইপগুলির থেকে পৃথক লাইনগুলি মূল জিনোটাইপের নাম অনুসারে বিন্দুর পরে অতিরিক্ত সংখ্যা দ্বারা নির্দেশিত হয় (উদাহরণস্বরূপ, ক্লোনাল লাইনের US-1 এর US-1.1 মিউট্যান্ট লাইন)। ফিঙ্গারপ্রিন্টিং ডিএনএ লাইনের US-1 এবং US-1.5 এ বিভিন্ন আকারের আনুষঙ্গিক লাইন থাকে (গুডউইন এট আল।, 1.6a, 1995 বি); ক্লোনাল লাইন US-1995 এছাড়াও একটি আনুষঙ্গিক লাইনে মার্কিন -6.3 থেকে আলাদা (গুডউইন, 6, সারণী 1997)।
মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ অধ্যয়ন করার সময়, সন্ধান করা হয়েছিল যে ক্লোনাল লাইনের ইউএস -1 (কার্টার এট আল।, 1) -তে টাইপ 1990 বি মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ পাওয়া যায়। যাইহোক, পেরু এবং ফিলিপিন্সের এই ক্লোনাল বংশের স্ট্রেনগুলির অধ্যয়নের মধ্যে, বিচ্ছিন্নভাবে পাওয়া গেছে যাদের মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ টাইপগুলি সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলার উপস্থিতিতে 1 বি থেকে পৃথক ছিল (গুডউইন, 1991, কোহ এট আল, 1994)।
সারণি 6. কিছু পি। ইনফেষ্টান ক্লোনাল লাইনের মাল্টিলোকাস জিনোটাইপগুলি
নাম | সঙ্গমের ধরণ | আইসোজাইমস | ডিএনএ আঙুলের ছাপ | এমটিডিএনএ টাইপ | |
জিপিআই | PEP | ||||
ইউএস-1 | А1 | 86/100 | 92/100 | 1.0111010110011E + + 24 | Ib |
ইউএস-2 | А1 | 86/100 | 92/100 | 1.0111010010011E + + 24 | - |
ইউএস-3 | А1 | 86/100 | 92/100 | 1.0111000000011E + + 24 | - |
ইউএস-4 | А1 | 100/100 | 92/92 | 1.0111010010011E + + 24 | - |
ইউএস-5 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1.0111010010011E + + 24 | - |
ইউএস-6 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1.0111110010011E + + 24 | IIb |
ইউএস-7 | A2 | 100/111 | 100/100 | 1.0011000010011E + + 24 | Ia |
ইউএস-8 | A2 | 100/111/122 | 100/100 | 1.0011000010011E + + 24 | Ia |
ইউএস-9 | A1 | 100/100 | 83/100 | * | - |
ইউএস-10 | A2 | 111/122 | 100/100 | - | - |
ইউএস-11 | A1 | 100/111 | 92/100 | 1.0101110010011E + + 24 | IIb |
ইউএস-12 | A1 | 100/111 | 92/100 | 1.0001000010011E + + 24 | - |
ইউএস-14 | A2 | 100/122 | 100/100 | 1.0000000000011E + + 24 | - |
ইউএস-15 | A2 | 100/100 | 92/100 | 1.0001000010011E + + 24 | Ia |
ইউএস-16 | A1 | 100/111 | 100/100 | 1.0001100010011E + + 24 | - |
ইউএস-17 | A1 | 100/122 | 100/100 | 1.0100010000011E + + 24 | - |
ইউএস-18 | A2 | 100/100 | 92/100 | 1.0001000010011E + + 24 | Ia |
ইউএস-19 | A2 | 100/100 | 92/100 | 1.0101010000011E + + 24 | Ia |
ইসি-1 | A1 | 90/100 | 96/100 | 1.1111010010011E + + 24 | IIa |
এসআইবি -১ | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0001000110011E + + 24 | IIa |
এসআইবি -১ | A2 | 100/100 | 100/100 | 1.0001000010011E + + 24 | IIa |
এসআইবি -১ | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.1001010100011E + + 24 | IIa |
মো-1 | A2 | 100/100 | 100/100 | 1.0001000110011E + + 24 | IIa |
মো-2 | A2 | 100/100 | 100/100 | 1.0001000010011E + + 24 | Ia |
মো-3 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0101000010011E + + 24 | IIa |
মো-4 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1.0101110110011E + + 24 | IIa |
মো-5 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0001010010011E + + 24 | IIa |
মো-6 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0101010010011E + + 24 | Ia |
মো-7 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1.0001000110011E + + 24 | IIa |
মো-8 | A1 | 100/100 | 92/92 | 1.0101100010011E + + 24 | IIa |
মো-9 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1.0001000010011E + + 24 | IIa |
মো-10 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0101100000011E + + 24 | Ia |
মো-11 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1.0101010010011E + + 24 | Ia |
মো-12 | A2 | 100/100 | 100/100 | 1.0101010010011E + + 24 | Ia |
মো-13 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0101010000011E + + 24 | Ia |
মো-14 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.01010010011E + + 22 | Ia |
মো-15 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.101110010011E + + 23 | Ia |
মো-16 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0001000000011E + + 24 | IIa |
মো-17 | A1 | 86/100 | 100/100 | 1.0101010110011E + + 24 | Ib |
মো-18 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0101110010011E + + 24 | IIa |
মো-19 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1.0101010000011E + + 24 | IIa |
মো-20 | A2 | 100/100 | 100/100 | 1.0101010000011E + + 24 | IIa |
মো-21 | A2 | 100/100 | 100/100 | 1.0101010000011E + + 24 | IIa |
দ্রষ্টব্য: * - কোনও তথ্য নেই।
সারণী Mul. মাল্টিলোকোকাস জিনোটাইপ এবং তাদের মিউট্যান্ট লাইন
নাম | সঙ্গমের ধরণ | | ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্ট (আরজি 57) | নোট | |
জিপিআই | পিইপি -১ | ||||
ইউএস-1 | А1 | 86/100 | 92/100 | 1011101011001101000110011 | মূল জিনোটাইপ 1 |
ইউএস-1.1 | A1 | 86/100 | 100/100 | 1011101011001101000110011 | পিইপিতে মিউটেশন |
ইউএস-1.2 | A1 | 86/100 | 92/100 | 1011101010001101000110011 | RG57 এ রূপান্তর |
ইউএস-1.3 | A1 | 86/100 | 92/100 | 1011101001001101000110011 | RG57 এ রূপান্তর |
ইউএস-1.4 | A1 | 86/100 | 100/100 | 1011101010001101000110011 | RG57 এবং PEP এ রূপান্তর |
ইউএস-1.5 | A1 | 86/100 | 92/100 | 1011101011001101010110011 | RG57 এ রূপান্তর |
ইউএস-6 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1011111001001100010110011 | মূল জিনোটাইপ 2 |
ইউএস-6.1 | A1 | 100/100 | 92 /92 | 1011111001001100010110011 | পিইপিতে মিউটেশন |
ইউএস-6.2 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1011101001001100010110011 | RG57 এ রূপান্তর |
ইউএস-6.3 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1011111001011100010110011 | RG57 এ রূপান্তর |
ইউএস-6.4 | A1 | 100/100 | 100/100 | 1011011001001100010110011 | RG57 এবং PEP এ রূপান্তর |
ইউএস-6.5 | A1 | 100/100 | 92/100 | 1011111001001100010010011 | RG57 এ রূপান্তর |
বিআর 1 | A2 | 100/100 | 100/100 | 1011101000001100001111011 | মূল জিনোটাইপ 3 |
বিআর 1.1 | A2 | 100/100 | 100/100 | 1010101000001100001110011 | RG57 এ রূপান্তর |
আইসোজিমের বর্ণালীতেও পরিবর্তন রয়েছে। একটি নিয়ম হিসাবে, এগুলি এনজাইমকে হোমোজাইগাসগুলিতে প্রাথমিকভাবে ভিন্নজগতের ভাঙ্গনের ফলে এগুলি হয়। 1993 সালে, টমেটো ফলের উপর, আমরা ইউএস -1: আরজি 57 ফিঙ্গারপ্রিন্টিং, মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ টাইপ এবং 86/100 জিনোটাইপ-গ্লুকোজ-6-ফসফ্যাটি-আইসোমেজের বৈশিষ্ট্যযুক্ত একটি স্ট্রেন চিহ্নিত করেছিলাম, তবে এটি প্রথম পেপটিডেস লোকসের পরিবর্তে হোমোজাইগাস (100/100) ছিল এই ক্লোনাল লাইনের একটি 92/100 হিটারোজাইগোট সাধারণত ical আমরা এই স্ট্রেনের জিনোটাইপটির নাম রেখেছি এমও -17 (সারণী 6)। প্রথম পেপটিডেস লোকস (টেবিল)) তে রূপান্তরকারীদের দ্বারা মিউট্যান্ট লাইনগুলি US-1.1 এবং US-1.4 এ US-1 থেকে পৃথক হয়।
আলু এবং টমেটো জাতের জন্য ভাইরুলেন্স জিনের সংখ্যার পরিবর্তনের জন্য মিউটেশনগুলি বেশ সাধারণ। নেদারল্যান্ডসের জনসংখ্যায় ইউএস -১ এর ক্লোনাল রেখার বিচ্ছিন্নতার মধ্যে তাদের নাম উল্লেখ করা হয়েছিল (ড্রেন্ট এট আল।, 1), পেরু (গুডউইন এট আল। ।, 1994 বি)। রাশিয়ার এশীয় অংশের এসআইবি -১ লাইনের বিচ্ছিন্নতার মধ্যে কানাডা এবং আমেরিকার ক্লোনাল লাইনের ইউএস--এবং ইউএস -৮ (গুডউইন এট আল। )।
ফেনিলাইমাইড ড্রাগের প্রতিরোধের মাত্রার দৃ strong় পার্থক্যের সাথে বিচ্ছিন্নতাগুলি একরঙা ক্ষেত্রের জনসংখ্যায় চিহ্নিত করা হয়েছিল, যার সবগুলিই ক্লোনাল লাইন সিব -১ (এলানস্কি এট আল, 1, সারণী 2001) এর অন্তর্গত। ক্লোনাল লাইনের US-1 এর প্রায় সমস্ত স্ট্রেনগুলি মেটালাক্সিলের পক্ষে অত্যন্ত সংবেদনশীল; তবে, এই লাইনের অত্যন্ত প্রতিরোধী বিচ্ছিন্নতা ফিলিপিন্সে (কোহ এট আল।, 1) এবং আয়ারল্যান্ডে বিচ্ছিন্ন ছিল (গুডউইন এট আল।, 1994) 1996
পি। ইনফেষ্টানসের আধুনিক জনসংখ্যা
মধ্য আমেরিকা (মেক্সিকো)
মেক্সিকোয় পি। ইনফেষ্টানসের জনসংখ্যা অন্যান্য বিশ্বের জনসংখ্যার থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে পৃথক, যা মূলত এটির historicalতিহাসিক অবস্থানের কারণে। এই জনসংখ্যার অসংখ্য গবেষণা এবং সম্পর্কিত পি। ইনফেষ্টান প্রজাতির ক্লাড ফাইটোফোথোরা, পাশাপাশি সোলানাম প্রজাতির স্থানীয় প্রজাতি, এই সিদ্ধান্তে পৌঁছেছিল যে মেক্সিকোের কেন্দ্রীয় অংশে প্যাথোজেনের বিবর্তন হোস্ট গাছগুলির বিবর্তনের সাথে সংঘটিত হয়েছিল এবং যৌন পুনর্বাসনের সাথে জড়িত ছিল (গ্রানওয়াল্ড, ফ্লেয়ার) , 2005)। উভয় প্রকারের মিলন জনসংখ্যায় এবং সমান অনুপাতের মধ্যে এবং আলু এবং বন্য-বর্ধমান সম্পর্কিত প্রজাতির উদ্ভিদ এবং কন্দগুলিতে মাটিতে ওস্পোরসের উপস্থিতি সোলানাম জনসংখ্যায় যৌন প্রক্রিয়ার উপস্থিতি নিশ্চিত করে (ফার্নান্দেজ-পাভিয়া এট আল।, ২০০২)। টোলুকা উপত্যকা এবং এর পরিবেশ সম্পর্কে সাম্প্রতিক গবেষণা (প্যাথোজেনের উত্সের অনুমানক কেন্দ্র) স্থানীয়ভাবে পি। ইনফেসট্যান্সের স্থানীয় জনসংখ্যার উচ্চ বংশগত বৈচিত্র্য (2002 নমুনার নমুনায় 134 মাল্টিলোকাস জিনোটাইপস) এবং অঞ্চলে কয়েকটি পৃথক উপ-জনগোষ্ঠীর উপস্থিতি নিশ্চিত করেছে (ওয়াং এট আল।, 176)। এই পার্থক্যের ক্ষেত্রে অবদান রাখার কারণগুলি হ'ল মধ্য মেক্সিকোয় পার্বত্য অঞ্চলের উপনিবেশের স্থানিক বিভাজন, উপত্যকাগুলি এবং পর্বতমালায় ব্যবহৃত আলুর জাতের চাষের পরিস্থিতি এবং বন্য কন্দযুক্ত সোলানাম প্রজাতির উপস্থিতি যা বিকল্প হোস্ট হিসাবে কাজ করতে পারে (ফ্রাই এট আল ।, 2017)।
তবে, এটি লক্ষ করা উচিত যে উত্তর মেক্সিকোতে পি। ইনফেষ্টানসের জনসংখ্যা প্রকৃতির চেয়ে বেশি এবং উত্তর আমেরিকার জনসংখ্যার সাথে সমান, যা ইঙ্গিত দিতে পারে যে এটি নতুন জিনোটাইপস (ফ্রাই এট আল।, ২০০৯)।
উত্তর আমেরিকা
পি। ইনফেষ্টানদের উত্তর আমেরিকার জনসংখ্যার সর্বদা খুব সাধারণ কাঠামো ছিল এবং তাদের ক্লোনাল চরিত্রটি মাইক্রোসেটেল বিশ্লেষণের ব্যবহারের অনেক আগে প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল। 1987 অবধি, মার্কিন যুক্তরাষ্ট্র এবং কানাডায় ক্লোনাল লাইন ইউএস -1 আধিপত্য ছিল (গুডউইন এট আল।, 1995)। ১৯ 70০-এর দশকের মাঝামাঝি, যখন মেটালাক্সিল-ভিত্তিক ছত্রাকনাশক উপস্থিত হয়েছিল, এই ক্লোনটি মেক্সিকো থেকে স্থানান্তরিত অন্যান্য, আরও প্রতিরোধী জিনোটাইপগুলি দ্বারা প্রতিস্থাপন করা শুরু করে (গুডউইন এট আল।, 1998)। 90 এর দশকের শেষে। ইউএস -৮ জিনোটাইপ মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে ইউএস -১ জিনোটাইপকে পুরোপুরি প্রতিস্থাপন করে এবং আলুতে প্রভাবশালী ক্লোনাল লাইনে পরিণত হয় (ফ্রাই এট আল।, ২০০৯; ফ্রাই এট আল।, ২০১৫)। টমেটোগুলির সাথে পরিস্থিতি আলাদা ছিল, যা ক্রমাগত বেশ কয়েকটি ক্লোনাল লাইন থাকে এবং তাদের রচনাটি বছরের পর বছর পরিবর্তিত হয় (ফ্রাই এট আল।, ২০০৯)।
২০০৯ সালে, টমেটোতে যুক্তরাষ্ট্রে দেরিতে ব্লাইটের একটি বৃহত আকারের মহামারী শুরু হয়েছিল। এই মহামারীটির একটি বৈশিষ্ট্য ছিল উত্তর আমেরিকা যুক্তরাষ্ট্রের অনেক জায়গায় এটি প্রায় একইসাথে শুরু হয়েছিল এবং এটি বড় উদ্যান কেন্দ্রগুলিতে সংক্রামিত টমেটো চারাগুলির ব্যাপক বিক্রয়ের সাথে জড়িত বলে প্রমাণিত হয়েছিল (ফ্রাই এট আল।, ২০১৩)। ফসলের ক্ষয়ক্ষতি ছিল প্রচুর। আক্রান্ত নমুনাগুলির মাইক্রোসেটেল বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে মহামারীটি স্ট্রোন ক্লোনাল লাইনের US-2009 A2013- প্রকারের সঙ্গমের অন্তর্গত। ২০০৯-এ, আমেরিকান জনগণের পি। ইনফেষ্টানসে এই জিনোটাইপের অংশ ৮০% (ফ্রাই এট আল।, ২০১৩) পৌঁছেছে। পরবর্তী বছরগুলিতে, আক্রমণাত্মক জিনোটাইপগুলির অনুপাত মার্কিন -৩৩ (প্রধানত টমেটোগুলিতে) এবং মার্কিন -৪৪ (আলুর উপর) জনসংখ্যায় অবিচ্ছিন্নভাবে বৃদ্ধি পেয়েছে, তবে, ২০১১ সালের পরে, ইউএস -৪৪ সনাক্তকরণের হার উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস পেয়েছে এবং আজ অবধি, রোগজীবাণু জনসংখ্যার প্রায় 22% মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে ইউএস -৩৩ জিনোটাইপ (ফ্রাই এট আল।, ২০১৫) দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়।
কানাডায়, মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের মতো, 90 এর দশকের শেষে। প্রভাবশালী জিনোটাইপ ইউএস -1 মার্কিন -8 দ্বারা অনুপ্রবেশ করা হয়েছিল, এর প্রভাবশালী অবস্থানটি ২০০৮ অবধি অপরিবর্তিত ছিল। কানাডায় সংক্রামিত টমেটো চারা বিক্রির সাথে জড়িত মারাত্মক দুর্যোগ মহামারী দেখা গিয়েছিল, তবে এগুলি ইউএস -৩৩ এবং ইউএস -৮ (কালিস্কুক এট আল।, ২০১২) জিনোটাইপগুলির কারণে হয়েছিল। এই জিনোটাইপগুলির স্পষ্ট ভৌগলিক পার্থক্য লক্ষণীয় ছিল: মার্কিন -৩৩ কানাডার পশ্চিমাঞ্চলীয় প্রদেশগুলিতে (%।%) আধিপত্য বিস্তার করেছিল, আর ইউএস -৮ পূর্ব প্রদেশগুলিতে আধিপত্য বিস্তার করেছিল (৮%%)। পরবর্তী বছরগুলিতে, ইউএস -৩৩ পূর্ব অঞ্চলে ছড়িয়ে পড়ে; তবে সাধারণভাবে, জনসংখ্যার অংশের অংশটি দেশে জিনোটাইপগুলির ইউএস -২২ এবং ইউএস -২৪ উপস্থিতির পটভূমির তুলনায় কিছুটা হ্রাস পেয়েছে (পিটারস এট আল।, ২০১৪)। আজ অবধি, মার্কিন -৩৩ পুরো কানাডায় একটি প্রভাবশালী অবস্থান বজায় রেখেছে; ইউএস -2008 ব্রিটিশ কলম্বিয়াতে উপস্থিত রয়েছে, ইউএস -৩৩ এবং ইউএস -৪৪ অন্টারিওতে উপস্থিত রয়েছে (পিটারস, 2009)।
সুতরাং, পি। ইনফেষ্টানদের উত্তর আমেরিকার জনসংখ্যা মূলত ক্লোনাল লাইন। গত ৪০ বছরে সনাক্তকৃত ক্লোনাল জিনোটাইপগুলির সংখ্যা ২৪ এ পৌঁছেছে। উভয় প্রকারের সঙ্গমের স্ট্রেন জনগোষ্ঠীতে উপস্থিত থাকা সত্ত্বেও, যৌন পুনঃসংশোধনের ফলস্বরূপ নতুন জিনোটাইপগুলির উদ্ভব হওয়ার সম্ভাবনা বরং কম রয়েছে। তবুও, বিগত 40 বছরে, সাময়িক পুনঃসংযোগ জনগোষ্ঠীর উপস্থিতির বেশ কয়েকটি কেস রেকর্ড করা হয়েছে (গ্যাভিনো এট আল।, 24; ড্যানিজ এট আল।, 20; পিটারস এট আল।, 2000) এবং একটি ক্ষেত্রে, ক্রসিংয়ের ফলাফলটি জিনোটাইপ ইউএস -2014 ছিল যা উত্তর আমেরিকাতে বহু বছর ধরে আবদ্ধ ছিল (গ্যাভিনো এট আল।, 2014)। ২০০৯ অবধি জনসংখ্যার কাঠামোর পরিবর্তনগুলি পরবর্তী পরবর্তী প্রভাবশালী পূর্বসূরিদের স্থানান্তর এবং তাদের স্থানচ্যুতি সহ নতুন, আরও আক্রমণাত্মক জিনোটাইপগুলির উত্থানের সাথে যুক্ত ছিল। 11-2000 সালে কি হয়েছিল ইউএসএ এবং কানাডায় এপিফিটোটিক্স প্রথমবার দেখিয়েছিল যে বিশ্বায়নের যুগে এই রোগের প্রকোপগুলি সংক্রামিত রোপণ সামগ্রী বিক্রি করার সময় নতুন জিনোটাইপের সক্রিয় প্রসারের সাথে যুক্ত হতে পারে।
দক্ষিণ আমেরিকা
সাম্প্রতিক অবধি, দক্ষিণ আমেরিকার জনগণের পি। ইনফেষ্টানসের অধ্যয়নগুলি নিয়মিত বা বড় আকারের ছিল না। জানা যায় যে এই জনসংখ্যার কাঠামো বেশ সহজ এবং এতে প্রতি দেশ 1-5 ক্লোনাল বংশ অন্তর্ভুক্ত রয়েছে (ফোর্বস এট আল।, 1998)। সুতরাং, 1998 এর মধ্যে, জিনোটাইপগুলি ইউএস -1 (ব্রাজিল, চিলি) বিআর -1 (ব্রাজিল, বলিভিয়া, উরুগুয়ে, প্যারাগুয়ে), ইসি -১ (ইকুয়েডর, কলম্বিয়া, পেরু এবং ভেনিজুয়েলা), এআর -১, এআর -1, এআর -1, এআর -2 এবং এআর -3 (আর্জেন্টিনা), পিই -4 এবং পিই -5 (দক্ষিণ পেরু)। মেটিং টাইপ এ 3 ব্রাজিল, বলিভিয়া এবং আর্জেন্টিনাতে উপস্থিত ছিল এবং তিতিকাকা লেকের অঞ্চলে বলিভিয়ান-পেরুভিয়ান সীমান্তের বাইরে পাওয়া যায় নি, যার পিছনে ইসি -7 এ 2 জিনোটাইপ অ্যান্ডিসে আধিপত্য বিস্তার করেছিল। টমেটোতে, ইউএস -১ পুরো দক্ষিণ আমেরিকা জুড়ে প্রভাবশালী জিনোটাইপ থেকে যায়।
2000-এর দশকেও পরিস্থিতি কমবেশি স্থায়ী ছিল। একটি গুরুত্বপূর্ণ বিষয় হ'ল উত্তর অ্যান্ডেসের (অলিভা এট আল।, ২০১০) আলুর বুনো আত্মীয়দের (এস। ব্রেভিফোলিয়াম এবং এস। টেট্রাপেটালাম) এর এ 2 ধরণের নতুন ক্লোনাল লাইন ইসি -2 আবিষ্কার করা। ফাইলোজেনেটিক গবেষণায় দেখা গেছে যে এই লাইনটি সম্পূর্ণরূপে পি। ইনফেসট্যান্সের মতো নয়, যদিও এটি এর সাথে ঘনিষ্ঠভাবে জড়িত, এই প্রসঙ্গে এটি বিবেচনা করার প্রস্তাব দেওয়া হয়েছিল, পাশাপাশি আরেকটি লাইন, ইসি -2010, টমেটো গাছ থেকে বিচ্ছিন্ন এস বেটেসিয়াম অ্যান্ডিসে বৃদ্ধি পাচ্ছে, পি। অ্যান্ডিনা নামে একটি নতুন প্রজাতি; তবে, এই প্রজাতির অবস্থান (একটি স্বতন্ত্র প্রজাতি বা কিছু অজানা লাইনের সাথে পি। ইনফেষ্টানসের একটি সংকর) এখনও স্পষ্ট নয় (দেলগাদো এট আল।, ২০১৩)।
বর্তমানে, দক্ষিণ আফ্রিকার সমস্ত জনসংখ্যা পি। ইনফেষ্টানস ক্লোনাল। উভয় প্রকারের সঙ্গমের উপস্থিতি থাকা সত্ত্বেও কোনও পুনঃসংযোগ জনগোষ্ঠী চিহ্নিত করা যায়নি। টমেটোতে, ইউএস -১ জিনোটাইপ সর্বব্যাপী, স্পষ্টতই স্থানীয় স্ট্রেন দ্বারা আলু থেকে স্থানচ্যুত হয়, এর সঠিক উত্স এখনও অজানা। ব্রাজিল, বলিভিয়া এবং উরুগুয়েতে বিআর -১ জিনোটাইপ উপস্থিত রয়েছে; পেরুতে ইউএস -১ এবং ইসি -১ এর সাথে আরও কয়েকটি স্থানীয় জিনোটাইপ রয়েছে। অ্যান্ডিসে, প্রভাবশালী অবস্থানটি ক্লোনাল লাইন ইসি -১ দ্বারা ধরে রাখা হয়, যা সম্প্রতি আবিষ্কার হওয়া পি। অ্যান্ডিনার সাথে সম্পর্ক অজানা থেকে যায়। একমাত্র "অস্থির" স্থান যেখানে 1-1 সময়ের জন্য। জনসংখ্যার মধ্যে উল্লেখযোগ্য পরিবর্তন ছিল, চিলিতে পরিণত হয়েছিল (আকুয়া এট আল।, ২০১২), যেখানে ২০০৪-২০০1 সালে। রোগজীবাণু জনসংখ্যা মেটালাক্সেল এবং একটি নতুন মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ হ্যাপ্লোটাইপের প্রতিরোধের দ্বারা চিহ্নিত হয়ে যায় (IA এর পরিবর্তে পূর্ববর্তী Ib)। 1 থেকে 1 জনসংখ্যায়, জিনোটাইপ 2003 (এসএসআর অনুসারে) প্রাধান্য পেয়েছে, যার অংশটি 2013% এ পৌঁছেছে, পরে খেজুরটি জিনোটাইপ 2012 এ চলে গেছে, পরবর্তী দুই বছরে যা ঘটেছিল তার ফ্রিকোয়েন্সি প্রায় 2004% (আকুয়া, 2005) রাখা হয়েছিল।
ইউরোপ
ইউরোপের ইতিহাসে, উত্তর আমেরিকা থেকে পি। ইনফেসট্যান্সের হিজরতের কমপক্ষে দুটি তরঙ্গ হয়েছে: উনিশ শতকে। (HERB-1) এবং 1 শতকের শুরুর দিকে (মার্কিন -70)। 1 এর দশকে মেটালাক্সেলযুক্ত ছত্রাকনাশকের সর্বব্যাপী বিতরণ। প্রভাবশালী জিনোটাইপ ইউএস -১ এর স্থানচ্যুতি এবং নতুন জিনোটাইপগুলির সাথে এর প্রতিস্থাপনের দিকে পরিচালিত করে। ফলস্বরূপ, পশ্চিম ইউরোপের বেশিরভাগ দেশগুলিতে, প্যাথোজেনের জনসংখ্যা প্রধানত বেশ কয়েকটি ক্লোনাল লাইনের দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হত।
জীবাণু জনগোষ্ঠীর বিশ্লেষণের জন্য মাইক্রোসেটেল বিশ্লেষণের ব্যবহারের ফলে ২০০২-২০০৮ সালে পশ্চিমা ইউরোপে ঘটে যাওয়া মারাত্মক পরিবর্তনগুলি প্রকাশ করা সম্ভব হয়েছিল। ২০০৫ সালে যুক্তরাজ্যে একটি নতুন ক্লোনাল লাইন আবিষ্কৃত হয়েছিল, যার নাম ছিল ১৩_এ ২ (বা "ব্লু ১৩") এবং এ 2005 সঙ্গমের ধরণ দ্বারা চিহ্নিত , ফেনিলামাইডগুলির প্রতি উচ্চ আগ্রাসন এবং প্রতিরোধের (শ এট আল।, 2008)। একই জিনোটাইপ 2005 সালে নেদারল্যান্ডস এবং উত্তর ফ্রান্সে সংগৃহীত নমুনাগুলিতে পাওয়া গিয়েছিল যা সুপারিশ করেছিল যে এটি মহাদেশীয় ইউরোপ থেকে যুক্তরাজ্যে চলে এসেছিল, সম্ভবত বীজের আলু দিয়ে (কুক এট আল।, 13)। এই ক্লোনাল লাইনের প্রতিনিধিদের জিনোমের অধ্যয়নটি এর ক্রমটির উচ্চতর ডিগ্রি পলিমারফিজম দেখিয়েছে (২০১ by সালের মধ্যে, এর উপকৌকিক পরিবর্তনের সংখ্যা 2 এ পৌঁছেছে) এবং জিনের প্রকাশের স্তরগুলিতে উল্লেখযোগ্য পরিমাণে পরিবর্তনের পরিমাণ রয়েছে। উদ্ভিদ সংক্রমণের সময় ইফেক্টর জিন (কুক এট আল।, 13; কুক, 2)। এই বৈশিষ্ট্যগুলি, বায়োট্রফিক পর্যায়ের বর্ধিত সময়কালের সাথে, 2007_A2004 এর বর্ধিত আগ্রাসন এবং দেরীতে দুর্যোগের বিরুদ্ধে প্রতিরোধী এমনকি আলুর জাতগুলিকে সংক্রামিত করার ক্ষমতাও হতে পারে।
পরবর্তী কয়েক বছরে, জিনোটাইপটি উত্তর পশ্চিম ইউরোপের দেশগুলিতে (গ্রেট ব্রিটেন, আয়ারল্যান্ড, ফ্রান্স, বেলজিয়াম, নেদারল্যান্ডস, জার্মানি) দ্রুত পূর্বের প্রভাবশালী জিনোটাইপ 1_A1, 2_A1, 8_A1 (মন্টেরি এট আল।, ২০১০; জিসি এট আল) এর একযোগে স্থানচ্যুতকরণের সাথে ছড়িয়ে পড়ে। , 2010; ভ্যান ডেন বোশ এট।, 2011; কুক, 2011; কুক, 2015)। Www.euroblight.net ওয়েবসাইট অনুসারে, এই দেশগুলির জনসংখ্যায় ১৩_A2017 এর শেয়ার 13-2% এবং আরও বেশি পৌঁছেছে; পূর্ব এবং দক্ষিণ ইউরোপের কয়েকটি দেশে এই জিনোটাইপের উপস্থিতি রেকর্ড করা হয়েছে। যাইহোক, 60-80 এ। 2009_A2012 গ্রেট ব্রিটেন এবং ফ্রান্সে তার প্রভাবশালী অবস্থানগুলি হারিয়েছে, 13_A2 লাইনে (আয়ারল্যান্ডে 6_A1) উপার্জন করেছে, এবং নেদারল্যান্ডস এবং বেলজিয়ামে এটি আংশিকভাবে জিনোটাইপ 8_A1, 1_A1, এবং 6_A1 দ্বারা প্রতিস্থাপন করা হয়েছে (কুক এট আল।, 33; কুক, 2; স্টেলিংওয়ার্ফ, 2012)।
আজ অবধি, পি। ইনফেষ্টানসের পশ্চিম ইউরোপীয় জনসংখ্যার প্রায় 70% একচেটিয়া। Www.euroblight.net ওয়েবসাইট অনুসারে উত্তর-পশ্চিম ইউরোপের দেশগুলিতে প্রভাবশালী জিনোটাইপগুলি (যুক্তরাজ্য, ফ্রান্স,
নেদারল্যান্ডস, বেলজিয়াম) প্রায় সমান অনুপাতের মধ্যে রয়েছে, ১৩_এ ২ এবং remain_এ ১, এবং পরবর্তীকটি নির্দিষ্ট অঞ্চলের (আয়ারল্যান্ড বাদে) বাইরে ব্যবহারিকভাবে দেখা যায় না, তবে ইতিমধ্যে কমপক্ষে ৫৮ টি সাবক্লোন রয়েছে (কুক, ২০১))। বৈচিত্রগুলি 13_A2 জার্মানিতে লক্ষণীয় সংখ্যায় উপস্থিত রয়েছে এবং মধ্য এবং দক্ষিণ ইউরোপের দেশগুলিতেও বিক্ষিপ্তভাবে পালন করা হয়। জিনোটাইপ 6_A1 বেলজিয়াম এবং আংশিকভাবে নেদারল্যান্ডস এবং ফ্রান্সের জনসংখ্যার একটি উল্লেখযোগ্য অংশ নিয়েছে। জিনোটাইপ 58_A2017 আয়ারল্যান্ড বাদে ইউরোপীয় জনসংখ্যায় 13-2% এর স্তরে স্থিতিশীল হয়েছে, যেখানে এটি তার শীর্ষস্থান ধরে রেখেছে এবং দুটি উপকণায় বিভক্ত হয়েছে (স্টেলিংওয়ার্ফ, 1)। শেষ অবধি, ২০১ in সালে, নতুন জিনোটাইপগুলির উপস্থিতির ফ্রিকোয়েন্সি বৃদ্ধি 1_A8 এবং 1_A3, 6-2017 এ প্রথম রেকর্ড করা হয়েছিল; আজ অবধি, এই জিনোটাইপগুলি নেদারল্যান্ডস এবং বেলজিয়াম এবং কিছুটা ফ্রান্স এবং জার্মানি, পাশাপাশি গ্রেট ব্রিটেনের দক্ষিণ অংশে (কুক, 2016) পাওয়া যায়। পশ্চিম ইউরোপীয় জনসংখ্যার প্রায় 36-2% প্রতি বছর অনন্য জিনোটাইপ দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়।
পশ্চিম ইউরোপের বিপরীতে, 13_A2 জিনোটাইপ প্রকাশের সময়কালে উত্তর ইউরোপের জনসংখ্যা (সুইডেন, নরওয়ে, ডেনমার্ক, ফিনল্যান্ড) ক্লোনাল লাইনের দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়নি, তবে প্রচুর সংখ্যক অনন্য জিনোটাইপ দ্বারা (ব্রুরবার্গ এট আল।)
2011)। পশ্চিম ইউরোপে 13_A2 সক্রিয় ছড়িয়ে যাওয়ার সময়কালে, স্ক্যান্ডিনেভিয়ায় এই জিনোটাইপের উপস্থিতি ২০১১ সাল পর্যন্ত লক্ষ্য করা যায়নি, যখন এটি প্রথম প্রথম উত্তর জটল্যান্ডে (ডেনমার্ক) আবিষ্কৃত হয়েছিল, যেখানে প্রধানত শিল্পজাত আলুর জাতগুলি মেটালাক্সেলযুক্ত সক্রিয় ব্যবহারের সাথে জন্মে ছত্রাকনাশক (নিলসন এট আল।, 2011)। Www.euroblight.net এর মতে, জিনোটাইপ 2014_A13 এছাড়াও ২০১৪ সালে নরওয়ে এবং ডেনমার্ক থেকে প্রাপ্ত বেশ কয়েকটি নমুনায় এবং ২০১ 2 সালে বেশ কয়েকটি নরওয়ের নমুনায় ধরা পড়েছিল; তদ্ব্যতীত, 2014 সালে, ফিনল্যান্ডে অল্প পরিমাণে জিনোটাইপ 2016_A2013 এর উপস্থিতি লক্ষ করা গেছে। স্ক্যান্ডিনেভিয়ার বিজয়ে 6_A1 এবং অন্যান্য ক্লোনাল লাইনের ব্যর্থতার মূল কারণটি পশ্চিম ইউরোপের দেশগুলি থেকে এই অঞ্চলের জলবায়ুগত পার্থক্য হিসাবে বিবেচিত হয়।
শীতকালীন শীতকালীন মাটি জমাট (যা সাধারণত পশ্চিম ইউরোপের উষ্ণ দেশগুলিতে ঘটে না) শীতকালে মাটি হিমশীতল এবং গাছের সংশ্লেষণে অবদান রাখে শীতকালীন শীতকালীন শীত ও শীতকালীন শীত শীতকালীন oospores বাঁচতে অবদান রাখে fact আলু, যা প্রাথমিক সংক্রমণের উত্স হিসাবে তাদের ভূমিকা বাড়ায় (ব্রুরবার্গ এট আল।, ২০১১)। এটিও লক্ষ করা উচিত যে, উত্তরাঞ্চলে, ওসপোরস থেকে সংক্রমণের বিকাশ টিউবারাস সংক্রমণের বিকাশকে আস্তানা দেয়, যা শেষ পর্যন্ত আরও আক্রমণাত্মক, তবে পরে বিকশিত ক্লোনাল লাইনগুলির আধিপত্যকে বাধা দেয় Y পূর্ব ইউরোপের (পোল্যান্ড, বাল্টিক রাজ্য) পি-ইনফেস্টানসের সর্বাধিক অধ্যয়নিত জনসংখ্যার কাঠামো স্ক্যান্ডিনেভিয়ার মতোই is
উভয় প্রকারের সঙ্গম এখানেও উপস্থিত রয়েছে এবং এসএসআর বিশ্লেষণ দ্বারা নির্ধারিত বিস্তৃত জিনোটাইপগুলি অনন্য (Chmielarz et al।, 2014; রান্নো-পৌরসন এবং আল।, ২০১))। উত্তর ইউরোপের মতো, ক্লোনাল রেখাগুলির বিতরণ (প্রাথমিকভাবে 2016_A13 জিনোটাইপের) প্যাথোজেনের স্থানীয় জনগোষ্ঠীকে কার্যত প্রভাবিত করে না, যা উচ্চারণযোগ্য প্রভাবশালী লাইনের অভাবে উচ্চ মাত্রার বৈচিত্র্য বজায় রাখে।
বাণিজ্যিক আলুর জাত সহ ক্ষেত্রগুলিতে মাঝে মধ্যে 13_A2 এর উপস্থিতি লক্ষ্য করা যায়। রাশিয়ায় পরিস্থিতি একইভাবে বিকাশ করছে। পি। ইনফেষ্টানস বিচ্ছিন্নতার মাইক্রোসেটেল বিশ্লেষণ ২০০৮-২০০১ সালে সংগৃহীত রাশিয়ার ইউরোপীয় অংশের 2008 টি বিভিন্ন অঞ্চলে, উচ্চ মাত্রার জিনোটাইপিক বৈচিত্র্য এবং ইউরোপীয় ক্লোনাল লাইনের সাথে সংযোগের সম্পূর্ণ অভাব দেখিয়েছে (স্ট্যাটাস্যুক এট আল।, ২০১৪)। বেশ কয়েক বছর পরে, 2011-10 সালে লেনিনগ্রাড অঞ্চলে সংগৃহীত পি। ইনফেষ্টানসের নমুনাগুলির একটি সমীক্ষায় তাদের পূর্ববর্তী গবেষণায় চিহ্নিত অঞ্চলটির জিনোটাইপের মধ্যে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য দেখা গেছে। উভয় গবেষণায়, কোনও পশ্চিমা ইউরোপীয় জিনোটাইপ পাওয়া যায় নি (বিকেটোভা এট আল।, ২০১৪; কুজনেটসোভা এট আল।, ২০১,)।
পূর্ব ইউরোপীয় জনগণের পি। ইনফেষ্টানসের উচ্চ জেনেটিক বৈচিত্র্য এবং এর মধ্যে প্রভাবশালী ক্লোনাল লাইনের অনুপস্থিতি বিভিন্ন কারণে হতে পারে। প্রথমত, উত্তর ইউরোপের মতো, বিবেচিত দেশগুলির জলবায়ু সংক্রমণের প্রাথমিক উত্স হিসাবে ওসপোরস গঠনে অবদান রাখে (উলানোয়া এট আল।, ২০১০; চিমিলারজ এট আল।, ২০১৪)। দ্বিতীয়ত, এই দেশগুলিতে উত্পাদিত আলুর একটি উল্লেখযোগ্য পরিমাণ ছোট বেসরকারী খামারে জন্মে, প্রায়শই বনের মধ্যে ঘেরা থাকে বা সংক্রামক পদার্থের মুক্ত চলাফেরার অন্যান্য বাধা (Chmielarz et al।, 2010)। একটি নিয়ম হিসাবে, এই ধরনের শর্তে উত্থিত আলুগুলি ব্যবহারিকভাবে রাসায়নিকগুলির সাথে চিকিত্সা করা হয় না, এবং জাতগুলির পছন্দটি তাদের দেরিতে ব্লাইটি প্রতিরোধের উপর ভিত্তি করে, অর্থাৎ মেটালাক্সিলের প্রতি আক্রমণাত্মকতা এবং প্রতিরোধের জন্য কোন নির্বাচনী চাপ নেই, যা প্রতিরোধী জিনোটাইপগুলি বঞ্চিত করে, যেমন 2014_A2014, অন্যান্য জিনোটাইপগুলির তুলনায় সুবিধাগুলি (চ্যামিলারজ এট আল।, 13)। অবশেষে, জমি প্লটের ছোট আকারের কারণে, তাদের মালিকরা সাধারণত বছরের পর বছর ধরে একই জায়গায় ফসলের ঘূর্ণন, আলু জন্মানোর অনুশীলন করেন না, যা জিনগতভাবে বৈচিত্রময় ইনোকুলামের সংশ্লেষণে অবদান রাখে (রান্নো-পৌরসন এট আল।, 2; এলানস্কি, 2014; এলানস্কি এট আল। ।, 2016)।
এশিয়া
সম্প্রতি অবধি, এশিয়াতে পি। ইনফেষ্টানস জনসংখ্যার কাঠামো তুলনামূলকভাবে কম বোঝা যায়নি। এটি জানা ছিল যে এটি মূলত ক্লোনাল লাইন দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়, এবং নতুন জিনোটাইপগুলির উত্থানের উপর যৌন পুনর্বিবেচনার প্রভাব খুব কম। সুতরাং, উদাহরণস্বরূপ, 1997-1998 সালে। রাশিয়ার এশীয় অংশে (সাইবেরিয়া এবং সুদূর পূর্ব), প্যাথোজেনের জনসংখ্যা কেবল তিনটি জিনোটাইপ দ্বারা উপস্থাপিত হয়েছিল এসআইবি -1 জিনোটাইপের (এলানস্কি এট আল।, 2001) এর প্রাধান্য দিয়ে। চীন, জাপান, কোরিয়া, ফিলিপাইন এবং তাইওয়ানের মতো দেশগুলিতে ক্লোনাল প্যাথোজেন লাইনের উপস্থিতি প্রদর্শিত হয়েছে (কোহ এট আল।, 1994; চেন এট আল।, ২০০৯)। ক্লোনাল লাইন ইউএস -১, যা এশিয়ার একটি বৃহত অঞ্চল জুড়ে আধিপত্য বিস্তার করেছিল 2009s এর দশকের শেষের দিকে - 1 এর দশকের গোড়ার দিকে। প্রায় সব জায়গাতেই অন্য জিনোটাইপগুলি প্রতিস্থাপন করা শুরু করে, যা পরিবর্তিতভাবে নতুনগুলির দিকে যাত্রা করে। বেশিরভাগ ক্ষেত্রে, এশীয় দেশগুলিতে জনসংখ্যার কাঠামো এবং গঠনের পরিবর্তনগুলি বাইরে থেকে নতুন জিনোটাইপগুলির স্থানান্তরের সাথে যুক্ত ছিল। সুতরাং, জাপানে, জেপি -৩ জিনোটাইপ ব্যতীত, ইউএস -১ (জেপি -১, জেপি -২, জেপি -৩) এর পরে উপস্থিত অন্যান্য সমস্ত জাপানি জিনোটাইপের কম-বেশি প্রমাণিত বাহ্যিক উত্স রয়েছে (আকিনো এট আল।, ২০১১) ... চীনে বর্তমানে স্পষ্ট ভৌগলিক বিভাগ সহ তিনটি প্রধান প্যাথোজেন জনসংখ্যা রয়েছে; এই জনগোষ্ঠীর মধ্যে কোনও বা খুব দুর্বল জিন প্রবাহ নেই (গুও এট।, ২০১০; লি এট আল।, 90 বি)। জিনোটাইপ 2000_A3 তার দক্ষিণ প্রদেশগুলিতে (ইউনান এবং সিচুয়ান) 1-1 এবং 2-3-এ চীন অঞ্চলে হাজির হয়েছিল। দেশের উত্তর-পূর্বেও দেখা গিয়েছিল (লি এট আল।, 2011 বি)। ভারতে, 2010_A2013 সম্ভবত চিনের মতো একই সময়ে উপস্থিত হয়েছিল, সম্ভবত সংক্রামিত বীজ আলু (চৌদ্দ্পা এপ আল।, 13) এবং ২০০৯-২০১০-তে সংক্রামিত হয়। দেশের দক্ষিণে টমেটোতে দেরিতে ব্লাইটের মারাত্মক এপিফাইটোটিক রোগের কারণ হয়েছিল, এর পরে এটি আলুতে ছড়িয়ে পড়ে এবং ২০১৪ সালে পশ্চিমবঙ্গে দেরিতে ব্লাইটের প্রাদুর্ভাব ঘটে, যার ফলে অনেক স্থানীয় কৃষকের ধ্বংস ও আত্মহত্যার ঘটনা ঘটে (ফ্রাই, ২০১))।
আফ্রিকা
২০০৮-২০১০ পর্যন্ত আফ্রিকান দেশগুলিতে পি। ইনফেষ্টানসের পদ্ধতিগত অধ্যয়ন করা হয়নি। বর্তমানে আফ্রিকার জনগণের পি। ইনফেষ্টানদের দুটি গ্রুপে বিভক্ত করা যেতে পারে এবং এই বিভাগটি স্পষ্টভাবে ইউরোপ থেকে বীজ আলুর আমদানির সত্যতার সাথে জড়িত।
উত্তর আফ্রিকাতে, যা সক্রিয়ভাবে ইউরোপ থেকে বীজ আলু আমদানি করে, প্রায় সমস্ত অঞ্চলে এ 2 মিলনের ধরণটি ব্যাপকভাবে উপস্থাপিত হয়, যা যৌন পুনর্বাসনের ফলে নতুন জিনোটাইপগুলির উত্থানের তাত্ত্বিক সম্ভাবনা সরবরাহ করে (Corbière et al।, 2010; রেকাড এট আল।, 2017)। এছাড়াও, আলজেরিয়ায়, জিনোটাইপস 13_A2, 2_A1 এবং 23_A1 এর উপস্থিতি প্রথমটির একটি সুস্পষ্ট আধিপত্য হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে, পাশাপাশি অদৃশ্য হয়ে যাওয়ার সম্পূর্ণ অনন্য জিনোটাইপের অনুপাতে ক্রমশ হ্রাস পেয়েছে (রেকাড এট আল।, 2017)। অঞ্চলটির অন্যান্য অংশের বিপরীতে, তিউনিসিয়ায় (দেশের উত্তর-পূর্ব ব্যতীত), প্যাথোজেনের জনসংখ্যার প্রতিনিধিত্ব করা হয় মূলত এ 1 মিলনের ধরণের (হারবাউই এট আল।, 2014) দ্বারা।
ক্লোনাল লাইন NA-01 এখানে প্রভাবশালী। সাধারণভাবে, জনসংখ্যার ক্লোনাল রেখার অনুপাত মাত্র 43%। পূর্ব এবং দক্ষিণ আফ্রিকাতে, যেখানে বীজ আমদানির পরিমাণ খুব কম ((ফ্রি এট আল।, ২০০৯), পি। ইনফেষ্টানদের কেবল দুটি ক্লোনাল এ 2009-টাইপ লাইন, ইউএস -1 এবং কেই -1 দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়, এবং পরবর্তীগুলি আলুর উপর সক্রিয়ভাবে পূর্বের স্থানটিকে স্থান দেয় ( পুল এট আল।, ২০১২; এনজোরোজ এট আল।, ২০১))। আজ অবধি, এই উভয় জিনোটাইপগুলিতে উপকৌকীয় প্রকরণের লক্ষণীয় সংখ্যা রয়েছে।
অস্ট্রেলিয়া
অস্ট্রেলিয়ায় আলুর দেরিতে প্রথম দফায় দফায় দফায় দফায় দফার প্রথম প্রতিবেদন 1907 সাল থেকে শুরু করে এবং গ্রীষ্মের মাসগুলিতে সম্ভবত ভারী বৃষ্টিপাতের ফলে প্রথম এপিফাইটোটিয়া হয় 1909-1911 সালে। (ড্রেন্ট এট আল।, ২০০২)। তবে সাধারণভাবে দেরিতে দুর্যোগের জন্য দেশের জন্য উল্লেখযোগ্য অর্থনৈতিক তাত্পর্য নেই। দেরিতে দুর্যোগের বিক্ষিপ্ত প্রাদুর্ভাবগুলি, উচ্চ আর্দ্রতা সরবরাহ করে এমন আবহাওয়া পরিস্থিতি দ্বারা উস্কে দেওয়া হয়, প্রতি 2002-5 বছরে একবারের বেশি হয় না এবং প্রধানত উত্তর তাসমানিয়া এবং কেন্দ্রীয় ভিক্টোরিয়ায় স্থানীয় হয়। উপরোক্ত সংযোগে, পি। ইনফেষ্টানদের অস্ট্রেলিয়ান জনগণের কাঠামোর অধ্যয়নের জন্য নিবেদিত প্রকাশনাগুলি কার্যত অনুপস্থিত। সর্বশেষ উপলব্ধ তথ্য 7-1998। (ড্রেন্ট এট আল।, ২০০২)। লেখকদের মতে, ভিক্টোরিয়া রাজ্যের জনসংখ্যা ছিল এক ক্লোনাল বংশের US-2000, যা পরোক্ষভাবে মার্কিন যুক্তরাষ্ট্র থেকে এই জিনোটাইপের স্থানান্তরকে নিশ্চিত করে। তাসমানিয়ান নমুনাগুলিকে বিশ্বের অন্যান্য অঞ্চলে ততকালীন উপস্থিত জিনোটাইপ থেকে আলাদা এ এউ -2002 হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছিল।
রাশিয়ায় দেরিতে ব্লাইটের বিকাশের বৈশিষ্ট্য
ইউরোপে আলুতে প্রাথমিক ইনোকুলাম রোগাক্রান্ত বীজ কন্দ, মাটিতে ওভারনিস্টর, পাশাপাশি গত বছরের জমিতে ("স্বেচ্ছাসেবক" গাছপালা) অতিরিক্ত কাঁচা গাছ থেকে জন্মানো উদ্ভিদগুলি থেকে বাতাসের দ্বারা আনা একটি সংক্রমণ হিসাবে বিবেচিত হয় ("স্বেচ্ছাসেবক" গাছপালা), বা জমে থাকা স্তূপে কন্দ সংরক্ষণের জন্য বুকমার্ক। এর মধ্যে ফেলে দেওয়া কন্দের স্তূপে জন্মানো উদ্ভিদগুলি সংক্রমণের সবচেয়ে বিপজ্জনক উত্স হিসাবে বিবেচিত হয়। সেখানে অঙ্কুরিত কন্দগুলির সংখ্যা প্রায়শই তাৎপর্যপূর্ণ হয় এবং চিড়িয়াখানা থেকে দীর্ঘ দূরত্বে তাদের থেকে বহন করা যায়। বাকি উত্সগুলি (oospores, "স্বেচ্ছাসেবক" উদ্ভিদ) এত বিপজ্জনক নয়, কারণ একই ক্ষেত্রগুলিতে প্রতি 3-4 বছরে একবারের চেয়ে বেশি বার গাছ রোপণের রেওয়াজ নেই। ভাল বীজ মানের নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থার কারণে রোগাক্রান্ত বীজ কন্দগুলি থেকে সংক্রমণও ন্যূনতম is
সাধারণভাবে, ইউরোপীয় জনগোষ্ঠীতে ইনোকুলামের পরিমাণ সীমিত, এবং তাই মহামারীটির বৃদ্ধি বরং ধীর এবং রাসায়নিক ছত্রাকজনিত প্রস্তুতি ব্যবহার করে সফলভাবে নিয়ন্ত্রণ করা যায়। ইউরোপীয় অবস্থার প্রধান কাজ হ'ল ধাপে সংক্রমণের বিরুদ্ধে লড়াই যখন আক্রান্ত গাছপালা থেকে চিড়িয়াখানার ব্যাপক ছড়িয়ে পড়া শুরু হয়।
রাশিয়ায় পরিস্থিতি একেবারে আলাদা। আলু এবং টমেটো ফসলের বেশিরভাগই ছোট বেসরকারী বাগানে জন্মে; তাদের বিরুদ্ধে প্রতিরক্ষামূলক ব্যবস্থাগুলি মোটেই চালিত হয় না, বা ছত্রাকজনিত চিকিত্সা অপর্যাপ্ত সংখ্যায় করা হয় এবং শীর্ষে দেরী দোষ দেখা দেওয়ার পরে শুরু হয়। ফলস্বরূপ, ব্যক্তিগত উদ্ভিজ্জ উদ্যানগুলি সংক্রমণের প্রধান উত্স হিসাবে কাজ করে, যেখান থেকে চিড়িয়াখানাটি বাতাসের মাধ্যমে বাণিজ্যিক গাছপালা পর্যন্ত বহন করে। এটি মস্কো, ব্রায়ানস্ক, কোস্ট্রোমা, রিয়াজান অঞ্চলে আমাদের প্রত্যক্ষ পর্যবেক্ষণ দ্বারা নিশ্চিত করা হয়েছে: বাণিজ্যিক উদ্যানের ছত্রাকনাশক চিকিত্সা শুরুর আগেই বেসরকারী বাগানে গাছপালার ক্ষতি দেখা যায়। পরবর্তীকালে, বড় ক্ষেত্রগুলিতে মহামারীটি ছত্রাকজনিত প্রস্তুতির ব্যবহারের দ্বারা নিয়ন্ত্রণ করা হয়, যখন ব্যক্তিগত উদ্যানগুলিতে দেরীতে দুর্যোগের দ্রুত বিকাশ ঘটে।
বাণিজ্যিক গাছ লাগানোর ভুল বা "বাজেটরিয়াল" চিকিত্সার ক্ষেত্রে ক্ষেত্রগুলিতে দেরিতে দুরত্বের কেন্দ্রবিন্দু উপস্থিত হয়; পরে তারা সক্রিয়ভাবে বিকাশ করছে, আরও বৃহত্তর অঞ্চলগুলি coveringেকে দিচ্ছে (এলানস্কি, 2015)। ব্যক্তিগত উদ্যানগুলিতে সংক্রমণ বাণিজ্যিক ক্ষেত্রে মহামারীগুলির উপর উল্লেখযোগ্য প্রভাব ফেলে। রাশিয়ার সমস্ত আলু চাষকারী অঞ্চলে, ব্যক্তিগত উদ্যানগুলিতে আলু দ্বারা দখল করা অঞ্চলটি বড় উত্পাদকের ক্ষেত্রের ক্ষেত্রফলের চেয়ে কয়েকগুণ বেশি। এই জাতীয় পরিবেশে, বেসরকারী উদ্ভিজ্জ উদ্যানগুলিকে বাণিজ্যিক ক্ষেত্রে বিশ্বব্যাপী ইনোকুলাম সংস্থান হিসাবে দেখা যেতে পারে। আসুন সেই সমস্ত বৈশিষ্ট্যগুলি সনাক্ত করার চেষ্টা করি যা ব্যক্তিগত বাগানের স্ট্রেনগুলির জিনোটাইপগুলির বৈশিষ্ট্যযুক্ত।
গুঁড়ো আলু বীজ এবং কোয়ারেন্টাইন নিয়ন্ত্রণের রোপণ, সন্দেহজনক বিদেশী উত্পাদকদের কাছ থেকে পাওয়া টমেটো বীজ, একই অঞ্চলে আলু এবং টমেটো দীর্ঘমেয়াদী চাষ, ছত্রাকজনিত অনুপযুক্ত চিকিত্সা বা তাদের সম্পূর্ণ অনুপস্থিতির ফলে বেসরকারী ক্ষেত্রে মারাত্মক এপিফাইটোটিজ হয়, যার ফলসই নিখরচায় ক্রসিং, সংকরকরণ এবং ব্যক্তিগত উদ্যানগুলিতে oospores গঠন। ফলস্বরূপ, প্যাথোজেনের একটি খুব উচ্চ জিনোটাইপিক বৈচিত্র্য পরিলক্ষিত হয়, যখন প্রায় প্রতিটি স্ট্রেন তার জিনোটাইপে অনন্য হয় (এলানস্কি এট আল।, 2001, 2015)। বিভিন্ন জিনগত উত্সের বীজ আলু রোপণ করা এটিকে অসম্ভব করে তোলে যে কোনও জাতকে আক্রমণ করার জন্য বিশেষত ক্লোনাল লাইনগুলি উত্থিত হবে। এই জাতীয় ক্ষেত্রে নির্বাচিত স্ট্রেনগুলি প্রভাবিত জাতগুলির সাথে তাদের বহুমুখিতা দ্বারা পৃথক করা হয়, তাদের বেশিরভাগের কাছে সর্বাধিক সংখ্যক ভাইরালেন্স জিন রয়েছে। দেরী দুর্যোগের বিরুদ্ধে সুরক্ষার সঠিকভাবে ইনস্টলড সিস্টেম সহ বড় বড় কৃষি উদ্যোগের ক্ষেত্রগুলির জন্য এটি "ক্লোনাল লাইন" এর সিস্টেমের থেকে খুব আলাদা। "ক্লোনাল লাইনগুলি" (যখন ক্ষেত্রের শেষ প্রভাজনিত রোগের সমস্ত স্ট্রেন এক বা একাধিক জিনোটাইপ দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়) যে দেশে আলু চাষ একচেটিয়াভাবে বড় খামার দ্বারা চালিত হয়: ইউএসএ, নেদারল্যান্ডস, ডেনমার্ক ইত্যাদি। ইংল্যান্ড, আয়ারল্যান্ড, পোল্যান্ডে, যেখানে ঘরের প্লটগুলিও প্রচলিতভাবে বিস্তৃত আলু বৃদ্ধি, ব্যক্তিগত উদ্যানগুলিতে উচ্চতর জিনোটাইপিক বৈচিত্র্যও রয়েছে। বিশ শতকের শেষদিকে, রাশিয়ার এশীয় এবং সুদূর পূর্ব অংশগুলিতে "ক্লোনাল লাইনগুলি" ব্যাপকভাবে ছড়িয়ে পড়েছিল (এলানস্কি এট আল। সম্প্রতি, এই অঞ্চলের পরিস্থিতিও জনসংখ্যার জিনোটাইপিক বৈচিত্র্যের বৃদ্ধির দিকে পরিবর্তিত হতে শুরু করে।
ছত্রাকজনিত প্রস্তুতির সাথে নিবিড় চিকিত্সার অভাবের আরও একটি প্রত্যক্ষ পরিণতি রয়েছে - বাগানে প্রতিরোধী স্ট্রেনের কোনও সংचय নেই। প্রকৃতপক্ষে, আমাদের ফলাফলগুলি দেখায় যে মেটালাক্সিল-প্রতিরোধী স্ট্রেনগুলি বাণিজ্যিক বাগানের চেয়ে ব্যক্তিগত বাগানে উল্লেখযোগ্যভাবে কম ঘন ঘন পাওয়া যায়।
আলু এবং টমেটো রোপণের ঘনিষ্ঠতা, ব্যক্তিগত উদ্যানগুলির জন্য সাধারণ, এই ফসলের মধ্যে স্ট্রেনগুলির স্থানান্তরকে সহজতর করে, যার ফলস্বরূপ, গত দশকে আলু থেকে বিচ্ছিন্ন স্ট্রেনগুলির মধ্যে, চেরি টমেটো জাতের (টি 1) প্রতিরোধের জন্য জিন বহনকারী স্ট্রেনের অনুপাত, কেবল পূর্বের বৈশিষ্ট্যযুক্ত টমেটো "স্ট্রেইন। বেশিরভাগ ক্ষেত্রে টি 1 জিন সহ স্ট্রেনগুলি আলু এবং টমেটো উভয়ের দিকেই অত্যন্ত আক্রমণাত্মক।
সাম্প্রতিক বছরগুলিতে, টমেটোতে দেরিতে দুর্যোগ আলুর তুলনায় অনেক ক্ষেত্রে প্রদর্শিত হতে শুরু করে। টমেটোর চারাগুলি মাটিতে আস্পোরস, বা টমেটো বীজের উপস্থিত আস্তরাকাগুলি বা তাদের মেনে চলা সংক্রামিত হতে পারে (রুবিন এট আল।, 2001)। গত 15 বছরে, মূলত আমদানি করা বিপুল সংখ্যক সস্তা প্যাকেজযুক্ত বীজ স্টোরগুলিতে উপস্থিত হয়েছে এবং বেশিরভাগ ক্ষুদ্র উত্পাদক সেগুলি ব্যবহার শুরু করেছেন। বীজগুলিতে জিনোটাইপগুলি সহ তাদের চাষের অঞ্চলগুলিতে স্ট্রেন থাকতে পারে। ভবিষ্যতে, এই জিনোটাইপগুলি ব্যক্তিগত উদ্যানগুলিতে যৌন প্রক্রিয়াতে অন্তর্ভুক্ত রয়েছে, যা সম্পূর্ণ নতুন জিনোটাইপের উত্থানের দিকে পরিচালিত করে।
সুতরাং, এটি বলা যেতে পারে যে ব্যক্তিগত উদ্যানগুলি একটি গ্লোবাল "গলিত পাত্র" যার মধ্যে জিনগত উপাদানগুলির আদান-প্রদানের ফলে বিদ্যমান জিনোটাইপগুলি প্রক্রিয়াজাত হয় এবং সম্পূর্ণ নতুন প্রদর্শিত হয়। তদুপরি, তাদের নির্বাচন এমন পরিস্থিতিতে হয় যা বড় খামারগুলিতে আলুর জন্য তৈরির তুলনায় খুব আলাদা: ছত্রাকজনিত প্রেসের অনুপস্থিতি, বিভিন্ন ধরণের ভাইরাল এবং ব্যাকটিরিয়া সংক্রমণের দ্বারা প্রভাবিত গাছগুলির প্রাধান্য, টমেটো এবং বন্য নাইটশেডগুলির সান্নিধ্য, সক্রিয় ক্রসিং এবং oospore গঠনের সম্ভাবনা oospores পরবর্তী বছরের জন্য সংক্রমণের উত্স হিসাবে কাজ করতে।
এই সমস্তগুলি বাড়ির উঠোনের জনসংখ্যার একটি খুব উচ্চ জিনোটাইপিক বৈচিত্র্যের দিকে পরিচালিত করে। উদ্ভিজ্জ উদ্যানগুলিতে এপিফিটোটিকের পরিস্থিতিতে দেরিতে দুর্যোগ খুব তাড়াতাড়ি ছড়িয়ে পড়ে এবং বিপুল পরিমাণে বীজ বের হয়, কাছাকাছি অবস্থিত বাণিজ্যিক গাছগুলিতে উড়ে যায়। তবে, কৃষিক্ষেত্র এবং রাসায়নিক সুরক্ষার সঠিক ব্যবস্থা নিয়ে বাণিজ্যিক ক্ষেত্রে প্রবেশের পরে, স্পোরগুলি আগত বাস্তবে এপিফাইটিকগুলি শুরু করার ক্ষেত্রে কোন সুযোগই পায়নি, এটি ছত্রাকজনিত প্রতিরোধী এবং চাষকৃত জাতের জন্য বিশেষায়িত ক্লোনাল লাইনের অনুপস্থিতির কারণে।
প্রাথমিক ইনোকুলামের আর একটি উত্স হ'ল অসুস্থ কন্দ হতে পারে বাণিজ্যিক চারাগুলিতে আটকা পড়ে। এই কন্দগুলি একটি নিয়ম হিসাবে ভাল কৃষি প্রযুক্তি এবং নিবিড় রাসায়নিক সুরক্ষার ক্ষেত্রগুলিতে জন্মেছিল। কন্দকে প্রভাবিতকারী বিচ্ছিন্নতার জিনোটাইপগুলি তাদের বিভিন্ন জাতের বিকাশের সাথে খাপ খায়। এই বাগানগুলি ব্যক্তিগত উদ্যান থেকে উদ্ভূত ইনোকুলামের চেয়ে বাণিজ্যিকভাবে রোপণের পক্ষে আরও বিপজ্জনক। আমাদের অধ্যয়নের ফলাফলগুলিও এই অনুমিতিকে সমর্থন করে। সঠিকভাবে পরিচালিত রাসায়নিক সুরক্ষা এবং ভাল কৃষি প্রযুক্তি সহ বড় ক্ষেত্রগুলি থেকে জনবসতিগুলি উচ্চ জিনোটাইপিক বৈচিত্র্যে পৃথক নয়। প্রায়শই এটি বেশ কয়েকটি ক্লোনাল লাইন যা অত্যন্ত আক্রমণাত্মক।
বাণিজ্যিক বীজ উপাদানের স্ট্রেনগুলি উদ্ভিজ্জ উদ্যানগুলিতে জনবসতিতে প্রবেশ করতে পারে এবং সেগুলির মধ্যে চলমান প্রক্রিয়াগুলিতে যুক্ত হতে পারে। তবে, একটি উদ্ভিজ্জ বাগানে, তাদের প্রতিযোগিতা বাণিজ্যিক ক্ষেত্রের তুলনায় অনেক কম হবে এবং শীঘ্রই তারা ক্লোনাল লাইন আকারে উপস্থিতি বন্ধ করবে, তবে তাদের জিনগুলি "বাগান" জনসংখ্যায় ব্যবহার করা যেতে পারে।
"স্বেচ্ছাসেবক" গাছপালা এবং ফসল কাটার সময় আবদ্ধ কন্দের স্তূপে যে সংক্রমণ বিকাশ হয় তা রাশিয়ার পক্ষে এতটা প্রাসঙ্গিক নয়, কারণ রাশিয়ার প্রধান আলু চাষকারী অঞ্চলগুলিতে গভীর শীতকালীন মাটি হিমায়ন লক্ষ্য করা যায় এবং কন্দ থেকে উদ্ভিদগুলি যেগুলি মাটিতে শীত পড়েছে খুব কমই বিকাশ লাভ করে। তদুপরি, আমাদের পরীক্ষাগুলি যেমন দেখায় যে দেরীতে দুর্যোগ কার্যকারক এজেন্ট এমনকি তাদের কক্ষগুলিতে নেতিবাচক তাপমাত্রায় টিকে থাকে না যা তাদের কার্যক্ষমতা ধরে রেখেছে। শুষ্ক অঞ্চলে, যেখানে প্রাথমিক আলুর চাষ অনুশীলন করা হয়, শুকনো এবং উত্তপ্ত ক্রমবর্ধমান মৌসুমের কারণে দেরিতে ব্লাইট বেশ বিরল।
সুতরাং, আমরা বর্তমানে পি। ইনফেসট্যান্স জনসংখ্যাকে "ক্ষেত্র" এবং "বাগান" জনসংখ্যার বিভাজন পর্যবেক্ষণ করছি। যাইহোক, সাম্প্রতিক বছরগুলিতে, প্রক্রিয়াগুলি এই জনসংখ্যা থেকে জিনোটাইপগুলির একত্রিতকরণ এবং আন্তঃব্যবস্থার দিকে পরিচালিত করে।
এর মধ্যে একটি ছোট উত্পাদকের স্বাক্ষরতার সাধারণ বৃদ্ধি, বীজ আলুর সাশ্রয়ী মূল্যের ছোট প্যাকেজগুলির উত্থান, ছোট প্যাকেজগুলিতে ছত্রাকজনিত প্রস্তুতির বিস্তার এবং জনসংখ্যার দ্বারা "রসায়ন" এর ভয় হ্রাস লক্ষ্য করা যায়।
পরিস্থিতি তৈরি হয় যখন, একজন সরবরাহকারীর জোরালো ক্রিয়াকলাপের জন্য, পুরো গ্রামগুলিকে একই জাতের বীজ কন্দ লাগানো হয় এবং একই কীটনাশকের ছোট প্যাকেজ সরবরাহ করা হয়। ধারণা করা যেতে পারে যে একই জাতের আলু কাছাকাছি অবস্থিত বাণিজ্যিক রোপণগুলিতে পাওয়া যাবে।
অন্যদিকে, কিছু কীটনাশক ব্যবসা প্রতিষ্ঠান “বাজেট” রাসায়নিক চিকিত্সা প্রকল্পগুলি প্রচার করছে। এই ক্ষেত্রে, প্রস্তাবিত চিকিত্সার সংখ্যাটিকে অবমূল্যায়ন করা হয় এবং সস্তার ছত্রাকনাশক সরবরাহ করা হয় এবং শীর্ষগুলি কাটা পর্যন্ত দেরী ব্লাইটের বিকাশকে প্রতিরোধ করার উপর জোর দেওয়া হয় না, তবে ফলন বাড়ানোর জন্য এপিফাইটোটিতে কিছুটা বিলম্ব হয়। নিম্ন-গ্রেড বীজ উপাদান থেকে গুটি আলু চাষের সময় এই জাতীয় পরিকল্পনাগুলি অর্থনৈতিকভাবে ন্যায়সঙ্গত হয়, যখন নীতিগতভাবে উচ্চ ফলন পাওয়ার কোনও প্রশ্নই আসে না। যাইহোক, এই ক্ষেত্রে, বাগানের জনসংখ্যার বিপরীতে, আলুর সমতল জেনেটিক পটভূমি নির্দিষ্ট শারীরবৃত্তীয় ঘোড়দৌড়গুলির বাছাইতে অবদান রাখে, যা এই জাতের জন্য খুব বিপজ্জনক।
সাধারণভাবে, আলু উত্পাদনের "বাগান" এবং "ক্ষেত্র" পদ্ধতিগুলির একীকরণের দিকে প্রবণতাগুলি আমাদের কাছে বিপজ্জনক বলে মনে হয়। তাদের নেতিবাচক পরিণতিগুলি, বাসা এবং বাণিজ্যিক উভয় ক্ষেত্রেই প্রতিরোধ করতে, ছোট প্যাকেজিংয়ে বেসরকারী মালিকদের দেওয়া বিচি আলুর বাছাই এবং ছত্রাকনাশকগুলির পরিসীমা, পাশাপাশি আলু সুরক্ষা প্রকল্পগুলি ট্র্যাকিং এবং বাণিজ্যিক ক্ষেত্রে ছত্রাকজনিত প্রস্তুতির ব্যবহার উভয়ই নিয়ন্ত্রণ করা প্রয়োজন।
বেসরকারী খাতের ক্ষেত্রগুলিতে, কেবল দেরীতে দুর্যোগ নয়, আল্টনারিয়াও এর নিবিড় বিকাশ রয়েছে। ব্যক্তিগত ঘরের প্লটগুলির বেশিরভাগ মালিকরা পাতাগুলির প্রাকৃতিক ইচ্ছার জন্য বা দেরিতে দুর্যোগের বিকাশের জন্য আল্টনারিয়া বিকাশের জন্য আল্টনারিয়ার বিরুদ্ধে সুরক্ষার জন্য বিশেষ ব্যবস্থা গ্রহণ করেন না। অতএব, সংবেদনশীল জাতগুলিতে আল্টনারিয়া এর ব্যাপক বিকাশের সাথে সাথে পারিবারিক প্লটগুলি বাণিজ্যিক গাছপালা জন্য ইনোকুলামের উত্স হিসাবে কাজ করতে পারে।
পরিবর্তনশীলতার প্রক্রিয়া
মিউটেশন প্রক্রিয়া
যেহেতু মিউটেশনের সংঘটন একটি কম ফ্রিকোয়েন্সি সহ একটি এলোমেলো প্রক্রিয়া, তাই কোনও লোকাসে পরিবর্তনের ঘটনাটি এই লোকসের পরিবর্তনের ফ্রিকোয়েন্সি এবং জনসংখ্যার আকারের উপর নির্ভর করে। পি। ইনফেষ্টান স্ট্রেনগুলির পরিবর্তনের ফ্রিকোয়েন্সি অধ্যয়ন করার সময়, রাসায়নিক বা শারীরিক মিউটেজগুলির সাথে চিকিত্সার পরে নির্বাচিত পুষ্টিকর মিডিয়ায় উত্থিত কলোনির সংখ্যা সাধারণত নির্ধারিত হয়। সারণি 8-এ উপস্থাপিত তথ্য থেকে দেখা যায়, বিভিন্ন লোকীতে একই স্ট্রেনের পরিবর্তনের ফ্রিকোয়েন্সি বিভিন্ন মাত্রার বিভিন্ন আদেশের দ্বারা পৃথক হতে পারে। মেটালাক্সিলের প্রতিরোধে পরিবর্তনের উচ্চ ফ্রিকোয়েন্সি প্রকৃতির প্রতিরোধী স্ট্রেনগুলি জমে যাওয়ার অন্যতম কারণ হতে পারে।
পরীক্ষাগার পরীক্ষার ভিত্তিতে গণনা করা স্বতঃস্ফূর্ত বা প্ররোচিত মিউটেশনের ফ্রিকোয়েন্সি নীচের কারণে সর্বদা প্রাকৃতিক জনগোষ্ঠীতে ঘটে যাওয়া প্রক্রিয়াগুলির সাথে মিলে না:
১. অ্যাসিনক্রোনাস পারমাণবিক বিভাজনে পারমাণবিক জেনারেশন প্রতি পরিবর্তনের ফ্রিকোয়েন্সি অনুমান করা অসম্ভব। অতএব, বেশিরভাগ পরীক্ষাগুলি দুটি মিউটেশনাল ইভেন্ট এবং মাইটোসিসের পরে একটি ইভেন্টের মধ্যে পার্থক্য ছাড়াই কেবল রূপান্তরগুলির ফ্রিকোয়েন্সি সম্পর্কে সরাসরি তথ্য সরবরাহ করে।
২. একক পদক্ষেপের মিউটেশনগুলি সাধারণত জিনোমের ভারসাম্য হ্রাস করে, অতএব, একটি নতুন সম্পত্তি অধিগ্রহণের পাশাপাশি, জীবের সামগ্রিক ফিটনেস হ্রাস পায়। পরীক্ষামূলকভাবে প্রাপ্ত বেশিরভাগ মিউটেশনের আগ্রাসন হ্রাস পায় এবং প্রাকৃতিক জনগোষ্ঠীতে রেকর্ড করা হয় না। সুতরাং, ফেনাইলামাইড ছত্রাকনাশকগুলিতে পি। ইনফেষ্টানস মিউট্যান্সের প্রতিরোধের ডিগ্রির মধ্যে একটি পারস্পরিক সম্পর্ক সহগ এবং একটি কৃত্রিম মাধ্যমের বৃদ্ধির গড় গড় ছিল (-2), এবং আলুর পাতায় ছত্রাকনাশকের প্রতিরোধ এবং আগ্রাসন (ডেরেভিগিনা এট আল)। , 0,62), যা মিউট্যান্টদের কম ফিটনেস নির্দেশ করে। ডাইমথোমর্ফের প্রতিরোধের মিউটেশনগুলির সাথে কার্যক্ষমতার তীব্র হ্রাসও ঘটে (বাগিরোভা এট আল।, 0,65)।
৩. বেশিরভাগ স্বতঃস্ফূর্ত এবং প্ররোচিত মিউটেশনগুলি বিরল এবং পরীক্ষামূলকভাবে নিজেকে ফেনোটাইপিকভাবে প্রকাশ করে না, তবে প্রাকৃতিক জনগোষ্ঠীর মধ্যে পরিবর্তনের একটি গোপনীয় রিজার্ভ গঠন করে। পরীক্ষাগার পরীক্ষায় বিচ্ছিন্ন মিউট্যান্ট স্ট্রেনগুলি প্রভাবশালী বা আধা-প্রভাবশালী মিউটেশন বহন করে (কুলিশ এবং ডায়াকভ, 3)। স্পষ্টতই, পারমাণবিক কূটনীতিক ইউভি বিকিরণের প্রভাবে মিউট্যান্টগুলি অর্জনের ব্যর্থ প্রচেষ্টাগুলির ব্যাখ্যা দেয় যা পূর্বে প্রতিরোধী জাতগুলির (ম্যাককি, ১৯1979৯) প্রতি মারাত্মক। লেখকের গণনা অনুসারে, এই পরিবর্তনগুলি 1969: 1 এরও কম ফ্রিকোয়েন্সি সহ ঘটতে পারে। যৌন বা অলৌকিক পুনঃসবেশন (নীচে দেখুন) এর কারণে একটি সমজাতীয়, ফেনোটাইপিকভাবে প্রকাশিত অবস্থায় পুনরুত্থক রূপান্তরগুলির সংক্রমণ ঘটতে পারে। যাইহোক, এই ক্ষেত্রেও, রূপান্তরটি বুনো ধরণের নিউক্লিয়াসের প্রভাবশালী অ্যালিলি দ্বারা সোনোটিক (বহুবিধ) মাইসেলিয়াম এবং ফেনোটাইপিকভাবে শুধুমাত্র মনোোনিউক্লিয়ার চিড়িয়াখানার গঠনের সময় স্থির করা যায়।
টেবিল ৮. নাইট্রোসোমথিলিউরিয়ার ক্রিয়াকলাপে পি-ইনফ্যান্স্যান্স মিউটেশনগুলির বৃদ্ধির সংক্রমণের (ডলগোভা, ডায়াকভ, 8; বাগিরোভা এট আল।, 1986)
যৌগিক | মিউটেশন ফ্রিকোয়েন্সি |
অক্সিটেট্রাইস্লাইন | 6,9 10 X-8 |
ব্লাস্টিস্টিডিন এস | 7,2 X 10-8 |
স্ট্রেপটোমাইসিন | 8,3 এক্স 10-8 |
ট্রাইকোথেসিন | 1,8 10 X-8 |
সাইক্লোহেক্সিমাইড | 2,1 10 X-8 |
দাকোনিল | <4 x 10-8 |
ডাইমথোমর্ফ | 6,3 10 X-7 |
মেটালাক্সিল | 6,9 10 X-6 |
জনসংখ্যার আকারগুলি স্বতঃস্ফূর্ত পরিবর্তনগুলির সংঘটনগুলির ক্ষেত্রে একটি সিদ্ধান্তক ভূমিকা পালন করে। খুব বড় জনগোষ্ঠীতে, এন কোষের সংখ্যা N> 1 / a, যেখানে a রূপান্তর হার, সেখানে পরিব্যক্তি একটি এলোমেলো ঘটনা হিসাবে বন্ধ হয়ে যায় (কেভিটকো, 1974)।
গণনাগুলি দেখায় যে একটি আলু ক্ষেতের গড় উপদ্রব (উদ্ভিদ প্রতি 35 টি দাগ) সহ 8x1012 স্পোরগুলি প্রতিদিন এক হেক্টর (ডায়াকভ এবং সুপ্রুন, 1984) তৈরি হয়। স্পষ্টতই, এই জনসংখ্যার প্রতিটি লোকসে এক্সচেঞ্জের ধরণের দ্বারা অনুমোদিত সমস্ত রূপান্তর রয়েছে contain এমনকি একটি বিরল মিউটেশন, যা 10-9 এর ফ্রিকোয়েন্সি সহ ঘটে, একটি আলু জমিতে এক হেক্টর জমিতে থাকা লক্ষ লক্ষ ব্যক্তির মধ্যে হাজার হাজার ব্যক্তি অধিগ্রহণ করবেন। উচ্চতর ফ্রিকোয়েন্সি (উদাহরণস্বরূপ, 10-6) এর সাথে সংঘটিত মিউটেশনের জন্য, এই জাতীয় জনসংখ্যায় প্রতিদিন বিভিন্ন জোড় পরিবর্তনগুলি ঘটতে পারে (একই সাথে দুটি লোকে), যেমন। মিউটেশনাল প্রক্রিয়া পুনরায় সংশোধন করবে।
মাইগ্রেশন
পি। ইনফ্যান্ট্যান্সের জন্য, দুটি প্রধান ধরণের মাইগ্রেশন জানা যায়: বাতাসের স্রোত বা বৃষ্টি স্প্রে দ্বারা চিড়িয়াখানা স্পর্শ করে (একটি আলুর ক্ষেত বা পার্শ্ববর্তী ক্ষেত্রের মধ্যে) দূরত্ব বন্ধ করা এবং কন্দ বা টমেটো ফল রোপণের সাথে দীর্ঘ দূরত্বের মধ্যে। প্রথম পদ্ধতিটি রোগের ফোকাসের প্রসারকে সরবরাহ করে, দ্বিতীয়টি - প্রাথমিক থেকে প্রত্যন্ত স্থানে নতুন ফোকি তৈরি করা।
টমেটো কন্দ এবং ফলের সাথে সংক্রমণের বিস্তার কেবল নতুন জায়গায় রোগের উত্থানে অবদান রাখে না, তবে জনসংখ্যার জিনগত বৈচিত্র্যের মূল উত্সও is মস্কো অঞ্চলে আলু চাষ করা হয়, রাশিয়া এবং পশ্চিম ইউরোপের বিভিন্ন অঞ্চল থেকে আনা হয়। টমেটো ফল রাশিয়ার দক্ষিণাঞ্চল (আস্ট্রাকান অঞ্চল, ক্রাসনোদার অঞ্চল, উত্তর ককেশাস) থেকে আনা হয়। টমেটো বীজ যা সংক্রমণের উত্স হিসাবে কাজ করতে পারে (রুবিন এট আল।, ২০০১), রাশিয়া, চীন, ইউরোপীয় দেশ এবং অন্যান্য দেশগুলির দক্ষিণ অঞ্চল থেকেও আমদানি করা হয়।
ই। মেয়ার (1974) দ্বারা গণনা অনুসারে, মিউটেশনগুলির কারণে স্থানীয় জনসংখ্যার জেনেটিক পরিবর্তনগুলি খুব কমই লোকাসে 10-5 এর বেশি হয়ে যায়, যখন প্রকাশ্য জনগোষ্ঠীতে জিনের পাল্টা প্রবাহের কারণে বিনিময় কমপক্ষে 10-3 - 10-4 হয়।
সংক্রামিত কন্দগুলিতে স্থানান্তর হ'ল ইউরোপে পি। ইনফেস্টানদের প্রবেশের জন্য দায়ী, বিশ্বের যে সমস্ত অঞ্চলে আলু জন্মায় সেখানে ছড়িয়ে পড়ে; তারা সবচেয়ে গুরুতর জনসংখ্যার পরিবর্তন ঘটায়। আলুতে দেরিতে দুর্যোগ পশ্চিম ইউরোপে এর উপস্থিতির সাথে প্রায় একইসাথে রাশিয়ান সাম্রাজ্যের ভূখণ্ডে উপস্থিত হয়েছিল।
যেহেতু এই রোগটি প্রথম বাল্টিক রাজ্যে 1846-1847 সালে চিহ্নিত হয়েছিল এবং কেবল পরবর্তী বছরগুলিতে বেলারুশ এবং রাশিয়ার উত্তর-পশ্চিমাঞ্চলে ছড়িয়ে পড়েছে, এর পশ্চিম ইউরোপীয় উত্স সুস্পষ্ট। ওল্ড ওয়ার্ল্ডে দেরি হওয়ার প্রথম উত্স এতটা সুস্পষ্ট নয়। ফ্রাই এট আল দ্বারা নির্মিত হাইপোথিসিসটি (ফ্রাই এট। এল। 1992; ফ্রাই, গুডউইন, 1995, গুডউইন এট আল।, 1994) সূচিত করে যে পরজীবীটি প্রথম মেক্সিকো থেকে উত্তর আমেরিকায় এসেছিল, যেখানে এটি ফসলের মাধ্যমে ছড়িয়ে পড়ে এবং পরে পশ্চিম ইউরোপে স্থানান্তরিত হয় (ডুমুর। 7)
বারবার প্রবাহের ফলে ("বোতল নখ" এর দ্বিগুণ প্রভাব) এর ফলে একক ক্লোনগুলি ইউরোপে চলে আসে, যার বংশের ফলে ওল্ড ওয়ার্ল্ডের সেই অঞ্চল জুড়ে মহামারী দেখা দেয় যেখানে আলু জন্মে। এই অনুমানের প্রমাণ হিসাবে, লেখকরা প্রথমত, কেবলমাত্র এক প্রকারের মিলনের (এ 1) সর্বব্যাপীতা এবং দ্বিতীয়ত, বিভিন্ন অঞ্চল থেকে অধ্যয়ন করা স্ট্রেনের জিনোটাইপগুলির একজাতীয়তা (এগুলির সবগুলিই 2 টি আইসোজাইম লোকি, ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্টিং নিদর্শন সহ অণু চিহ্নিতকারীগুলির উপর ভিত্তি করে) মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএর কাঠামোটি অভিন্ন এবং মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে বর্ণিত ক্লোন US-1 এর সাথে মিল রয়েছে)। তবে কিছু তথ্য বর্ণিত অনুমানের কমপক্ষে কিছু বিধান সম্পর্কে সন্দেহ উত্থাপন করে। 40 এর দশকের প্রথম এপিফাইটোটিক সময়কালে সংক্রামিত হার্বেরিয়াম আলু নমুনাগুলি থেকে বিচ্ছিন্ন পি ইনফেষ্টানস মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ বিশ্লেষণ করে দেখা গেছে যে তারা ক্লোন ইউএস -1 থেকে মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ গঠনে পৃথক, যা কমপক্ষে ছিল was ইউরোপে সংক্রমণের একমাত্র উত্স নয় (রিস্টেইনো এট আল, 2001)।
XX শতাব্দীর 80 এর দশকে দেরীতে দুর্যোগ পরিস্থিতি আবার খারাপ হয়েছিল। নিম্নলিখিত পরিবর্তনগুলি ঘটেছে:
1) জনসংখ্যার গড় আগ্রাসন বৃদ্ধি পেয়েছে, যা বিশেষত দেরিতে ব্লাইটের সবচেয়ে ক্ষতিকারক রূপের ব্যাপক বিস্তার ঘটায় - পেটিওলস এবং ডালপালার ক্ষতি করে damage
২) আলুতে দেরি হওয়ার সময়ে পরিবর্তন হয়েছিল - জুলাইয়ের শেষ থেকে জুলাইয়ের শুরু থেকে জুনের শেষের দিকেও।
3) A2 সঙ্গমের ধরণ যা পূর্বে ওল্ড ওয়ার্ল্ডে অনুপস্থিত ছিল, সর্বব্যাপী হয়ে উঠেছে।
দুটি ইভেন্টের আগে এই পরিবর্তনগুলি ঘটেছিল: নতুন ছত্রাকনাশক মেটালাক্সিলের বিশাল ব্যবহার (শুইন এবং স্টোব, 1980) এবং আলুর বিশ্ব রফতানিকারী হিসাবে মেক্সিকোয়ের উত্থান (নিডারহাউজার, 1993)। এর সাথে সামঞ্জস্য রেখে জনসংখ্যার পরিবর্তনের জন্য দুটি কারণ সামনে রাখা হয়েছিল: মেটালাক্সিলের প্রভাবে (কো, 1994) সঙ্গমের ধরণের রূপান্তর এবং মেক্সিকো থেকে আক্রান্ত কন্দের সাথে নতুন স্ট্রেনের প্রচলিত পরিচিতি (ফ্রাই এবং গুডউইন, 1995)। যদিও মেটালাক্সিলের প্রভাবে সঙ্গমের ধরণের আন্তঃসংযোগগুলি কেবল কো দ্বারা নয়, মস্কো স্টেট ইউনিভার্সিটির পরীক্ষাগারে (সাভেনকোভা, ছেরেপেনিকোভা-আনিকিনা, ২০০২) কাজকর্মগুলিতেও প্রাপ্ত হয়েছিল, তবে দ্বিতীয় অনুমানটি অধিষ্ঠিত। দ্বিতীয় ধরণের সঙ্গমের উপস্থিতির পাশাপাশি, নিরপেক্ষ জিন (আইসোজাইম এবং আরএফএলপি লোকী) সহ মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএর কাঠামোয় রাশিয়ান পি ইনফেষ্টান স্ট্রেনের জিনোটাইপগুলিতে গুরুতর পরিবর্তন ঘটেছিল। এই পরিবর্তনগুলির জটিলতা মেটালাক্সিলের ক্রিয়া দ্বারা ব্যাখ্যা করা যায় না, বরং মেক্সিকো থেকে প্রচুর নতুন স্ট্রেনের আমদানি হয়েছিল, যা আরও আক্রমণাত্মক (কাতো এট আল।, ১৯৯)) হয়ে জনগণের মধ্যে প্রভাবশালী হয়ে ওঠে পুরানো স্ট্রেনগুলি (মার্কিন -১) স্থানচ্যুত করে। ইউরোপীয় জনসংখ্যার সংমিশ্রণের পরিবর্তনটি খুব অল্প সময়ের মধ্যেই ঘটেছিল - ১৯৮০ থেকে 2002 সাল পর্যন্ত (ফ্রাই এট আল।, 1997)। প্রাক্তন ইউএসএসআর অঞ্চলে, 1 সালে এস্তোনিয়া থেকে সংগ্রহ করা "নতুন স্ট্রেন" পাওয়া গেছে, যা পোল্যান্ড এবং জার্মানির তুলনায় (গুডউইন এট আল।, 1980)। শেষবারের মতো রাশিয়ায় "পুরানো স্ট্রেন ইউএস -১" 1985 সালে মস্কো অঞ্চলে একটি সংক্রামিত টমেটো থেকে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল (ডলগোভা এট আল।, 1992)। ফ্রান্সেও, "পুরাতন" স্ট্রেনগুলি 1985 এর দশকের গোড়ার দিকে টমেটো রোপণের মধ্যে পাওয়া গিয়েছিল, অর্থাৎ তারা দীর্ঘ সময় আলুতে নিখোঁজ হয়ে যাওয়ার পরে (লেবার্টন এবং অ্যান্ড্রিভন, 1994)। পি। ইনফেষ্টান স্ট্রেনের পরিবর্তনগুলি অনেক ব্যবহারিক বৈশিষ্ট্যকে প্রভাবিত করেছিল, যার মধ্যে দুর্দান্ত ব্যবহারিক গুরুত্ব রয়েছে এবং দেরীতে দুরত্বের ক্ষতিকারকতা বৃদ্ধি পেয়েছে।
যৌন পুনরুদ্ধার
যৌনতার পুনঃনির্ধারণের পরিবর্তনশীলতায় অবদান রাখতে, প্রথমত, জনগণের মধ্যে 1: 1 এর অনুপাতে দুই ধরণের সঙ্গমের উপস্থিতি এবং দ্বিতীয়ত, প্রাথমিক জনসংখ্যার পরিবর্তনশীলতার উপস্থিতি প্রয়োজন।
সঙ্গমের ধরণের অনুপাত বিভিন্ন জনগোষ্ঠীতে এবং এক বছরে বিভিন্ন বছরেও বিস্তৃত হয় (সারণী 9,10, 90)। জনসংখ্যায় সঙ্গমের ধরণের ফ্রিকোয়েন্সিগুলিতে (যেমন উদাহরণস্বরূপ, রাশিয়া বা ইস্রায়েলে গত শতাব্দীর 2002 এর দশকের প্রথম দিকে) এই জাতীয় পরিবর্তনগুলির কারণগুলি অজানা, তবে এটি বিশ্বাস করা হয় যে এটি আরও প্রতিযোগিতামূলক ক্লোনগুলির (কোহেন, XNUMX) প্রবর্তনের কারণে ঘটেছে।
কিছু পরোক্ষ তথ্য নির্দিষ্ট বছর এবং নির্দিষ্ট অঞ্চলে যৌন প্রক্রিয়াটির গতিপথ নির্দেশ করে:
1) মস্কো অঞ্চল থেকে জনসংখ্যার অধ্যয়ন প্রমাণিত হয়েছে যে 13 জনসংখ্যায় যেখানে A2 সঙ্গমের ধরণের অংশ 10% এর চেয়ে কম ছিল, তিনটি আইসোজাইম লোকির জন্য গণনা করা মোট জিনগত বৈচিত্র্য ছিল 0,08, এবং 14 জনসংখ্যায় যেখানে A2 এর ভাগ অতিক্রম করেছে 30%, জেনেটিক বৈচিত্র্য দ্বিগুণ (0,15) (এলানস্কি এট আল।, 1999) ছিল। সুতরাং, যৌন মিলনের সম্ভাবনা তত বেশি, জনসংখ্যার জেনেটিক বৈচিত্র্য তত বেশি।
২) জনসংখ্যায় মিলনের ধরণের অনুপাত এবং spore গঠনের তীব্রতার মধ্যে সম্পর্ক ইস্রায়েলে (কোহেন এট আল।, ১৯৯)) এবং হল্যান্ডে লক্ষ্য করা গেছে
(ফ্লায়ার এট আল।, 2004)। আমাদের গবেষণায় দেখা গেছে যে জনসংখ্যায় যেখানে এ 2 সঙ্গমের ধরণের বিচ্ছিন্নতা রয়েছে, যথাক্রমে ,২, ১oo, ৯, এবং%% ছিল, oospores পাওয়া গেছে যথাক্রমে, 62, ৫০, ৩০, এবং বিশ্লেষণকৃত আলুর পাতার ১৫% (২ বা ততোধিক দাগ)।
2 বা আরও বেশি দাগযুক্ত নমুনাগুলিতে উল্লেখযোগ্যভাবে প্রায়শই 1 স্পট (যথাক্রমে 32 এবং 14% নমুনা) সহ নমুনাগুলির চেয়ে বেশি পরিমাণে ওপোরস থাকে (অ্যাপ্রিশকো এট আল।, 2004)।
আলু গাছের মাঝারি এবং নীচের স্তরের পাতায় ওসপোরসগুলি অনেক বেশি সাধারণ ছিল (মাইটা এট আল।, 2015; এলানস্কি এট আল।, 2016)।
3) কিছু অঞ্চলে, অনন্য জিনোটাইপগুলি আবিষ্কৃত হয়েছে, এর ঘটনাটি যৌন পুনর্সংশোধের সাথে সম্পর্কিত। সুতরাং, 1989 সালে পোল্যান্ডে এবং 1990 সালে ফ্রান্সে, গ্লুকোজ -6 এর জন্য সমজাতীয় স্ট্রেনগুলি
ফসফেট আইসোমেজ (জিপিআই 90/90)। যেহেতু 10 বছর ধরে কেবল 90/100 হিটারোজাইগোটেসের মুখোমুখি হয়েছিল, তাই হোমোজিগোসিটি যৌন পুনর্বাসনের জন্য দায়ী করা হয় (সুজকোভস্কি এট আল।, 1994)। কলম্বিয়াতে (ইউএসএ), জিপিআই 2/100 এর সাথে এ 110 এবং জিপিআই 1/100 এর সাথে এ 100 এর সংযুক্ত বিচ্ছিন্নতাগুলি সাধারণভাবে দেখা যায়, তবে 1994 মরশুমের শেষে (আগস্ট 16 এবং সেপ্টেম্বর 9), পুনরায় সংক্ষিপ্ত জিনোটাইপগুলির সাথে স্ট্রেন (এ 1 জিপিআই 100/110) এবং এ 2 জিপিআই 100/100) (মিলার এট আল।, 1997)।
4) পোল্যান্ডের কিছু জনগোষ্ঠীতে (সুজকোভস্কি এট আল।, 1994) এবং উত্তর ককেশাস (আমাখানোভা এট আল।, 2004) -তে ফিঙ্গারপ্রিন্ট ডিএনএ লোকি এবং অ্যালোজাইম প্রোটিন লোকির বন্টন হার্ডি-ওয়েইনবার্গ বিতরণের সাথে মিলে যায়, যা নির্দেশ করে
জনসংখ্যার পরিবর্তনশীলতায় যৌন পুনর্বিবেচনার অবদানের উচ্চ ভাগ সম্পর্কে। রাশিয়ার অন্যান্য অঞ্চলগুলিতে জনসংখ্যার মধ্যে হার্ডি-ওয়েইনবার্গ বিতরণ সম্পর্কিত কোনও চিঠিপত্র পাওয়া যায় নি, তবে লিঙ্কেজ ডিসঅ্যাসিলিব্রিয়ামের উপস্থিতি প্রদর্শিত হয়েছিল, যা ক্লোনাল প্রজনন (এলানস্কি এট আল।, 1999) এর প্রাধান্যকে নির্দেশ করে।
৫) বিভিন্ন মিলনের ধরণের (এ 5 এবং এ 1) স্ট্রেনের মধ্যে জেনেটিক ডাইভারসিটি (জিএসটি) বিভিন্ন জনসংখ্যার (সুজকোস্কি এট আল।, 2) এর চেয়ে কম ছিল, যা পরোক্ষভাবে যৌন ক্রসকে নির্দেশ করে।
একই সময়ে, জনসংখ্যার বৈচিত্র্যে যৌন পুনর্বিবেচনার অবদান খুব বেশি হতে পারে না। এই অবদানটি মস্কো অঞ্চলের জনগণের জন্য গণনা করা হয়েছিল (এলানস্কি এট আল।, 1999)। লেওন্টিনের (১৯ (৯) গণনা অনুসারে, "পুনরায় সংশ্লেষ, যা দুটি ভিন্ন লোকের সাথে তার ভিন্ন ভিন্ন উপকরণগুলির উত্পাদনকে অতিক্রম করে না এমন দুটি ফ্রিকোয়েন্সি থেকে নতুন রূপের উত্পাদন করতে পারে, কেবল তখনই কার্যকর হয় যদি উভয় এলিলের জন্য হেটেরোজিগোসিটির মান ইতিমধ্যে বেশি থাকে।"
দুটি ধরণের জুড়ি অনুপাতের সাথে, যা মস্কো অঞ্চলের জন্য সাধারণ, 4: 1 এর সমান, পুনঃসংযোগের ফ্রিকোয়েন্সি 0,25 হবে। অধ্যয়নকারী জনসংখ্যার তিনটি অধ্যয়নরত আইসোজাইগাস লোকির মধ্যে দু'জনের মধ্যে স্ট্রেনগুলি অতিক্রম করার সম্ভাবনা হ'ল 0,01 (2 এর মধ্যে 177 টি স্ট্রেন) ছিল। ফলস্বরূপ, পুনর্বাসনের ফলাফল হিসাবে ডাবল হেটেরোজাইগোটেসের সংক্রমণের সম্ভাবনা তাদের পণ্যকে ক্রসিংয়ের সম্ভাবনা (0,25x0,02x0,02) = 10-4 দ্বারা গুণিত করা উচিত নয়, অর্থাৎ। যৌন পুনরুদ্ধারকারীরা সাধারণত স্ট্রেনের অধ্যয়নিত নমুনায় পড়ে না। এই গণনাগুলি মস্কো অঞ্চল থেকে জনগণের জন্য তৈরি করা হয়েছিল, যা তুলনামূলকভাবে উচ্চ পরিবর্তনশীলতার দ্বারা চিহ্নিত। সাইবেরিয়ার মতো মনমোর্ফিক জনসংখ্যায় যৌন প্রক্রিয়া, এমনকি এটি পৃথক জনগোষ্ঠীতে দেখা দিলেও, তাদের জিনগত বৈচিত্রকে প্রভাবিত করতে পারে না।
এছাড়াও, পি। ইনফেষ্টানস মায়োসিসে ঘন ক্রোমোজোম মিস্যালাইনমেন্ট দ্বারা চিহ্নিত করা হয়, যা অ্যানিওপ্লয়াইডি বাড়ে (কার্টার এট আল।, 1999)। এই ধরনের লঙ্ঘন সংকরগুলির উর্বরতা হ্রাস করে।
প্যারাসেক্সুয়াল পুনঃসংযোগ, মাইটোটিক জিন রূপান্তর
বিভিন্ন বৃদ্ধি বাধা প্রতিরোধক হিসাবে মিঃ পরিবর্তনগুলির সাথে পি। ইনফেষ্টান স্ট্রেনগুলির বিভক্তকরণের পরীক্ষাগুলিতে, উভয় প্রতিরোধকের বিরুদ্ধে প্রতিরোধী বিবিধের উত্থান পাওয়া গেছে (স্টটক এবং শ, 1975; ডায়াকভ, কুজনভিকোভা, 1974; কুলিশ, ডায়াকভ,
1979)। মাইসেলিয়ামের হেটেরোকেরিয়োটাইজেশনের ফলে দুটি গ্রোথ ইনহিবিটারের বিরুদ্ধে প্রতিরোধী স্ট্রেনগুলি উত্থিত হয়েছিল এবং এই ক্ষেত্রে তারা মনোনিউক্লিয়ার চিড়িয়াখানা (জুডেলসন, জি ইয়াং, 1998) দ্বারা প্রজননের সময় ক্লিভ করে বা একচেটিয়া বংশধর ছিল না, কারণ তাদের টিট্রাপ্লয়েড ছিল (যেহেতু প্রাথমিক বিচ্ছিন্নতা নিউক্লিড ডিপ্লয়েড) , 1979)। হ্যাপরোয়েডাইজেশন, ক্রোমোসোম ননডিজঞ্জানশন এবং মাইটোটিক ক্রসিংয়ের কারণে খুব কম ফ্রিকোয়েন্সিতে বিভাজনযুক্ত হিটারোজাইগাস ডিপ্লোডগুলি (পোয়েডিনোক এট আল।, 1982)। এই প্রক্রিয়াগুলির ফ্রিকোয়েন্সি হিটারোজাইগাস ডিপ্লোডিতে (যেমন উদাহরণস্বরূপ, অঙ্কুরোদগমের বীজগুলির UV প্রসারণ) নির্দিষ্ট ক্রিয়াগুলির সাহায্যে বাড়ানো যেতে পারে।
যদিও দ্বৈত প্রতিরোধের সাথে উদ্ভিজ্জ সংকর গঠনের কারণ কেবল ভিট্রোই নয়, আলু কন্দগুলিতে মিউট্যান্টের মিশ্রণে সংক্রামিত হয় (কুলিশ এট আল। হ্যাপলয়েডাইজেশন, ক্রোমোসোমগুলির ননডিসঞ্জেকশন এবং বিশেষ প্রভাব ছাড়াই মাইটোটিক ক্রসিংয়ের কারণে সেগ্রেগান্টস গঠনের ফ্রিকোয়েন্সি নগণ্য (1978-10 এরও কম)।
হেটেরোজাইগাস স্ট্রেনের হোমোজাইগাস সেগ্রিগান্টস এর উপস্থিতি মিটোটিক ক্রসিং ওভার এবং মাইটোটিক জিন রূপান্তর উভয়ের উপর ভিত্তি করে হতে পারে, যা পি। সোজাতে লোকস প্রতি 3 x 10-2 থেকে 5 x 10-5 এর ফ্রিকোয়েন্সি দেখা যায় (চামনানপান্ট এট আল। , 2001)।
যদিও হেটেরোকেরিয়নস এবং হেটেরোজাইগাস ডিপ্লোডিজগুলির সংঘটনটি অপ্রত্যাশিতভাবে উচ্চতর হয়ে উঠেছে (দশকের দশকে পৌঁছেছে), এই প্রক্রিয়াটি তখনই ঘটে যখন একই স্ট্রেন থেকে প্রাপ্ত মিউট্যান্ট সংস্কৃতিগুলি বিভক্ত হয়। প্রকৃতি থেকে বিচ্ছিন্ন বিভিন্ন স্ট্রেন ব্যবহার করার সময়, উদ্ভিদীয় অসম্পূর্ণতার উপস্থিতির কারণে হেটেরোকারিয়োটাইজেশন ঘটে না (বা খুব কম ফ্রিকোয়েন্সি সহ ঘটে) (পোয়েডিনোক এবং ডায়াকভ, 1981; আনিকিনা এট আল।, 1997 বি; চেরেপেনিকোভা-আনিকিনা এট আল। 2002)। ফলস্বরূপ, প্যারাসেক্সুয়াল পুনঃসংযোগের ভূমিকাটি হেটরোজাইগাস নিউক্লিয়ায় কেবল আন্তজাতীয় পুনঃসংযোগ এবং যৌন প্রক্রিয়া ব্যতীত পৃথক জিনকে একটি সমজাতীয় অবস্থাতে স্থানান্তরিত করতে হ্রাস করা যেতে পারে। এই প্রক্রিয়াটি মন্দা বা অর্ধ-প্রভাবশালী ছত্রাকনাশক প্রতিরোধের মিউটেশনগুলির সাথে স্ট্রেনগুলিতে মহামারী সংক্রান্ত তাত্পর্যপূর্ণ হতে পারে। প্যারাসেক্সুয়াল প্রক্রিয়াটির কারণে এটি একটি সমজাতীয় রাজ্যে রূপান্তরিতকরণ পরিবর্তনের বাহকের প্রতিরোধকে বাড়িয়ে তুলবে (ডলগোভা, ডায়াকভ, 1986)।
জিনের ভূমিকা
হিটারোথ্যালিক প্রজাতি ফাইটোফথোরা সংকর ওসপোরস গঠনে হস্তক্ষেপ করতে সক্ষম (ভোরোবেভা এবং গ্রিডনেভ, ১৯৮৩; সানসোম এট অ্যাল।, 1983; ভেল্ড এট আল, 1991)। দুটি ফাইটোফোথোরা প্রজাতির প্রাকৃতিক সংকরটি এতটাই আক্রমণাত্মক ছিল যে এটি যুক্তরাজ্যের হাজার হাজার বয়স্ককে হত্যা করেছিল (ব্রাসিয়ার এট আল।, 1998)। পি। ইনফ্যান্ট্যানস সাধারণ হোস্ট গাছ এবং মাটিতে জেনাসের অন্যান্য প্রজাতির (পি। এরিথ্রোসেপটিকা, পি। নিকোটিয়ানা, পি। ক্যাক্টোরিয়াম ইত্যাদি) সাথে সংঘটিত হতে পারে তবে আন্তঃসংক্রান্ত হাইব্রিড হওয়ার সম্ভাবনা নিয়ে সাহিত্যে খুব কম তথ্য পাওয়া যায়। পরীক্ষাগার শর্তে, পি। ইনফেষ্টানস এবং পি। মীরাবিলিস (গুডউইন এবং ফ্রাই, 1999) এর মধ্যে সংকরগুলি প্রাপ্ত হয়েছিল।
সারণী ৯. ১৯৯০ থেকে ২০০০ সাল পর্যন্ত বিশ্বের বিভিন্ন দেশে পি-ইনফ্যান্ট্যান্সের স্ট্রেনের অনুপাত (উন্মুক্ত সাহিত্যের উত্স এবং সাইটগুলি www.euroblight.net, www.eucablight.org এর তথ্য অনুসারে)
দেশ | 1990 | 1991 | 1992 | 1993 | 1994 | 1995 | 1996 | 1997 | 1998 | 1999 | 2000 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
বেলারুশ | 33 (12) | 34 (29) | |||||||||
বেলজিয়াম | 15 (49 *) | 6 (66) | 20 (86) | ||||||||
ইকোয়াডর | 0 (13) | 0 (12) | 0 (19) | 0 (21) | 12 (41) | 25 (39) | 15 (75) | 22 (73) | 25 (68) | 0 (35) | |
এস্তোনিয়াদেশ | 8 (12) | ||||||||||
ইংল্যান্ড | 4 (26) | 3 (630) | 9 (336) | ||||||||
ফিনল্যাণ্ড | 0 (15) | 19 (117) | 12 (16) | 21 (447) | 6 (509) | 9 (432) | 43 (550) | ||||
ফ্রান্স | 0 (35) | 0 (56) | 0 (83) | 0 (67) | 0 (86) | 2 (135) | 7 (156) | 6 (123) | 0 (73) | 0 (285) | 0 (135) |
হাঙ্গেরি | 72 (32) | ||||||||||
আয়ারল্যাণ্ড | 4 (145) | ||||||||||
উত্তর। আয়ারল্যান্ড | 10 (41) | 9 (58) | 1 (106) | 0 (185) | 0 (18) | 0 (56) | 0 (35) | 0 (26) | |||
নেদারল্যান্ডস | 7 (41) | 5 (276) | 24 (377) | 44 (353) | 23 (185) | ||||||
নরত্তএদেশ | 25 (446) | 28 (156) | 8 (39) | 18 (257) | 38 (197) | ||||||
পেরু | 0 (34, 1984 -86) | 0 (287, 1997-98) | 0 (112) | 0 (66) | |||||||
পোল্যান্ড | 19 (180) | 21 (142) | 33 (256) | 26 (149) | 35 (70) | ||||||
স্কটল্যান্ড | 25 (147) | 11 (163) | 22 (189) | 5 (22) | |||||||
সুইডেন | 25 (263) | 62 (258) | 49 (163) | ||||||||
ওয়েলস | 0 (16) | 7 (97) | 0 (48) | 0 (25) | |||||||
কোরিয়া | 36 (42) | 10 (130) | 15 (98) | ||||||||
চীন | 20 (142, 1995-98) | 0 (6) | 0 (8) | 0 (35) | |||||||
কলোমবিয়া | 0 (40, 1994-2000) | ||||||||||
উরুগুয়ে | 100 (25, 1998-99) | ||||||||||
মরক্কো | 60 (108, 1997-2000) | 52 (25) | 42 (40) | ||||||||
সার্বিয়া | 76 (37) | ||||||||||
মেক্সিকো (টলুকা) | 28 (292, 1988-89) | 50 (389, 1997-98) |
সারণী ১০. ২০০৯ থেকে ২০১১ সাল পর্যন্ত বিশ্বের বিভিন্ন দেশে A10 সঙ্গমের ধরণের পি-ইনফ্যান্টান্সের স্ট্রেনের অনুপাত
দেশ | 2001 | 2002 | 2003 | 2004 | 2005 | 2006 | 2007 | 2008 | 2009 | 2010 | 2011 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
অস্ট্রিয়া | 65 (83) | ||||||||||
বেলারুশ | 42 (78) | ||||||||||
বেলজিয়াম | 20 (102 *) | 4 (32) | 50 (14) | 25 (16) | 62 (13) | 54 (26) | 70 (54) | 30 (23) | 29 (35) | 62 (71) | 45 (49) |
সুইজারল্যান্ড | 89 (19) | ||||||||||
চেক প্রজাতন্ত্র | 35 (31) | 54 (64) | 38 (174) | 12 (80) | |||||||
জার্মানি | 95 (53) | ||||||||||
ডেন্মার্ক্ | 48 (52) | ||||||||||
ইকোয়াডর | 5 (178) | 6 (108) | 9 (121) | 18 (94) | 2 (44) | 0 (66) | 5 (47) | ||||
এস্তোনিয়াদেশ | 54 (25) | 0 (24) | 33 (62) | 45 (140) | 25 (100) | 12 (103) | |||||
ইংল্যান্ড | 4 (47) | 10 (96) | 31 (55) | 55 (790) | 68 (862) | 70 (552) | 68 (299) | ||||
ফিনল্যাণ্ড | 47 (162) | 12 (218) | 42 | ||||||||
ফ্রান্স | 0 (186) | 4 (108) | 8 (61) | 22 (103) | 33 (303) | 65 (378) | 74 (331) | 75 (125) | 75 (12) | ||
হাঙ্গেরি | 48 (27) | 48 (90) | 9 | 7 | |||||||
উত্তর। আয়ারল্যান্ড | 0 (38) | 0 (58) | 0 (40) | 0 (24) | 5 (54) | 0 (18) | 27 (578) | 45 (239) | 36 (213) | 82 (60) | 10 (80) |
নেদারল্যান্ডস | 66 (24) | 93 (15) | 91 (11) | ||||||||
নরত্তএদেশ | 39 (328) | 3 (115) | 12 (19) | ||||||||
পেরু | 0 (36) | ||||||||||
পোল্যান্ড | 25 (46) | 10 (30) | 85 (20) | 38 (44) | 75 (66) | 55 (56) | 65 (35) | 72 (81) | 85 (21) | ||
স্কটল্যান্ড | 3 (213) | 2 (474) | 24 (135) | 86 (337) | 88 (386) | 74 (172) | |||||
সুইডেন | 60 (277) | 39 (87) | |||||||||
স্লোভাকিয়া | 0 (36) | 14 (26) | 62 (26) | 0 (26) | |||||||
ওয়েলস | 25 (12) | 68 (106) | 80 (88) | 92 (143) | 75 (45) | ||||||
কোরিয়া | 46 (26) | ||||||||||
ব্রাজিল | 0 (49) | 0 (30) | |||||||||
চীন | 10 (30) | 0 (6) | 0 (6) | ||||||||
ভিয়েতনাম | 0 (294, 2003-04) | ||||||||||
উগান্ডা | 0 (8) |
জনসংখ্যার জিনোটাইপিক রচনার গতিবিদ্যা
পি। ইনফেষ্টানস জনসংখ্যার জিনোটাইপিক সংমিশ্রনের পরিবর্তনগুলি অন্যান্য অঞ্চল থেকে নতুন ক্লোনগুলির স্থানান্তর, কৃষিকাজগুলি (বিভিন্ন ধরণের পরিবর্তন, ছত্রাকনাশকের প্রয়োগ) এবং আবহাওয়ার অবস্থার প্রভাবের অধীনে হতে পারে। বাহ্যিক প্রভাবগুলি জীবনচক্রের বিভিন্ন পর্যায়ে বিভিন্ন ক্লোনকে প্রভাবিত করে; সুতরাং, জনগণ বার্ষিক জিনের প্রবাহ এবং নির্বাচনের মূল ভূমিকা পরিবর্তনের কারণে জিনের ফ্রিকোয়েন্সিগুলিতে চক্রীয় পরিবর্তনগুলি অনুভব করে।
বিভিন্নতার প্রভাব lu
উল্লম্ব প্রতিরোধের জন্য কার্যকর জিন সহ নতুন জাতগুলি (আর-জিন) একটি শক্তিশালী নির্বাচনী ফ্যাক্টর, পি। ইনফেসট্যান্স জনসংখ্যার পরিপূরক ভাইরুলেন্স জিন সহ ক্লোন নির্বাচন করে। আলু জাতের অনিচ্ছুক প্রতিরোধের অভাবে, যা প্যাথোজেন জনসংখ্যার বৃদ্ধিকে বাধা দেয়, জনসংখ্যার মধ্যে প্রভাবশালী ক্লোনগুলি প্রতিস্থাপনের প্রক্রিয়া খুব দ্রুত ঘটে। সুতরাং, ডোমোডেডভস্কি জাতের মস্কো অঞ্চলে ছড়িয়ে যাওয়ার পরে, যার আর 3 প্রতিরোধের জিন রয়েছে, এই জাতের জন্য ভাইরুল ক্লোনগুলির ফ্রিকোয়েন্সি এক বছরে 0,2 থেকে 0,82 হয়ে বেড়েছে (ডায়াকভ এবং ডেরেভজিনা, 2000)।
তবে জনসংখ্যায় ভাইরুলেন্স জিনের (প্যাথোটাইপস) ফ্রিকোয়েন্সি পরিবর্তন কেবল আবাদকৃত আলুর জাতের প্রভাবেই ঘটে না। উদাহরণস্বরূপ, 1977 সাল পর্যন্ত বেলারুশে, ভাইরাস জিন 1 এবং 4 এর ক্লোনগুলি প্রাধান্য পেয়েছিল, যা প্রতিরোধী জিন আর 1 এবং আর 4 (ডরোজকিন, বেলস্কায়া, 1979) এর সাথে আলুর জাতের চাষের ফলে ঘটেছিল। যাইহোক, 70 শতকের 2002 এর দশকের শেষে, ক্লোনগুলি বিভিন্ন ভাইরুলেন্স জিন এবং তাদের সংমিশ্রণগুলির সাথে উপস্থিত হয়েছিল এবং পরিপূরক প্রতিরোধের জিনগুলি আলু প্রজননে (অতিরিক্ত ভাইরুলেন্স জিন) কখনও ব্যবহৃত হয়নি (আইভানিউক এট আল।, XNUMX)। স্পষ্টতই এই জাতীয় ক্লোনগুলির উপস্থিতির কারণটি হল আলুর কন্দ সহ মেক্সিকো থেকে সংক্রামক পদার্থের ইউরোপে পাড়ি দেওয়া। বাড়িতে, এই ক্লোনগুলি কেবল আবাদকৃত আলুতেই নয়, বন্য প্রজাতির বিভিন্ন ধরণের প্রতিরোধ জিন বহন করে; সুতরাং, জিনোমে অনেকগুলি ভাইরাস জিনের সংমিশ্রণটি সেই পরিস্থিতিতে বেঁচে থাকার জন্য প্রয়োজনীয় ছিল।
অদম্য প্রতিরোধের সহ বিভিন্ন প্রকারের ক্ষেত্রে, তারা, প্যাথোজেনের প্রজননের হার হ্রাস করে, এর জনসংখ্যার বিবর্তনকে বিলম্বিত করে, যা ইতিমধ্যে উল্লিখিত রয়েছে, সংখ্যার ফাংশন। আগ্রাসীতা বহুভুজ হওয়ায় "আগ্রাসন" এর জন্য আরও বেশি সংখ্যক জিনযুক্ত ক্লোনগুলি যত দ্রুত জনসংখ্যার আকারের তত দ্রুত জমা হয়। অতএব, অত্যন্ত আক্রমণাত্মক ঘোড়দৌড়গুলি অনিচ্ছুক প্রতিরোধের সাথে চাষকৃত জাতগুলির সাথে অভিযোজিতের পণ্য নয়, তবে বিপরীতে, উচ্চ সংবেদনশীল জাতগুলির উদ্ভিদগুলিতে যেগুলি পরজীবী স্পোরগুলির সংশ্লেষকগুলির উদ্ভিদগুলির মধ্যে সনাক্ত করা সম্ভব হয়।
সুতরাং, রাশিয়ায়, পি। ইনফেষ্টানসের সবচেয়ে আক্রমণাত্মক জনসংখ্যা বার্ষিক এপিফিটোটিজ অঞ্চলে (সখালিন, লেনিনগ্রাদ এবং ব্রায়ানস্ক অঞ্চলগুলির জনসংখ্যা) পাওয়া গিয়েছিল। এই জনগোষ্ঠীর আগ্রাসীতা মেক্সিকানদের চেয়ে বেশি হয়ে উঠেছে (ফিলিপভ এট আল।, ২০০৪)।
এছাড়াও, সংবেদনশীলগুলির চেয়ে প্রতিরোধী জাতের পাতাগুলিতে কম অস্টস্পোর গঠিত হয় (হ্যানসন এবং শ্যাটক, 1998), অর্থাত্, জাতটির অদম্য প্রতিরোধ ক্ষমতাও পরজীবীর পুনর্বাসনের ক্ষমতা এবং বিকল্প শীতকালীন পদ্ধতির সম্ভাবনা হ্রাস করে।
ছত্রাকনাশকের প্রভাব
ছত্রাকনাশক কেবল ফাইটোপ্যাথোজেনিক ছত্রাকের সংখ্যা হ্রাস করে না, অর্থাত্ তাদের জনসংখ্যার পরিমাণগত বৈশিষ্ট্যগুলিকে প্রভাবিত করে তবে তারা পৃথক জিনোটাইপগুলির ফ্রিকোয়েন্সিও পরিবর্তন করতে পারে, যেমন। জনসংখ্যার গুণগত রচনাকে প্রভাবিত করুন। ছত্রাকনাশকের প্রভাবের অধীনে জনসংখ্যার পরিবর্তনগুলির সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ সূচকগুলির মধ্যে নিম্নলিখিত: ফাঙ্গাসাইডগুলির প্রতিরোধের পরিবর্তন, আগ্রাসন এবং ভাইরালেন্সে পরিবর্তন এবং প্রজনন ব্যবস্থায় পরিবর্তন।
জনসংখ্যার প্রতিরোধ ও আগ্রাসনে ছত্রাকের প্রভাব
এই প্রভাবের ডিগ্রিটি সর্বপ্রথম ব্যবহৃত ছত্রাকনাশকের ধরণের দ্বারা নির্ধারিত হয়, যা শর্তাধীনভাবে পলিসাইট, অলিগোসাইট এবং মনোসাইটে বিভক্ত করা যেতে পারে।
পূর্ববর্তীটিতে বেশিরভাগ যোগাযোগ ছত্রাকনাশক অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। তাদের প্রতিরোধের (এটি যদি কিছুটা সম্ভব হয় তবে) প্রচুর সংখ্যক অত্যন্ত দুর্বল প্রকাশযুক্ত জিন দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়। এই বৈশিষ্ট্যগুলি ছত্রাকনাশক দিয়ে চিকিত্সার পরে জনসংখ্যার প্রতিরোধের দৃশ্যমান পরিবর্তনের অনুপস্থিতি নির্ধারণ করে (যদিও কিছু পরীক্ষায়, প্রতিরোধের কিছুটা বৃদ্ধি পেয়েছিল)। যোগাযোগ ছত্রাকনাশক স্প্রে করার পরে ছত্রাকের জনসংখ্যা দুটি গ্রুপের স্ট্রেন নিয়ে গঠিত:
1) ড্রাগের সাথে চিকিত্সা না করা গাছগুলির অঞ্চলে স্ট্রেনগুলি সংরক্ষণ করা হয়। ছত্রাকনাশকের সাথে কোনও যোগাযোগ না হওয়ায় এই স্ট্রেনের আগ্রাসন এবং প্রতিরোধের পরিবর্তন হয় না।
২) ছত্রাকনাশকের সংস্পর্শে আসা স্ট্রেনগুলি, যোগাযোগের পয়েন্টগুলিতে ঘনত্ব প্রাণঘাতী থেকে কম ছিল। উপরে উল্লিখিত হিসাবে, জনসংখ্যার এই অংশের প্রতিরোধেরও পরিবর্তন হয় না, তবে ছত্রাকের কোষের বিপাক, সাধারণ ফিটনেস এবং এর পরজীবী উপাদান, আক্রমণাত্মকতা, হ্রাস (ডেরেভিগিনা এবং ডায়াকভ, 2) এর ছত্রাকজনিত গা on় ঘনত্বেও ছত্রাকনাশকের আংশিক ক্ষতিকারক প্রভাবের কারণে।
সুতরাং, এমনকি জনসংখ্যার এমন একটি অংশ যা মারা যায় নি, ছত্রাকনাশকের সাথে যোগাযোগের সংস্পর্শে আসে, দুর্বল আগ্রাসন হয় এবং এপিফাইটোটিকের উত্স হতে পারে না। সুতরাং, সাবধানে চিকিত্সা যা ছত্রাকনাশকের সংস্পর্শে না জনসংখ্যার অনুপাতের ফ্রিকোয়েন্সি হ্রাস করে প্রতিরোধমূলক ব্যবস্থা সাফল্যের জন্য একটি শর্ত। অলিগোসাইট ছত্রাকনাশকের প্রতিরোধ বেশ কয়েকটি অ্যাডিটিভ জিন দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়।
প্রতিটি জিনের পরিবর্তনের ফলে প্রতিরোধের কিছুটা বৃদ্ধি ঘটে এবং সামগ্রিকভাবে প্রতিরোধের ডিগ্রিটি এ জাতীয় পরিবর্তনগুলির সংযোজনের কারণে হয়। অতএব, প্রতিরোধের বৃদ্ধি পদক্ষেপে ঘটে। প্রতিরোধের ধাপে ধাপে বাড়ার একটি উদাহরণ হ'ল ছত্রাকনাশক ডাইমথোমর্ফের প্রতিরোধের রূপান্তর যা হ'ল দেরি হওয়া থেকে আলু রক্ষা করতে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। ডাইমথোমর্ফ প্রতিরোধের বহুভুজ এবং সংযোজক। এক-পদক্ষেপের রূপান্তর সামান্য প্রতিরোধ ক্ষমতা বাড়ায়।
প্রতিটি পরবর্তী মিউটেশন লক্ষ্য আকার হ্রাস করে এবং ফলস্বরূপ পরবর্তী পরিবর্তনগুলির ফ্রিকোয়েন্সি (বাগিরোভা এট আল।, 2001)। অলিগোসাইট ছত্রাকনাশকের সাথে বারবার চিকিত্সার পরে জনসংখ্যার গড় প্রতিরোধের বৃদ্ধি ধাপে ধীরে ধীরে ঘটে। এই প্রক্রিয়াটির গতি কমপক্ষে তিনটি কারণ দ্বারা নির্ধারিত হয়: প্রতিরোধের জিনের রূপান্তরকরণের ফ্রিকোয়েন্সি, প্রতিরোধের সহগ (সংবেদনশীলের সাথে প্রতিরোধী স্ট্রেনের মারাত্মক ডোজ অনুপাত) এবং ফিটনেসে প্রতিরোধ জিনগুলিতে বিবর্তনের প্রভাব।
পরবর্তী প্রতিটি পরিবর্তনের ঘটনার ফ্রিকোয়েন্সি আগেরটির তুলনায় কম; অতএব, প্রক্রিয়াটিতে একটি স্যাঁতসেঁতে চরিত্র রয়েছে (বাগিরোভা এট আল।, 2001)। তবে, যদি কোনও জনগোষ্ঠীতে পুনঃসংশোধন প্রক্রিয়া (যৌন বা প্যারাসেক্সুয়াল) ঘটে থাকে তবে হাইব্রিড স্ট্রেনে পিতামাতার বিভিন্ন রূপকে একত্রিত করা এবং প্রক্রিয়াটি ত্বরান্বিত করা সম্ভব। অতএব, প্যানমিক্স জনসংখ্যাগুলি বায়বীয় জনসংখ্যার তুলনায় দ্রুত প্রতিরোধ অর্জন করে এবং পরবর্তীকালে, এমন বাধাগুলি দ্বারা বিচ্ছিন্ন জনসংখ্যার চেয়ে দ্রুত উদ্ভিদ অসম্পূর্ণতা বাধা নেই এমন জনগোষ্ঠী faster এই ক্ষেত্রে, সঙ্গমের ধরণের মধ্যে পৃথক জনগোষ্ঠীর মধ্যে স্ট্রেনের উপস্থিতি অলিগোসাইট ছত্রাকনাশকের প্রতিরোধের প্রক্রিয়া অর্জনের প্রক্রিয়াটিকে ত্বরান্বিত করে।
দ্বিতীয় এবং তৃতীয় কারণগুলি জনসংখ্যায় ডাইমথোমর্ফ-প্রতিরোধী স্ট্রেনগুলির দ্রুত জমে জড়িততে অবদান রাখে না। প্রতিটি পরবর্তী পরিবর্তনগুলি প্রতিরোধকে দ্বিগুণ করে, যা তাত্পর্যপূর্ণ এবং একই সাথে কৃত্রিম পরিবেশ এবং আগ্রাসনে উভয়ই বৃদ্ধির হার হ্রাস করে (বাগিরোভা এট আল।, 2001; স্টেম, কার্ক, 2004)। সম্ভবত এই কারণেই প্রাকৃতিক পি ইনফেষ্টান স্ট্রেনগুলির মধ্যে কার্যত কোনও প্রতিরোধী স্ট্রেন নেই, এমনকি আলু গাছ থেকে সংগ্রহ করা ডাইমেথোমর্ফ দিয়ে চিকিত্সাও করা হয়।
অলিগোসাইট ছত্রাকনাশকের সাথে চিকিত্সা করা একটি জনগোষ্ঠীর মধ্যেও দুটি গ্রুপের স্ট্রেন থাকে: যারা ছত্রাকনাশকের সংস্পর্শে আসে নি এবং তাই প্রাথমিক বৈশিষ্ট্যগুলি পরিবর্তন করেনি (যদি এই গ্রুপের মধ্যে প্রতিরোধী স্ট্রেনগুলি পাওয়া যায় তবে সংবেদনশীল স্ট্রেনগুলির উচ্চতর আগ্রাসন এবং প্রতিযোগিতার কারণে তারা একত্রিত হবে না), এবং ছত্রাকনাশকের সুসংহত ঘনত্বের সংস্পর্শে রয়েছে। এটি পরবর্তীকালের মধ্যে রয়েছে যে প্রতিরোধী স্ট্রেনের সংশ্লেষ সম্ভব, কারণ এখানে সংবেদনশীলগুলির চেয়ে তাদের সুবিধা রয়েছে।
অতএব, অলিগোসাইট ছত্রাকনাশক ব্যবহার করার সময়, এটি এতটুকু নিখুঁত চিকিত্সা নয় যে ড্রাগের উচ্চ ঘনত্ব হিসাবে মারাত্মক ডোজ থেকে কয়েকগুণ বেশি, কারণ ধাপে ধীরে ধীরে মিউটেজেনসিসের সাথে, পরিবর্তিত স্ট্রেনগুলির প্রাথমিক প্রতিরোধ ক্ষমতা কম হয়।
অবশেষে, মনোসাইট ছত্রাকনাশকের বিরুদ্ধে প্রতিরোধের রূপান্তরগুলি অত্যন্ত উদ্বেগজনক, অর্থাত, একটি রূপান্তর সংবেদনশীলতা সম্পূর্ণরূপে হ্রাস হওয়া পর্যন্ত উচ্চ মাত্রার প্রতিরোধের প্রতিবেদন করতে পারে। অতএব, জনসংখ্যার প্রতিরোধের বৃদ্ধি খুব দ্রুত ঘটে।
এই জাতীয় ছত্রাকজনিতগুলির একটি উদাহরণ সবচেয়ে সাধারণ ছত্রাকনাশক, মেটালাক্সিল সহ ফেনাইলামাইড are এর প্রতিরোধের মিউটেশনগুলি একটি উচ্চ ফ্রিকোয়েন্সি সহ ঘটে এবং মিউট্যান্টগুলির মধ্যে প্রতিরোধের মাত্রা খুব বেশি - এটি সংবেদনশীল স্ট্রেনকে এক হাজার বা তার বেশি বার ছাড়িয়ে যায় (ডেরেভিগিনা এট আল।, 1993)। যদিও সিস্টেমিক ছত্রাকনাশক থেকে সংবেদনশীল স্ট্রেনগুলির মৃত্যুর পটভূমির বিরুদ্ধে প্রতিরোধী মিউট্যান্সের বৃদ্ধির হার এবং আগ্রাসন হ্রাস পেয়েছে, প্রতিরোধী জনসংখ্যার সংখ্যা দ্রুত বৃদ্ধি পাচ্ছে এবং এর আগ্রাসন সমান্তরালে বৃদ্ধি পাচ্ছে। সুতরাং, ছত্রাকনাশক ব্যবহারের বেশ কয়েক বছর পরে, প্রতিরোধী স্ট্রেনের আগ্রাসন সংবেদনশীলদের আগ্রাসনকেই কেবল সমান করতে পারে না, বরং এটিকেও ছাড়িয়ে যায় (ডেরেভিগিনা, ডায়াকভ, 1992)।
যৌন পুনরুদ্ধার উপর প্রভাব
যেহেতু পি। ইনফেষ্টানস জনসংখ্যার মধ্যে এ 2 মিলনের ধরণের ঘন ঘন ঘটনাটি দেরিতে ব্লাইটের বিরুদ্ধে মেটালাক্সিলের নিবিড় ব্যবহারের সাথে মিলে যায়, তাই ধারণা করা হয়েছিল যে মেটালাক্সেল সঙ্গমের ধরণের রূপান্তরকে প্ররোচিত করে। পি। পরজীবীতে ক্লোরোনব এবং মেটালাক্সিলের ক্রিয়াকলাপে এই জাতীয় রূপান্তর পরীক্ষামূলকভাবে প্রমাণিত হয়েছিল (কো, 1994)। মেটালাক্সিলের কম ঘনত্বের সাথে একটি মাধ্যমের একটি প্যাসেজ পি এর একটি স্ট্রেন থেকে হোমোহেলিক বিচ্ছিন্নতার উত্থানের দিকে পরিচালিত করে। ইনফেষ্টানস সঙ্গমের ধরণ A1 (সাভেনকোভা এবং চেরেপনিকোভা-আনিকিনা, 2002) এর সাথে মেটালাক্সিলের সংবেদনশীল। মেটালাক্সিলের উচ্চ ঘনত্বের সাথে মিডিয়াতে পরবর্তী প্যাসেজগুলির সময়, A2 জোড় টাইপের কোনও একক বিচ্ছিন্নতাও সনাক্ত করা যায়নি, তবে, বেশিরভাগ বিচ্ছিন্নতা, যখন ওপোরসের পরিবর্তে A2 বিচ্ছিন্নতার সাথে অতিক্রম করা হয়, তখন কুৎসিত মাইসেলিয়াম সংশ্লেষ তৈরি হয়েছিল এবং জীবাণুমুক্ত ছিল। একটি প্রতিরোধী স্ট্রেনের প্যাসেজগুলি মেটালেক্সিলের একটি উচ্চ ঘনত্বের সাথে মিডিয়াতে A2 সঙ্গমের ধরণ রাখার ফলে আমরা তিনটি প্রকারের সঙ্গমের ধরণের পরিবর্তনগুলি সনাক্ত করতে পেরেছি: 1) A1 এবং A2 বিচ্ছিন্নতার সাথে পার হয়ে গেলে সম্পূর্ণ নির্বীজনতা; 2) হোমোটালিজম (একর সংস্কৃতিতে oospores গঠন); 3) A2 সঙ্গমের ধরণের A1 তে রূপান্তর। সুতরাং, মেটালাক্সিল পি। ইনফেসট্যান্স জনসংখ্যায় এবং যৌন ফলস্বরূপ, তাদের মধ্যে পুনরায় যৌন পুনর্বার ঘটনার ধরণের পরিবর্তনগুলির কারণ হতে পারে।
উদ্ভিদ পুনঃসংযোগ উপর প্রভাব
কিছু অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধের জিন হাইফাল হেটেরোকেরিয়োটাইজেশন এবং পারমাণবিক কূটনীতি (পোয়েডিনোক এবং ডায়াকভ, 1981) এর ফ্রিকোয়েন্সি বাড়িয়ে তোলে। যেমনটি আগেই উল্লেখ করা হয়েছে, পি। ইনফেষ্টানসের বিভিন্ন স্ট্রেনের সংশ্লেষের সময় হাইফাইয়ের হেটেরোকেরিয়োটাইজেশন এই ছত্রাকের মধ্যে উদ্ভিদের অসম্পূর্ণতার ঘটনার কারণে খুব কমই ঘটে। তবে কিছু অ্যান্টিবায়োটিকের বিরুদ্ধে প্রতিরোধের জিনের পার্শ্ব প্রতিক্রিয়া হতে পারে, উদ্ভিদের অসম্পূর্ণতা কাটিয়ে উঠতে প্রকাশিত। এই সম্পত্তিটির 1S-1 মিউট্যান্ট স্ট্রেপটোমাইসিন প্রতিরোধ জিনটি ছিল। ফাইটোফোথোরার ক্ষেত্রের জনসংখ্যায় এ জাতীয় মিউট্যান্টগুলির উপস্থিতি স্ট্রেনগুলির মধ্যে জিনের প্রবাহকে বাড়িয়ে তোলে এবং পুরো জনগোষ্ঠীর নতুন জাত বা ছত্রাকনাশকের সাথে অভিযোজনকে ত্বরান্বিত করতে পারে।
কিছু ছত্রাকনাশক এবং অ্যান্টিবায়োটিকগুলি মাইটোটিক পুনঃসংযোগের ফ্রিকোয়েন্সিকে প্রভাবিত করতে পারে, যা জনসংখ্যার জিনোটাইপ ফ্রিকোয়েন্সিগুলিকেও পরিবর্তন করতে পারে। বিস্তৃতভাবে ব্যবহৃত ছত্রাকনাশক বেনোমিল বিটা-টিউবুলিনের সাথে বেঁধে দেয়, এমন একটি প্রোটিন যা থেকে সাইটোস্কেলটনের মাইক্রোটিবুলগুলি নির্মিত হয় এবং এর ফলে মাইটোসিসের অ্যানাফেসে ক্রোমোজোম পৃথকীকরণের প্রক্রিয়াগুলিকে ব্যাহত করে, মাইটোটিক পুনঃসংশোধনের ফ্রিকোয়েন্সি বৃদ্ধি করে (হাসি, 1970))
এলামে ডাচ রোগের চিকিত্সার জন্য ব্যবহৃত ছত্রাকনাশক প্যারা-ফ্লুরোফেনিল্লানাইন এর একই সম্পত্তি রয়েছে। প্যারা-ফ্লুরোফেনিল্লানাইন হিটারোজাইগাস ডিপ্লোড পি ইনফ্যান্ট্যান্সে পুনর্বিবেচনার ফ্রিকোয়েন্সি বাড়িয়ে তোলে (পোইডিনোক এট আল।, 1982)।
পি। ইনফেষ্টানসের জীবনচক্রের জনসংখ্যার জিনোটাইপিক রচনায় চক্রীয় পরিবর্তন
সমীকরণীয় অঞ্চলের P. infestans এর ধ্রুপদী বিকাশ চক্রটি 4 টি পর্যায় নিয়ে গঠিত।
1) সংক্ষিপ্ত প্রজন্মের সাথে জনসংখ্যার তাত্পর্যপূর্ণ বৃদ্ধির পর্ব (পলিসাইক্লিক পর্যায়)। এই পর্বটি সাধারণত জুলাই মাসে শুরু হয় এবং 1,5-2 মাস স্থায়ী হয়।
২) অকার্যকর টিস্যুগুলির অনুপাত বা তীব্র প্রতিকূল আবহাওয়ার সূত্রপাতের কারণে তীব্র হ্রাসের কারণে জনসংখ্যা বৃদ্ধি বন্ধের পর্ব প্রাথমিক পর্যায়ে ফসল কাটার পাতার অপসারণের ক্ষেত্রগুলিতে এই পর্ব বার্ষিক চক্র থেকে বাদ পড়ে drops
3) কন্দগুলিতে শীতের শীতের পর্ব সহ, কন্দগুলির দুর্ঘটনাক্রমে সংক্রমণের কারণে জনসংখ্যার আকারে উল্লেখযোগ্য হ্রাস, তাদের মধ্যে সংক্রমণের ধীর বিকাশ, কন্দগুলির পুনরায় সংক্রমণের অনুপস্থিতি, সাধারণ স্টোরেজ শর্তে আক্রান্ত কন্দগুলি পচা এবং কুলিংয়ের কারণে ers
৪) মাটিতে এবং চারাগুলিতে ধীরে ধীরে বিকাশের পর্ব (মনোকাইক্লিক ফেজ), যাতে প্রজন্মের সময়কাল এক মাস বা তারও বেশি সময়ে পৌঁছতে পারে (মে এর শেষ দিকে - জুলাইয়ের প্রথম দিকে)। সাধারণত এই সময়ে, অসুস্থ পাতাগুলি সনাক্ত করা কঠিন, এমনকি বিশেষ পর্যবেক্ষণ সহ।
তাত্পর্যপূর্ণ জনসংখ্যা বৃদ্ধির পর্ব (পলিসাইক্লিক পর্যায়)
অসংখ্য পর্যবেক্ষণ (সাশেডটস্কায়া, কোজুবোভা, ১৯ 1969৯; বরিসেনোক, ১৯1969৯; ওশ, ১৯৯ 1969; ডায়াকভ, সুপ্রুন, ১৯৮৪; রাইবাকোভা, ডায়াকভ, ১৯৯০) এপিফাইটোটির শুরুতে দেখিয়েছিল যে, কম ভাইরুল এবং কিছুটা আক্রমণাত্মক ক্লোনগুলি প্রবণতা অর্জন করেছিল, পরবর্তীকালে আরও ভাইরাসজনিত এবং আক্রমণাত্মক দ্বারা প্রতিস্থাপন করা হয়। জনসংখ্যার আগ্রাসনের বৃদ্ধির হার বেশি, হোস্ট প্ল্যান্টের বিভিন্ন ধরণের কম প্রতিরোধী হয়।
জনসংখ্যা বৃদ্ধি পাওয়ার সাথে সাথে বাণিজ্যিক জাতগুলিতে (আর 1-আর 4) এবং নির্বাচিতভাবে নিরপেক্ষ (আর 5-আর 11) মধ্যে প্রবর্তিত নির্বাচিতভাবে গুরুত্বপূর্ণ জিনগুলির ঘনত্ব বৃদ্ধি পায়। সুতরাং, ১৯৯৩ সালে মস্কোর নিকটবর্তী জনসংখ্যায় জুলাইয়ের শেষ থেকে আগস্টের মাঝামাঝি পর্যন্ত গড় ভাইরুলেন্স 1993 থেকে 8,2 এ বৃদ্ধি পেয়েছিল এবং সবচেয়ে বড় বৃদ্ধিটি নির্বাচিতভাবে নিরপেক্ষ ভাইরুলেন্স জিন আর 9,4 (5 থেকে 31% ভাইরাসজনিত ক্লোনসের) জন্য পরিলক্ষিত হয়েছিল (স্মারনভ, 86) )।
জনসংখ্যার বৃদ্ধির হার হ্রাসের সাথে জনসংখ্যার পরজীবী ক্রিয়াকলাপ হ্রাস হয়। অতএব, হতাশাজনক বছরগুলিতে এপিফাইটোটিকের তুলনায় মোট ঘোড়দৌড়ের সংখ্যা এবং অত্যন্ত ভাইরাল বর্ণের অনুপাত উভয়ই কম (বোরিসেনোক, 1969)। দেরিতে দুর্যোগ এবং আলুর আক্রান্ততা হ্রাসের জন্য এপিফাইটোটিক আবহাওয়ার পরিস্থিতি যদি প্রতিকূল হয়ে যায় তবে অত্যন্ত ভাইরাসজনিত এবং আক্রমণাত্মক ক্লোনগুলির ঘনত্বও হ্রাস পায় (রাইবাকোভা এট আল।, 1987)।
জনসংখ্যার ভাইরুলেন্স এবং আগ্রাসনকে প্রভাবিত করে জিনগুলির ফ্রিকোয়েন্সিগুলির বৃদ্ধি মিশ্র জনসংখ্যার মধ্যে আরও ভাইরাসজনিত এবং আক্রমণাত্মক ক্লোনগুলির নির্বাচনের কারণে হতে পারে। নির্বাচনটি প্রদর্শনের জন্য, নিরপেক্ষ মিউটেশনগুলির বিশ্লেষণের জন্য একটি পদ্ধতি তৈরি করা হয়েছিল, যা খামিরের চেমোস্ট্যাট জনসংখ্যায় (অ্যাডামস এট আল।, 1985) এবং ফুসারিয়াম গ্রামিনিয়ারিয়ামে সফলভাবে ব্যবহৃত হয়েছিল (উইবি এট আল।, 1995)।
পি। ইনফেষ্টানসের ক্ষেত্রসংখ্যায় ব্লাস্টিকিডিন এস প্রতিরোধী মিউট্যান্সের ফ্রিকোয়েন্সি জনসংখ্যার আগ্রাসনের বৃদ্ধির সাথে সমান্তরালে হ্রাস পেয়েছে, যা জনসংখ্যার বৃদ্ধির সময় প্রভাবশালী ক্লোনগুলির পরিবর্তনের ইঙ্গিত দেয় (রাইবাকোভা এট আল।, 1987)।
কন্দগুলিতে শীতের পর্ব phase
আলু কন্দগুলিতে শীতকালীন সময়ে, পি। ইনফেসট্যান্সের স্ট্রোনগুলির ভাইরালেন্স এবং আগ্রাসন হ্রাস পায় এবং ভাইরুলেন্স হ্রাস আগ্রাসনের চেয়ে ধীরে ধীরে ঘটে (রাইবাকোভা এবং ডায়াকভ, 1990)। স্পষ্টতই, জনসংখ্যার দ্রুত বর্ধনের জন্য উপযুক্ত পরিস্থিতিতে (আর-সিলেকশন), "অতিরিক্ত" ভাইরুলেন্স জিন এবং উচ্চ আগ্রাসন দরকারী, অতএব এপিফাইটোটিকের বিকাশ সর্বাধিক ভাইরাসজনিত এবং আক্রমণাত্মক ক্লোনগুলির নির্বাচনের সাথে রয়েছে। পরিবেশের পরিপূর্ণতার শর্তে, যখন প্রজননের হার নয়, তবে প্রতিকূল পরিস্থিতিতে (কে-নির্বাচন) অস্তিত্বের অধ্যবসায় একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে, ভাইরাস এবং আগ্রাসনের "অতিরিক্ত" জিনগুলি ফিটনেস হ্রাস করে, এবং এই জিনগুলির সাথে ক্লোনগুলি প্রথম মারা যায়, যাতে গড় আগ্রাসন হয় এবং জনসংখ্যার ভারসাম্যতা হ্রাস পাচ্ছে।
মাটিতে উদ্ভিদের পর্ব
এই পর্বটি জীবনচক্রের সবচেয়ে রহস্যময় (অ্যান্ড্রিভন, 1995)। এর অস্তিত্ব বিশুদ্ধভাবে অনুমানমূলকভাবে অঙ্কিত হয় - দীর্ঘ সময়ের (কখনও কখনও এক মাসেরও বেশি সময় ধরে) প্যাথোজেনের কী ঘটে যায় সে সম্পর্কে তথ্যের অভাবের কারণে - আলুর চারাগুলির উদ্ভব থেকে শুরু করে রোগের প্রথম দাগগুলির উপস্থিতি পর্যন্ত। পর্যবেক্ষণ এবং পরীক্ষা-নিরীক্ষার ভিত্তিতে, জীবনের এই সময়কালে ছত্রাকের আচরণ পুনর্গঠন করা হয়েছিল (হিস্ট এবং স্টেডম্যান, 1960; বোগুস্লাভস্কায়া, ফিলিপভ, 1976)।
ছত্রাকের স্প্রোলুলেশন মাটিতে সংক্রামিত কন্দগুলিতে গঠন করতে পারে। ফলস্বরূপ বীজগুলি হাইফাই দিয়ে অঙ্কুরিত হয়, যা মাটিতে দীর্ঘ সময়ের জন্য উদ্ভিদ হতে পারে। প্রাথমিক (কন্দের উপর গঠিত) এবং গৌণ (মাটিতে মাইসেলিয়ামে) বীজঘটিত কৈশিক স্রোত দ্বারা মাটির পৃষ্ঠে উত্থিত হয় তবে নীচের পাতাগুলি নেমে যাওয়ার পরে এবং মাটির পৃষ্ঠের সংস্পর্শে আসার পরেই আলুগুলিকে সংক্রামিত করার ক্ষমতা অর্জন করে। এই জাতীয় পাতা (যথা, রোগের প্রথম দাগগুলি তাদের উপর পাওয়া যায়) অবিলম্বে গঠিত হয় না, তবে দীর্ঘায়িত বৃদ্ধি এবং আলুর টপের বিকাশের পরে।
সুতরাং, সাফোট্রফিক উদ্ভিদ পর্বটিও পি। ইনফেষ্টানসের জীবনচক্রের মধ্যে থাকতে পারে। যদি জীবনচক্রের পরজীবী পর্যায়ে আক্রমণাত্মকতা ফিটনেসের সর্বাধিক গুরুত্বপূর্ণ উপাদান হয় তবে সপ্রোট্রফিক পর্যায়ে নির্বাচন পরজীবী বৈশিষ্ট্য হ্রাস করার লক্ষ্যে করা হয়, যেমন পরীক্ষামূলকভাবে কিছু ফাইটোপ্যাথোজেনিক ছত্রাকের জন্য দেখানো হয় (দেখুন কার্সন, 1993)। সুতরাং, চক্রের এই পর্যায়ে, আক্রমণাত্মক বৈশিষ্ট্যগুলি সবচেয়ে নিবিড়ভাবে হারাতে হবে। তবে এখনও পর্যন্ত উপরোক্ত অনুমানগুলি নিশ্চিত করার জন্য কোনও সরাসরি পরীক্ষা-নিরীক্ষা করা হয়নি।
Seতুগত পরিবর্তনগুলি কেবল পি ইনফেসট্যান্সের প্যাথোজেনিক বৈশিষ্ট্যগুলিকেই প্রভাবিত করে না, তবে ছত্রাকজনিত প্রতিরোধেরও প্রতিরোধ করে, যা পলিসাইক্লিক পর্যায়ে বৃদ্ধি পায় (এপিফাইটোটিসের সময়), এবং শীতকালীন সঞ্চয়ের সময় হ্রাস পায় (ডেরেভিগিনা এট আল, 1991; কাদিশ এবং কোহেন, 1992)। প্রভাবিত কন্দ রোপণ এবং ক্ষেতে রোগের প্রথম দাগগুলির উপস্থিতির মধ্যে ধাতবক্ষার প্রতিরোধের একটি বিশেষ তীব্র হ্রাস লক্ষ্য করা গেছে।
অন্তঃসত্ত্বা বিশেষকরণ এবং এর বিবর্তন
পি। ইনফ্যান্ট্যানস বাণিজ্যিকভাবে গুরুত্বপূর্ণ দুটি ফসল, আলু এবং টমেটোতে মহামারী সৃষ্টি করছে। আলুর উপর এপিফিটোটিজগুলি ছত্রাকের নতুন অঞ্চলে প্রবেশের সাথে সাথেই শুরু হয়েছিল। টমেটোতে পরাজয়ের বিষয়টি আলুতে সংক্রমণের উপস্থিতির অল্প সময়ের পরেও লক্ষ করা গিয়েছিল, তবে টমেটোতে এপিফাইটোটিগুলি কেবল একশো বছর পরে লক্ষ করা গেছে - XNUMX শতকের মাঝামাঝি সময়ে। মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে টমেটো পরাজয়ের বিষয়ে হ্যালিগলি এবং নিডারহাউজার কী লিখেছেন তা এখানে
(১৯1962২): “১৮৪৪ সালের মারাত্মক এপিফিটোটির প্রায় 100 বছর পরেও প্রতিরোধী জাতের টমেটো পাওয়ার জন্য খুব কম বা প্রায় কোনও চেষ্টা করা হয়নি। যদিও দেরীতে দৌড়ঝাঁপ প্রথম প্রথম টমেটোতে রেকর্ড করা হয়েছিল 1845 সালের পরে, 1848 সালে এই রোগের প্রবল প্রকোপ না হওয়া পর্যন্ত এটি এই উদ্ভিদে ব্রিডারদের গুরুতর মনোযোগ দেওয়ার বিষয় হয়ে ওঠে নি। রাশিয়ার ভূখণ্ডে টমেটোর দেরিতে অন্ধকার 1946 শতকে নিবন্ধিত হয়েছিল। “দীর্ঘকাল ধরে গবেষকরা এই রোগের দিকে মনোযোগ দেননি, কারণ এটি উল্লেখযোগ্য অর্থনৈতিক ক্ষতি করে না। তবে 60 এবং 70 এর দশকে। টমেটোর উপর দেরীতে ব্লাথের এক্সএক্স শতাব্দীর এপিফিটোটিসগুলি সোভিয়েত ইউনিয়নেও দেখা যায়, মূলত নিম্ন ইউরোপের ইউক্রেন, উত্তর ককেশাস, মলদোভাতে ... "(বালশোভা, 1979) XNUMX
সেই থেকে দেরিতে দুর্যোগে টমেটো ঝাঁকুনি বার্ষিক হয়ে উঠেছে, পুরো শিল্প ও বাড়ির আবাদে ছড়িয়ে পড়ে এবং এই ফসলের ব্যাপক অর্থনৈতিক ক্ষতি সাধন করে। কি হলো? কেন আলুতে পরজীবীর প্রথম উপস্থিতি এবং এই ফসলের এপিফাইটোটিক ক্ষত প্রায় একই সাথে ঘটেছিল এবং কেন টমেটোতে এপিফাইটোটিক প্রদর্শিত হতে এক শতাব্দী লাগল? এই পার্থক্যগুলি দক্ষিণ আমেরিকার সংক্রমণের উত্সের চেয়ে মেক্সিকানকে সমর্থন করে। ফাইটোফোথোরা ইনফেষ্টানস প্রজাতি যদি সোলানাম জাতের মেক্সিকান কন্দ বহনকারী প্রজাতির পরজীবী হিসাবে গঠন করে, তবে এটি বোধগম্য যে মেক্সিকান প্রজাতির একই বংশের অন্তর্গত আলুর চাষ করা কেন এতটা প্রবলভাবে প্রভাবিত হয়েছিল, তবে পরজীবীর সাথে সহ-বিবর্তনের অভাবের কারণে, যা নির্দিষ্ট এবং অদ্বিতীয় প্রতিরোধের প্রক্রিয়া বিকাশ করে না।
টমেটো জিনের একটি আলাদা বিভাগের অন্তর্গত, এর বিনিময়ের ধরণের টিউবারাস প্রজাতির সাথে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য রয়েছে, তাই টমেটো পি। ইনফেষ্টানসের খাদ্য বিশেষজ্ঞের বাইরে না থাকা সত্ত্বেও, এর ক্ষতির তীব্রতা গুরুতর অর্থনৈতিক ক্ষতির জন্য অপর্যাপ্ত ছিল।
একটি টমেটোতে এপিফাইটোটিজের উত্থান পরজীবীর গুরুতর জিনগত পরিবর্তনের কারণে ঘটে যা পরজীবীতার সময় তার ফিটনেস (প্যাথোজেনসিটি) বৃদ্ধি করে। আমরা বিশ্বাস করি যে টমেটোকে পরজীবীকরণের জন্য বিশেষভাবে তৈরি নতুন ফর্মটি এম গ্যালগালি বর্ণিত টি 1 রেস, বিভিন্ন জাতের চেরি টমেটোকে প্রভাবিত করে (রেড চেরি, অটোয়া), আলুতে বিস্তৃত টি 0 প্রতিযোগিতার বিরুদ্ধে প্রতিরোধী (গ্যালিলি, 1952)। স্পষ্টতই, একটি রূপান্তর (বা রূপান্তরগুলির একটি সিরিজ) যা টি 0 রেসকে টি 1 রেসে পরিণত করে এবং টমেটোর পরাজয়ের সাথে অত্যন্ত অনুকূলভাবে ক্লোনগুলির উপস্থিতির দিকে পরিচালিত করে। প্রায়শই ঘটে থাকে, এক হোস্টের প্যাথোজেনিসিটি বৃদ্ধির সাথে সাথে তার অন্যটির হ্রাস ঘটে, যা একটি প্রাথমিক, এখনও সম্পূর্ণ নয় আন্তঃস্পেশীয় বিশেষীকরণ তৈরি হয়েছিল - আলু (রেস টি0) এবং টমেটোতে (রেস টি 1)।
এই অনুমানের প্রমাণ কী?
- আলু এবং টমেটো উপর ঘটনা। টমেটো পাতায়, টি 1 জাতিটি প্রাধান্য পায়, তবে আলুর পাতায় এটি বিরল। এসএফ.বাগিরোভা এবং টি.এ. অনুসারে 1991-1992 সালে মস্কো অঞ্চলে ওরেশঙ্কোভা (অপ্রকাশিত), আলু গাছের গাছের মধ্যে টি 1 রেসের ঘটনা ছিল 0%, এবং টমেটো রোপণের ক্ষেত্রে - 100%; 1993-1995 - যথাক্রমে 33% এবং 90%; 2001 - 0% এবং 67%। অনুরূপ তথ্য ইস্রায়েলে প্রাপ্ত হয়েছিল (কোহেন, 2002)। টি -1 রেসের আইসোলেট এবং আলোর টি 0 এবং টি 1 এর মিশ্রণের সাথে আলু কন্দ সংক্রমণের পরীক্ষা-নিরীক্ষায় দেখা গেছে যে টি 1 জাতির বিচ্ছিন্ন কন্দগুলি সংরক্ষণ করা হয় এবং টি 0 রেসের বিচ্ছিন্নতা দ্বারা প্রতিস্থাপিত হয় (ডায়াকভ এট আল।, 1975; রাইবাকোভা, 1988)।
2) টমেটো রোপণের টি 1 রেসের গতিশীলতা। টমেটো পাতার প্রাথমিক সংক্রমণটি টি ২০ জাতির বিচ্ছিন্নতা দ্বারা পরিচালিত হয়, যা পাতায় গঠিত প্রথম দাগগুলিতে সংক্রমণের বিশ্লেষণে প্রাধান্য পায়। এটি পরজীবী মাইগ্রেশনের সাধারণভাবে গৃহীত স্কিমটিকে নিশ্চিত করে: আলু থেকে সংক্রমণের প্রধান ভরটি টি 0 রেস দ্বারা তৈরি করা হয়, তবে, টমেটোতে একবার আলুতে সংরক্ষিত অল্প সংখ্যক টি 0 ক্লোন টি, টি 1 রেস স্থানচ্যুত করে এবং এপিফাইটোটিক পিরিয়ডের শেষের দিকে জমা হয়। এটিও সম্ভব যে টি 0 রেসের সাথে টমেটো পাতার সংক্রমণের বিকল্প উত্স রয়েছে, যা আলুর কন্দ এবং পাতার মতো শক্তিশালী নয়, তবে ধ্রুবক। সুতরাং, এই উত্সটি টমেটোতে সংক্রামিত জনসংখ্যার জেনেটিক কাঠামোর উপর একটি দুর্বল প্রভাব ফেলেছে, তবে পরবর্তীকালে টি 1 রেসের জমে নির্ধারণ করে (রাইবাকোভা, 1; ডায়াকভ এট আল।, 1988)।
3) আলু এবং টমেটো আক্রমণাত্মকতা। টি-টো ও টি -0 রেসের বিচ্ছিন্নতা সহ টমেটো এবং আলুর পাতার কৃত্রিম সংক্রমণে দেখা গেছে যে টমেটোগুলির তুলনায় পূর্বেররা আলুর চেয়ে বেশি আক্রমণাত্মক এবং আলুর চেয়ে টমেটোর চেয়ে বেশি আক্রমণাত্মক। এই পার্থক্যগুলি গ্রিনহাউসে (ডায়াকভ এট আল।, 1) পাতাগুলি চলাকালীন মিশ্র জনগোষ্ঠীর একটি অ-"নিজস্ব" বর্ণের বিচ্ছিন্নতা এবং ক্ষেত্র প্লটগুলিতে (লেবারটন এট আল।, 1975) উদ্ভাসিত হয়; ন্যূনতম সংক্রামক লোড, বিলম্বের সময়কাল, সংক্রামক দাগগুলির আকার এবং বীজ উত্পাদনের পার্থক্য (রাইবাকোভা, 1999; ডায়াকভ এট আল।, 1988; লেগার্ড এট আল।, 1994; ফোর্বস এট আল, 1995; ওয়ারজুন এট আল, 1997; লেবারটন এট আল।) আল।, 1998; ভেগা-সানচেজ এট।, 1999; ন্যাপোভা, গিসি, 2000; সুসুনা এট আল।, 2002)।
টিনো জাতের প্রতিরোধ জিনের ঘাটতিতে টি -২ জাতের বিচ্ছিন্নতার আক্রমণাত্মকতা এত বেশি যে সংক্রামক টিস্যুগুলিকে নেক্রোটাইজ না করে পুষ্টির মাধ্যমের মতো পাতায় এই বিচ্ছিন্ন বিস্ফোরণ ঘটে (ডায়াকভ এট আল।, 1; ভেগা-সানচেজ এট আল।, 1975)।
4) আলু এবং টমেটো জন্য ভাইরাস। টি 1 রেস পিএইচ 1 প্রতিরোধের জিনের সাথে চেরি টমেটো জাতগুলিকে প্রভাবিত করে, অন্যদিকে T0 জাতি এই জাতগুলি সংক্রামিত করতে সক্ষম নয়, অর্থাৎ। একটি সংকীর্ণ ভাইরাস আছে। ডিফারেন্টিটারদের সাথে সম্পর্কিত
আলুর আর-জিনগুলি বিপরীতভাবে সম্পর্কিত, যেমন। টমেটো পাতা থেকে বিচ্ছিন্ন স্ট্রেনগুলি "আলু" স্ট্রেনের তুলনায় কম ভাইরুল (টেবিল 11)।
5) নিরপেক্ষ চিহ্নিতকারী। আলু এবং টমেটোতে প্যারিসাইটিসিং পি-ইনফ্যান্ট্যান্সের জনসংখ্যার মধ্যে নিরপেক্ষ চিহ্নিতকারীগুলির বিশ্লেষণটি বহুমাত্রিক আন্তঃনির্ধারণের নির্বাচনের সাক্ষ্য দেয়। ব্রাজিলিয়ান জনসংখ্যার পি। ইনফেষ্টানসে টমেটো পাতার বিচ্ছিন্নতাগুলি ক্লোনাল লাইনের US-1 এর অন্তর্ভুক্ত ছিল এবং আলুর পাতা থেকে বিআর -1 লাইনের অন্তর্ভুক্ত ছিল (সুসুনা এট আল। 2004)। ফ্লোরিডায় (ইউএসএ) ১৯৯৪ সাল থেকে মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে আটটি আলুর উপর আধিপত্য বিস্তার করতে শুরু করে (1994% এরও বেশি সংঘটিত হওয়ার সাথে), এবং টমেটোতে ইউএস -90 এবং ইউএস -8 ক্লোন হয়ে যায় এবং পরবর্তীকালের বিচ্ছিন্নতাগুলি আলুর চেয়ে টমেটের চেয়ে বেশি আক্রমণাত্মক হয় (উইংগার্টনার , টমবোলাতো, 11)। আলু এবং টমেটো বিচ্ছিন্নতায় জিনোটাইপ ফ্রিকোয়েন্সিগুলির (ডিএনএ ফিঙ্গারপ্রিন্ট) উল্লেখযোগ্য পার্থক্য প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল ১৯৮৯ থেকে ১৯৯৯ সাল পর্যন্ত মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে সংগ্রহ করা ইনফেষ্টান স্ট্রেনগুলি (ডহেল এট আল।, 17)।
এএফএলপি পদ্ধতিটি ব্যবহার করে 74-1996 সালে আলু এবং টমেটো পাতা থেকে সংগ্রহ করা 1997 টি স্ট্রেন পৃথক করা সম্ভব হয়েছিল separate ফ্রান্স এবং সুইজারল্যান্ডে, 7 গ্রুপে। আলু এবং টমেটো স্ট্রেনগুলি স্পষ্টভাবে পৃথক ছিল না, তবে "আলু" স্ট্রেনগুলি "টমেটো" এর চেয়ে জিনগতভাবে আরও বৈচিত্র্যময় ছিল। পূর্ববর্তীগুলি সাতটি ক্লাস্টারে এবং পরবর্তীগুলি কেবল চারটিতে পাওয়া গিয়েছিল, যা পরবর্তীগুলির আরও বিশেষ জিনোম নির্দেশ করে (ন্যাপোভা এবং গিসি, ২০০২)।
6) বিচ্ছিন্নকরণের প্রক্রিয়া। যদি দুটি হোস্ট উদ্ভিদ প্রজাতির পরজীবীর জনসংখ্যা তাদের "নিজস্ব" হোস্টের কাছে বিশেষজ্ঞের সংকীর্ণকরণের দিকে বিকশিত হয়, তবে বিভিন্ন প্রাক-পোস্টমায়োটিক প্রক্রিয়া দেখা দেয় যা আন্তঃ জনসংখ্যা জেনেটিক এক্সচেঞ্জগুলি রোধ করে (ডায়াকভ এবং লেকোমটসেভা, 1984)।
বেশ কয়েকটি গবেষণায় সংকরনের দক্ষতার উপর পিতামাতার স্ট্রেনগুলির উত্সের প্রভাব অনুসন্ধান করা হয়েছে। ইকুয়েডরের সোলানাম গোত্রের বিভিন্ন প্রজাতি (অলিভা এট আল।, ২০০২) থেকে বিচ্ছিন্ন হয়ে স্ট্রেনগুলি পার করার সময় দেখা গেল যে বন্য সোলানাসেই (ক্লোনাল লাইন ইসি -২) থেকে প্রজনন টাইপ এ 2002 সহ স্ট্রেনগুলি টমেটো (লাইনের ইসি) দ্বারা স্ট্রেনের সাথে সবচেয়ে খারাপভাবে পেরিয়ে গেছে crossed -2), এবং সবচেয়ে কার্যকরভাবে আলুর স্ট্রেন (ইসি -2) দিয়ে অতিক্রম করেছেন।
সমস্ত হাইব্রিড নন-প্যাথোজেনিক হিসাবে পাওয়া গেছে। লেখকরা বিশ্বাস করেন যে হাইব্রিডাইজেশনের কম শতাংশ এবং সংকর ক্ষেত্রে প্যাথোজেনসিটি হ্রাস হ'ল জনসংখ্যার প্রজনন বিচ্ছিন্নতার পোস্টমিওটিক প্রক্রিয়াগুলির কারণে।
বাগিরোভা এট আল (১৯৯৯) এর পরীক্ষাগুলিতে, বিপুল সংখ্যক আলু এবং টমেটো স্ট্রেনকে T1998 এবং T0 রেসের বৈশিষ্ট্যগুলি সহ অতিক্রম করা হয়েছিল। টমেটো থেকে বিচ্ছিন্ন T1xT1 স্ট্রেনের অত্যন্ত উচ্চ উর্বর ক্রসগুলি (মাইক্রোস্কোপ ক্ষেত্রের 1 টি স্পষ্টরূপে, oospore অঙ্কুরোদয়ের 36%), সবচেয়ে কম কার্যকর ছিল বিভিন্ন হোস্ট থেকে বিচ্ছিন্ন T44xT0 রেসের ক্রস (একটি কম সংখ্যক বিকাশশীল এবং অঙ্কুরিত আউটস্পোরস, একটি উচ্চ অনুপাতের গর্ভপাত এবং অনুন্নত) ... আলু থেকে বিচ্ছিন্ন টি ২০ জাতির বিচ্ছিন্নতার মধ্যে ক্রস করার দক্ষতা ছিল মধ্যবর্তী। যেহেতু টি ২০ জাতির স্ট্রেনের প্রধান শরীর আলুগুলিকে প্রভাবিত করে, এটি শীতকালীন একটি নির্ভরযোগ্য উত্স রয়েছে - আলু কন্দ, ফলস্বরূপ আলুর জনসংখ্যার জন্য শীতকালীন সংক্রামক ইউনিট হিসাবে শীতকালে শীতকালীন অস্টোরসের গুরুত্ব কম। অভিযোজিত "টমেটো ফর্ম" অস্টোরসের আকারে (নীচে দেখুন) টমেটোতে শীতে সক্ষম হয় এবং তাই যৌন প্রক্রিয়ার উচ্চ উত্পাদনশীলতা ধরে রাখে। উচ্চ উর্বরতার কারণে, টি 1 টমেটোতে প্রাথমিক সংক্রমণের জন্য একটি স্বাধীন সম্ভাবনা অর্জন করে। ন্যাপোভা এট আল দ্বারা প্রাপ্ত ফলাফলগুলি (ন্যাপোয়া এট আল।, ২০০২) একইভাবে ব্যাখ্যা করা যেতে পারে। টমেটো থেকে স্ট্রেনের সাহায্যে আলু থেকে বিচ্ছিন্ন স্ট্রেনগুলির ক্রসগুলি সর্বাধিক সংখ্যক oospores দিয়েছে - প্রতি বর্গ মিমি প্রতি 0। মাঝারি (0-1 ছড়িয়ে ছড়িয়ে) এবং oospores এর অঙ্কুর মধ্যবর্তী শতাংশ (2002-13,8 এর বিস্তার সহ 5) spread টমেটো থেকে বিচ্ছিন্ন স্ট্রেনের ক্রসিংগুলি অঙ্কুরোদগমের সর্বাধিক শতাংশের সাথে (১০.৮) ওসপোরের সর্বনিম্ন শতাংশ (৪-১২ ছড়িয়ে ছড়িয়ে 19..6,3) দেয়। আলু থেকে বিচ্ছিন্ন স্ট্রেনের মধ্যবর্তী ক্রসগুলি মধ্যবর্তী সংখ্যার ওপসোরগুলিকে দেয় (0 উপাত্তের উচ্চ বিক্ষোভ সহ - 24-7,6) এবং ওসপোরের অঙ্কুরোদগমের সর্বনিম্ন শতাংশ (4) দেয়। সুতরাং, আলু থেকে স্ট্রেনগুলি টমেটো থেকে কম উর্বর, তবে আন্তঃ জনসংখ্যা ক্রসগুলি আন্তঃ জনসংখ্যার চেয়ে খারাপ ফল দেয় না। এটি সম্ভব যে বাগিরোভা এট আল দ্বারা উপরের ডেটাগুলির সাথে পার্থক্যগুলি। বিংশ শতাব্দীর 12 এর দশকের গোড়ার দিকে রাশিয়ান গবেষকরা বিচ্ছিন্নভাবে স্ট্রেনের সাথে কাজ করেছিলেন এবং সুইস গবেষকরা - 10,8 এর দশকের শেষভাগে বিচ্ছিন্নভাবে এগুলি দিয়ে ব্যাখ্যা করেছিলেন।
কম উর্বরতার ভিত্তিগুলি স্ট্রেনগুলির হেটেরোপ্লয়েডি হতে পারে। যদি মেক্সিকান জনগোষ্ঠীতে, যেখানে ওসপোর বংশোদ্ভূত যৌন প্রক্রিয়া এবং প্রাথমিক সংক্রমণ নিয়মিত হয়, পি ইনফেসট্যান্সের বেশিরভাগ অধ্যয়নিত স্ট্রাইপ ডিপ্লোড হয়, তবে ওল্ড ওয়ার্ল্ডের ইনট্রপপুলেশন পলিমার্ফিজমের দেশগুলিতে পর্যবেক্ষণ করা হয় (ডিআই, ট্রাই এবং টেট্রাপ্লোয়েড স্ট্রেন, পাশাপাশি হিটারোপ্লোটিক নিউক্লিয়াসহ হেটেরোকারোটিক স্ট্রেন) , এবং স্ট্রেনগুলির বিভিন্ন ধরণের সঙ্গম রয়েছে, যেমন। পারস্পরিক উর্বর, পারমাণবিক চালচলন থেকে পৃথক (থেরিয়েন এট আল।, 1989, 1990; হুইটকার এট আল।, 1992; রিচ, ড্যাজেট, 1995)। অ্যানথেরিডিয়া এবং ওগোনিয়ায় নিউক্লিয়াসের বৈচিত্র্য কম উর্বরতার কারণ হতে পারে।
অ্যানাস্টোমোসের সময় হাইফাইয়ের মধ্যে পারমাণবিক আদান-প্রদানের ক্ষেত্রে, এটি উদ্ভিদীয় বেমানানতার দ্বারা প্রতিরোধ করা হয়, যা বিভিন্ন জিনগতভাবে বিচ্ছিন্ন ক্লোন (পয়েডিনোক এবং ডায়াকভ, 1987; গোরবুনোভা এট আল।, 1989; আনিকিনা এট আল।, 1997 বি) তে বিচ্ছিন্ন হয়ে থাকে।
7) জনসংখ্যার একত্রিতকরণ। উপরের তথ্যগুলি ইঙ্গিত দেয় যে "আলু" এবং "টমেটো" পি। ইনফেষ্টান স্ট্রেনের মধ্যে সংকরকরণ সম্ভব। হ্রাস আগ্রাসন সত্ত্বেও, বিভিন্ন হোস্টের পারস্পরিক পুনরায় সংক্রমণও সম্ভব।
১৯৯৩ সালে সংলগ্ন আলু এবং টমেটো ক্ষেত থেকে বিচ্ছিন্ন জনসংখ্যা চিহ্নিতকারীদের একটি সমীক্ষায় দেখা গেছে যে টমেটো পাতা থেকে বিচ্ছিন্ন প্রায় এক-চতুর্থাংশ প্রতিবেশী আলুর ক্ষেত (ডলগোভা এট আল।, ১৯৯)) থেকে স্থানান্তরিত হয়েছিল। তাত্ত্বিকভাবে, এটি ধরে নেওয়া যেতে পারে যে দুটি হোস্টের জনসংখ্যার বিস্তৃতি বৃদ্ধি পাবে এবং বিশেষায়িত আন্তঃ স্পেসিফিক ফর্মগুলির উত্থান ঘটবে (বিশেষতঃ আলু এবং এফএসপি টমেটো), বিশেষত যেহেতু অস্পোরস গাছের ধ্বংসস্তূপে স্থির থাকতে পারে (ড্রেন্ট এট আল। 1993) ; বাগিরোভা, ডায়াকভ, 1997) এবং টমেটো বীজ (রুবিন এট আল।, 1995)। ফলস্বরূপ, টমেটোতে বর্তমানে আলুর কন্দ ব্যতীত বসন্ত পুনর্জন্মের উত্স রয়েছে।
যাইহোক, সবকিছু ভিন্নভাবে ঘটেছিল। ওসপোরস দিয়ে ওভারউইনটারিং পরজীবীকে তার জীবনচক্রের সংকীর্ণ পর্যায়ে এড়াতে দেয় - মাটিতে উদ্ভিদের মনোকাইক্লিক পর্যায়, যার সময় পরজীবী বৈশিষ্ট্য হ্রাস পায়, যা গ্রীষ্মের পলিসাইক্লিক পর্যায়ে ধীরে ধীরে পুনরুদ্ধার করা হয়।
সারণী ১১। পি। ইনফ্যান্ট্যানস স্ট্রেনগুলিতে আলুর ডিফারিয়েটার জাতগুলিতে ভাইরালেন্স জিনের ফ্রিকোয়েন্সি
দেশ | বছর | স্ট্রাইনে ভাইরুলেন্স জিনের গড় সংখ্যা | লেখক | |
আলু থেকে | টমেটো থেকে | |||
ফ্রান্স | 1995 | 4.4 | 3.3 | লেবারটন এট আল।, 1999 |
1996 | 4.8 | 3.6 | লেবারটন, অ্যান্ড্রিভন, 1998 | |
ফ্রান্স, সুইজারল্যান্ড | 1996-97 | 6.8 | 2.9 | ন্যাপোয়া, গিসি, 2002 |
মার্কিন যুক্তরাষ্ট্র | 1989-94 | 5 | 4.8 | গুডউইন এট আল।, 1995 |
মার্কিন যুক্তরাষ্ট্র, জ্যাপ ওয়াশিংটন | 1996 | 4.6 | 5 | Dorrance et al।, 1999 |
1997 | 6.3 | 3.5 | " | |
ইকোয়াডর | 1993-95 | 7.1 | 1.3 | ওয়ারজুন এট।, 1998 |
ইসরাইল | 1998 | 7 | 4.8 | কোহেন, 2002 |
1999 | 6 | 5.7 | " | |
2000 | 6.7 | 6.1 | " | |
রাশিয়া, মোসক। অঞ্চল | 1993 | 8.9 | 6.7 | স্মিমনভ, 1996 |
রাশিয়া, বিভিন্ন অঞ্চল | 1995 | 9.4 | 8 | কোজলভস্কায়া এবং অন্যরা। |
1997 | 9.2 | 9.2 | " | |
2000 | 8.7 | 4.8 | " |
প্রাথমিক চিড়িয়াখানা এবং চিড়িয়াখানা, যা ওসপোরগুলি অঙ্কুরিত করে, উচ্চ মাত্রায় পরজীবী ক্রিয়াকলাপ থাকে, বিশেষত যদি ওসপোরগুলি বিপরীত প্রকারের সঙ্গমের সাথে স্ট্রেনের ফেরোমোনসের প্রভাবের অধীনে পার্থেনোজেনেটিকভাবে গঠিত হয়। সুতরাং, ওসপোরসে সংক্রামিত বীজ থেকে বেড়ে ওঠা টমেটো চারাতে সংক্রামক উপাদান টমেটো এবং আলু উভয়েরই জন্য অত্যন্ত প্যাথোজেনিক।
এই পরিবর্তনগুলি অন্য জনসংখ্যার পুনর্গঠনের দিকে পরিচালিত করে, মহামারী সংক্রান্ত দৃষ্টিকোণ থেকে নিম্নলিখিত গুরুত্বপূর্ণ পরিবর্তনগুলিতে প্রকাশিত:
- সংক্রামিত টমেটো চারা আলুর প্রাথমিক সংক্রমণের একটি গুরুত্বপূর্ণ উত্স হয়ে উঠেছে (ফিলিপোভ, ইভান্যুক, ব্যক্তিগত বার্তা)।
- স্বাভাবিকের থেকে প্রায় এক মাস আগে জুনের শুরুতেই আলুর উপর এপিফিটোটিজ লক্ষ্য করা শুরু হয়েছিল।
- আলু রোপণগুলিতে, টি 1 রেসের শতাংশ বেড়েছে, যা আগে সেখানে একটি তুচ্ছ পরিমাণে পাওয়া গিয়েছিল (উলানোয়া এট আল।, 2003)।
- টমেটোর পাতাগুলি থেকে বিচ্ছিন্ন স্ট্রেনগুলি ভাইরুলেন্স জিনের আলু ডিফারেন্টেটরগুলির মধ্যে ভাইরালনে আলুর স্ট্রেনের চেয়ে আলাদা হয়ে গিয়েছিল এবং আক্রমণাত্মকতায় "আলু" স্ট্রেনকে ছাড়িয়ে যেতে শুরু করেছে কেবল টমেটো নয়, আলুতেও (ল্যাভ্রোভা এট আল।, 2003; ইউলানোয়া এট আল। , 2003)।
সুতরাং, পরিবর্তনের পরিবর্তে, জনসংখ্যার একত্রিতকরণ হয়েছিল, দুটি হোস্ট গাছের উদ্ভিদে উচ্চ ভাইরালেন্স এবং উভয় প্রজাতির আগ্রাসন সহ একক জনগোষ্ঠীর উত্থান হয়েছিল।
উপসংহার
সুতরাং, পি। ইনফেষ্টানসের প্রায় দেড় শতাধিক নিবিড় অধ্যয়ন সত্ত্বেও, জমিযুক্ত সোলানাসাস উদ্ভিদের সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ রোগগুলির এই কার্যকারক এজেন্টের জনসংখ্যা জীববিদ্যা সহ জীববিজ্ঞানে, অনেক কিছুই অজানা রয়েছে। এটি স্পষ্ট নয় যে কীভাবে জীবনচক্রের পৃথক পর্যায় অতিক্রম করে জনসংখ্যার কাঠামোকে প্রভাবিত করে, আগ্রাসন এবং ভাইরুলেন্সের নালীযুক্ত পরিবর্তনশীলতার জিনগত পদ্ধতিগুলি কী কী, প্রাকৃতিক জনগোষ্ঠীতে প্রজনন ও ক্লোনাল সিস্টেমের অনুপাত কীভাবে, উদ্ভিদ অসামঞ্জস্যতা কীভাবে বংশগত হয়, এই ফসলের প্রাথমিক সংক্রমণে আলু এবং টমেটোর ভূমিকা কী? পরজীবীর জনসংখ্যা কাঠামোতে তাদের কী প্রভাব রয়েছে। এখন অবধি, পরজীবীর আগ্রাসন পরিবর্তন করার জন্য জেনেটিক প্রক্রিয়া বা অনাদায়ী আলুর প্রতিরোধের ক্ষয়ের সমাধানের মতো গুরুত্বপূর্ণ ব্যবহারিক সমস্যাগুলির সমাধান হয়নি। আলু দেরিতে ব্লাইটের উপর গবেষণা আরও গভীরতর এবং প্রসারণের সাথে পরজীবী গবেষকদের কাছে নতুন চ্যালেঞ্জ তৈরি করেছে। যাইহোক, পরীক্ষামূলক ক্ষমতাগুলির উন্নতি, জিন এবং প্রোটিনগুলির সাথে কারসাজি করার জন্য নতুন পদ্ধতিগত পদ্ধতির উত্থান আমাদের উত্থাপিত প্রশ্নের সফল সমাধানের জন্য আশা করতে দেয় to
নিবন্ধটি "আলু সুরক্ষা" জার্নালে প্রকাশিত হয়েছিল (নং 3, 2017)